Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3F1

Putative TAP2-associated 6.5 kDa polypeptide, humanhuman

Predictions only

Length 56 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9Y3F1 SPATA7-203ENST00000393545 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Q9Y3F1 ETV4-203ENST00000538265 2147 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Q9Y3F1 AC009474.1-201ENST00000455096 1565 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Q9Y3F1 PPP3CA-202ENST00000394853 3604 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Q9Y3F1 ATF3-202ENST00000341491 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Q9Y3F1 GPR37-201ENST00000303921 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Q9Y3F1 RTEL1-205ENST00000370018 4955 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Q9Y3F1 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Q9Y3F1 WNT8A-202ENST00000398754 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Q9Y3F1 CYP2B7P-201ENST00000541697 1476 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Q9Y3F1 PSD-209ENST00000611678 3382 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Q9Y3F1 PSEN2-202ENST00000366783 2306 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Q9Y3F1 AC005519.2-201ENST00000554532 1367 ntTSL 4 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Q9Y3F1 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Q9Y3F1 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Q9Y3F1 AC012531.1-201ENST00000562848 2680 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Q9Y3F1 PDXDC1-218ENST00000627450 2683 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Q9Y3F1 TNIP1-214ENST00000522226 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Q9Y3F1 ALPL-206ENST00000539907 2241 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Q9Y3F1 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Q9Y3F1 SEZ6-203ENST00000360295 4306 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Q9Y3F1 ARSG-209ENST00000621439 2599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Q9Y3F1 KRTAP4-6-201ENST00000345847 1055 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Q9Y3F1 MYH9-202ENST00000401701 789 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Q9Y3F1 IGSF23-201ENST00000402988 989 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Q9Y3F1 RPL14-203ENST00000416518 812 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Q9Y3F1 GGT8P-201ENST00000418938 532 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Q9Y3F1 AC090696.1-201ENST00000419100 418 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Q9Y3F1 PTPA-219ENST00000435305 530 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Q9Y3F1 RPL13AP5-201ENST00000439189 612 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Q9Y3F1 HTATIP2-203ENST00000443524 967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Q9Y3F1 SRP9P1-201ENST00000445874 261 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Q9Y3F1 AC108724.1-201ENST00000481669 352 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Q9Y3F1 IGKV3-11-201ENST00000483158 392 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Q9Y3F1 C5orf63-203ENST00000509733 553 ntTSL 4 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Q9Y3F1 CCDC42-202ENST00000539522 1087 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Q9Y3F1 AL137779.3-201ENST00000553295 729 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Q9Y3F1 AC091691.1-201ENST00000583587 1018 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Q9Y3F1 AC010319.2-201ENST00000594663 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Q9Y3F1 AC092687.3-201ENST00000606907 393 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Q9Y3F1 AC108673.2-201ENST00000608909 565 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Q9Y3F1 TRIM39-RPP21-201ENST00000623385 1698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Q9Y3F1 NR4A3-201ENST00000330847 4982 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Q9Y3F1 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Q9Y3F1 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Q9Y3F1 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Q9Y3F1 NEDD4L-238ENST00000635997 4402 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Q9Y3F1 TJP2-208ENST00000535702 3984 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Q9Y3F1 MED6-201ENST00000256379 1995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Q9Y3F1 DLX6-202ENST00000518156 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Q9Y3F1 PRKAG2-215ENST00000492843 2699 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Q9Y3F1 MAP2K1-201ENST00000307102 3410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Q9Y3F1 METTL13-202ENST00000362019 3022 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Q9Y3F1 SORCS2-201ENST00000329016 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Q9Y3F1 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Q9Y3F1 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Q9Y3F1 HLA-DMB-258ENST00000418107 1397 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Q9Y3F1 AC020915.4-201ENST00000597230 2708 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Q9Y3F1 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Q9Y3F1 KIAA0930-203ENST00000391627 2623 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Q9Y3F1 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Q9Y3F1 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Q9Y3F1 DHX16-201ENST00000376437 1933 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Q9Y3F1 LIMS2-203ENST00000409254 867 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Q9Y3F1 AC091729.3-203ENST00000413706 674 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Q9Y3F1 AC105935.1-203ENST00000419183 600 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Q9Y3F1 TUBB8P9-201ENST00000422534 1276 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Q9Y3F1 TUBB8P10-201ENST00000430210 1279 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Q9Y3F1 RPL21P135-201ENST00000442539 791 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Q9Y3F1 LINC02151-201ENST00000452629 921 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Q9Y3F1 PGAM5-202ENST00000454808 1084 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Q9Y3F1 ADPGK-202ENST00000456471 808 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Q9Y3F1 RPL7AP53-201ENST00000468834 793 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Q9Y3F1 FAM86JP-202ENST00000484500 988 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Q9Y3F1 AP000439.2-201ENST00000542064 726 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Q9Y3F1 COX14-204ENST00000550654 580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Q9Y3F1 METTL23-211ENST00000589977 617 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Q9Y3F1 ADORA3-204ENST00000632535 1201 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Q9Y3F1 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Q9Y3F1 FAM27E3-201ENST00000418795 1593 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Q9Y3F1 GMPR2-224ENST00000559910 1562 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Q9Y3F1 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Q9Y3F1 SETD1B-203ENST00000604567 5969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Q9Y3F1 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Q9Y3F1 ASS1-203ENST00000372393 1548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Q9Y3F1 FABP1-202ENST00000393750 1839 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Q9Y3F1 ATG2A-201ENST00000377264 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Q9Y3F1 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Q9Y3F1 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Q9Y3F1 TSEN2-205ENST00000444864 2697 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Q9Y3F1 CREB3L4-202ENST00000368600 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Q9Y3F1 AC020914.1-201ENST00000396477 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Q9Y3F1 ARHGAP4-201ENST00000350060 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Q9Y3F1 SEPT7-202ENST00000399034 4399 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Q9Y3F1 HACD2-201ENST00000383657 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Q9Y3F1 ORC5-203ENST00000447452 1409 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Q9Y3F1 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Q9Y3F1 PATL2-201ENST00000434130 1950 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Q9Y3F1 GAP43-201ENST00000305124 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Q9Y3F1 ADCK1-201ENST00000238561 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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