Protein–RNA interactions for Protein: Q96PE5

OPALIN, Opalin, humanhuman

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OPALINQ96PE5 AC080013.1-204ENST00000607426 2185 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
OPALINQ96PE5 AL359915.2-205ENST00000418015 1529 ntTSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
OPALINQ96PE5 DFFB-201ENST00000338895 3105 ntTSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
OPALINQ96PE5 PNMA5-204ENST00000452693 3113 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
OPALINQ96PE5 GPATCH2L-202ENST00000312858 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
OPALINQ96PE5 ZNF25-201ENST00000302609 4139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
OPALINQ96PE5 ARL8B-202ENST00000419534 1684 ntTSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
OPALINQ96PE5 LINC00963-203ENST00000423918 1654 ntTSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
OPALINQ96PE5 ALDH18A1-202ENST00000371224 3359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
OPALINQ96PE5 PCOLCE-201ENST00000223061 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
OPALINQ96PE5 GGTA1P-205ENST00000495328 3478 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
OPALINQ96PE5 FAM105A-201ENST00000274217 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
OPALINQ96PE5 USP49-203ENST00000394253 9034 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
OPALINQ96PE5 DUOX2-205ENST00000603300 6345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
OPALINQ96PE5 PNMA3-203ENST00000619635 3627 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
OPALINQ96PE5 YIPF1-201ENST00000072644 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
OPALINQ96PE5 GSTM3-201ENST00000256594 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
OPALINQ96PE5 EPHB6-211ENST00000619012 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
OPALINQ96PE5 MDH2-204ENST00000443006 2020 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
OPALINQ96PE5 RBM19-201ENST00000261741 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
OPALINQ96PE5 DNAI2-201ENST00000311014 2236 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
OPALINQ96PE5 MATR3-233ENST00000504203 2243 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
OPALINQ96PE5 TRPV1-201ENST00000310522 2340 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
OPALINQ96PE5 RNF219-AS1-209ENST00000606429 2418 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
OPALINQ96PE5 TCF12-201ENST00000267811 6061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
OPALINQ96PE5 PLOD2-201ENST00000282903 3732 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
OPALINQ96PE5 UNC13B-202ENST00000378496 5063 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
OPALINQ96PE5 C8orf74-201ENST00000304519 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
OPALINQ96PE5 DUSP23-202ENST00000368108 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
OPALINQ96PE5 THEMIS2-204ENST00000373927 1082 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
OPALINQ96PE5 UCHL3-201ENST00000377595 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
OPALINQ96PE5 TISP43-201ENST00000409793 538 ntTSL 4 BASIC12.25□□□□□ -0.45
OPALINQ96PE5 ITPR1-AS1-201ENST00000412804 858 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
OPALINQ96PE5 LIMS1-206ENST00000414829 439 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
OPALINQ96PE5 AL450998.2-201ENST00000418525 639 ntTSL 3 BASIC12.25□□□□□ -0.45
OPALINQ96PE5 NME2P1-201ENST00000426182 414 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
OPALINQ96PE5 AC020915.1-202ENST00000427361 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
OPALINQ96PE5 AC026954.1-201ENST00000429771 1293 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
OPALINQ96PE5 UFL1-AS1-201ENST00000430796 548 ntTSL 3 BASIC12.25□□□□□ -0.45
OPALINQ96PE5 AC234783.1-201ENST00000441761 496 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
OPALINQ96PE5 SVIL-AS1-208ENST00000446807 1007 ntTSL 3 BASIC12.25□□□□□ -0.45
OPALINQ96PE5 ARMCX3-AS1-201ENST00000454228 490 ntTSL 3 BASIC12.25□□□□□ -0.45
OPALINQ96PE5 CROCCP4-201ENST00000457096 498 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
OPALINQ96PE5 LIMS3-205ENST00000487150 782 ntTSL 3 BASIC12.25□□□□□ -0.45
OPALINQ96PE5 AC069185.1-202ENST00000533405 471 ntTSL 3 BASIC12.25□□□□□ -0.45
OPALINQ96PE5 ZNF385A-213ENST00000551771 1111 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
OPALINQ96PE5 CMTM3-212ENST00000566121 572 ntTSL 3 BASIC12.25□□□□□ -0.45
OPALINQ96PE5 AC007342.4-201ENST00000566383 584 ntTSL 4 BASIC12.25□□□□□ -0.45
OPALINQ96PE5 TXNDC17-202ENST00000570330 459 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
OPALINQ96PE5 AC005962.1-201ENST00000584100 773 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
OPALINQ96PE5 C19orf53-206ENST00000593274 491 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
OPALINQ96PE5 AC091271.1-201ENST00000611877 1162 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
OPALINQ96PE5 AC244157.2-201ENST00000616239 1006 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
OPALINQ96PE5 ARL16-215ENST00000622299 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
OPALINQ96PE5 RAB34-222ENST00000625712 994 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
OPALINQ96PE5 AC004706.3-207ENST00000634823 977 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
OPALINQ96PE5 AC105402.3-202ENST00000446781 2592 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
OPALINQ96PE5 CNTN2-201ENST00000331830 7999 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
OPALINQ96PE5 MEIS2-215ENST00000559561 1442 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
OPALINQ96PE5 RUBCN-202ENST00000296343 2919 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
OPALINQ96PE5 CTCFL-204ENST00000422869 2966 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
OPALINQ96PE5 ZBTB11-201ENST00000312938 6020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
OPALINQ96PE5 DRD3-201ENST00000295881 1541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
OPALINQ96PE5 AC138761.4-201ENST00000578881 1514 ntTSL 3 BASIC12.25□□□□□ -0.45
OPALINQ96PE5 USP5-201ENST00000229268 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
OPALINQ96PE5 KCNIP1-210ENST00000636734 1613 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
OPALINQ96PE5 SETMAR-205ENST00000425863 1657 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
OPALINQ96PE5 SPAG8-201ENST00000340291 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
OPALINQ96PE5 GADL1-201ENST00000282538 3759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
OPALINQ96PE5 KCNMA1-208ENST00000372440 3849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
OPALINQ96PE5 KCNMA1-227ENST00000638203 3840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
OPALINQ96PE5 KCNMA1-233ENST00000638351 3849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
OPALINQ96PE5 ZKSCAN1-202ENST00000426572 2011 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
OPALINQ96PE5 SLC37A4-201ENST00000330775 2102 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
OPALINQ96PE5 WDR6-201ENST00000395474 4401 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
OPALINQ96PE5 TLE3-208ENST00000557907 2295 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
OPALINQ96PE5 FRMD6-203ENST00000395718 4828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
OPALINQ96PE5 IL12A-AS1-203ENST00000497452 2425 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
OPALINQ96PE5 LDB3-202ENST00000361373 5297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
OPALINQ96PE5 CACNG3-201ENST00000005284 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
OPALINQ96PE5 PNPLA8-206ENST00000436062 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
OPALINQ96PE5 TMX4-201ENST00000246024 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
OPALINQ96PE5 UPK3A-201ENST00000216211 1051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
OPALINQ96PE5 LMBR1L-201ENST00000267102 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
OPALINQ96PE5 MEGF11-201ENST00000288745 5707 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
OPALINQ96PE5 ZNF667-201ENST00000292069 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
OPALINQ96PE5 PPFIA4-202ENST00000295706 6395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
OPALINQ96PE5 AOC3-201ENST00000308423 4026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
OPALINQ96PE5 ZDHHC7-201ENST00000313732 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
OPALINQ96PE5 SNX14-201ENST00000314673 3486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
OPALINQ96PE5 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
OPALINQ96PE5 INO80C-202ENST00000334598 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
OPALINQ96PE5 NDUFB8-202ENST00000370320 684 ntTSL 3 BASIC12.24□□□□□ -0.45
OPALINQ96PE5 ZNF248-202ENST00000374648 1286 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
OPALINQ96PE5 CWC27-201ENST00000381070 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
OPALINQ96PE5 EOGT-202ENST00000383701 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
OPALINQ96PE5 PEMT-203ENST00000395782 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
OPALINQ96PE5 NBPF17P-201ENST00000401087 2119 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
OPALINQ96PE5 NDUFAB1P1-201ENST00000404262 460 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
OPALINQ96PE5 PSORS1C3-201ENST00000412143 593 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms