Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6D2

RNF182, E3 ubiquitin-protein ligase RNF182, humanhuman

Predictions only

Length 247 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF182Q8N6D2 EMC4-201ENST00000249209 852 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
RNF182Q8N6D2 PDLIM5-203ENST00000359265 1189 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
RNF182Q8N6D2 SLC16A6P1-201ENST00000413214 1059 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
RNF182Q8N6D2 DNAJB1P1-201ENST00000429417 1024 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
RNF182Q8N6D2 AC005722.1-201ENST00000431878 964 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
RNF182Q8N6D2 PABPC5-AS1-201ENST00000456187 426 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
RNF182Q8N6D2 OARD1-204ENST00000464633 717 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
RNF182Q8N6D2 ROPN1-207ENST00000484329 566 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
RNF182Q8N6D2 SEC61B-203ENST00000498603 587 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
RNF182Q8N6D2 LINC02380-201ENST00000510956 1038 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
RNF182Q8N6D2 GTF2H2C-215ENST00000514162 610 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
RNF182Q8N6D2 CPLX2-209ENST00000515094 576 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC10.46□□□□□ -0.73
RNF182Q8N6D2 SNHG14-213ENST00000551077 638 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
RNF182Q8N6D2 DPF3-210ENST00000556509 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
RNF182Q8N6D2 SNHG25-202ENST00000582965 278 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
RNF182Q8N6D2 AC079336.1-201ENST00000583156 420 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
RNF182Q8N6D2 CENPX-208ENST00000584347 799 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
RNF182Q8N6D2 FXYD6-217ENST00000584394 669 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
RNF182Q8N6D2 ACP7-202ENST00000594229 1149 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
RNF182Q8N6D2 ATRAID-207ENST00000606999 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
RNF182Q8N6D2 AC026740.1-201ENST00000607068 791 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
RNF182Q8N6D2 AL118558.3-201ENST00000607414 1079 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
RNF182Q8N6D2 Six3os1_5.1-201ENST00000611000 271 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
RNF182Q8N6D2 CRISP2-201ENST00000339139 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
RNF182Q8N6D2 SLC18A1-203ENST00000381608 1419 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
RNF182Q8N6D2 AF013593.1-201ENST00000458074 1487 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
RNF182Q8N6D2 RCC2P5-201ENST00000492126 1487 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
RNF182Q8N6D2 RMND1-205ENST00000622845 1484 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
RNF182Q8N6D2 TRAPPC9-201ENST00000389328 4474 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.74
RNF182Q8N6D2 AC000120.1-201ENST00000414227 1589 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
RNF182Q8N6D2 INSC-205ENST00000525218 1576 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
RNF182Q8N6D2 ZCCHC17-201ENST00000344147 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
RNF182Q8N6D2 UMODL1-205ENST00000408910 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
RNF182Q8N6D2 BCL2L13-214ENST00000543133 4975 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.74
RNF182Q8N6D2 BCL2L13-217ENST00000618481 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
RNF182Q8N6D2 ALG8-202ENST00000376156 1677 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.74
RNF182Q8N6D2 DUOXA1-205ENST00000558422 1678 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
RNF182Q8N6D2 PLB1-205ENST00000422425 5115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
RNF182Q8N6D2 PPP2R2C-204ENST00000506140 1780 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.74
RNF182Q8N6D2 VIPAS39-208ENST00000556412 1832 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.74
RNF182Q8N6D2 PLAG1-203ENST00000429357 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
RNF182Q8N6D2 FAM225A-202ENST00000453010 5625 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
RNF182Q8N6D2 GOLGA8T-202ENST00000569052 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
RNF182Q8N6D2 DSN1-201ENST00000373734 1915 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.74
RNF182Q8N6D2 CWC27-201ENST00000381070 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
RNF182Q8N6D2 ERCC4-207ENST00000575156 2073 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
RNF182Q8N6D2 VSTM4-202ENST00000332853 6392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
RNF182Q8N6D2 FAM212B-AS1-201ENST00000430373 2131 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
RNF182Q8N6D2 ZNF573-204ENST00000392138 2266 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.74
RNF182Q8N6D2 MMD2-203ENST00000406755 2372 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
RNF182Q8N6D2 ANXA11-201ENST00000265447 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
RNF182Q8N6D2 ZDHHC11-201ENST00000283441 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
RNF182Q8N6D2 GPA33-201ENST00000367868 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
RNF182Q8N6D2 FAM214B-205ENST00000488109 2999 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
RNF182Q8N6D2 NCDN-203ENST00000373253 3677 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
RNF182Q8N6D2 TJP2-206ENST00000453658 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.74
RNF182Q8N6D2 SLC5A8-201ENST00000536262 4178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
RNF182Q8N6D2 NRXN1-233ENST00000630543 4500 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
RNF182Q8N6D2 DCDC2-202ENST00000378454 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
RNF182Q8N6D2 IST1-203ENST00000378799 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
RNF182Q8N6D2 GPR179-204ENST00000621958 7983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
RNF182Q8N6D2 MYH3-205ENST00000583535 6037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
RNF182Q8N6D2 RAPGEF6-207ENST00000507093 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
RNF182Q8N6D2 GRHL2-201ENST00000251808 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
RNF182Q8N6D2 RAB8B-201ENST00000321437 4943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
RNF182Q8N6D2 ENOX2-204ENST00000394363 4174 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
RNF182Q8N6D2 NTM-202ENST00000374786 3190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
RNF182Q8N6D2 CICP1-201ENST00000416803 2410 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
RNF182Q8N6D2 PI4KAP2-201ENST00000360806 2080 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
RNF182Q8N6D2 ZNF239-205ENST00000535642 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
RNF182Q8N6D2 SLC6A19-201ENST00000304460 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
RNF182Q8N6D2 PLCXD2-204ENST00000477665 1721 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
RNF182Q8N6D2 ZNF740-201ENST00000416904 8578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
RNF182Q8N6D2 TBC1D27-202ENST00000424239 1573 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
RNF182Q8N6D2 IL17B-201ENST00000261796 696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
RNF182Q8N6D2 U2AF1L4-201ENST00000292879 729 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
RNF182Q8N6D2 CRABP1-201ENST00000299529 772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
RNF182Q8N6D2 NOSIP-201ENST00000339093 1000 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
RNF182Q8N6D2 ALG1L-201ENST00000340333 805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
RNF182Q8N6D2 RAB36-202ENST00000341989 936 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
RNF182Q8N6D2 FAM213A-204ENST00000372188 829 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
RNF182Q8N6D2 AGER-203ENST00000375065 665 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
RNF182Q8N6D2 IGHV3-7-201ENST00000390598 430 ntAPPRIS P1 BASIC10.45□□□□□ -0.74
RNF182Q8N6D2 CRCP-204ENST00000398684 492 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
RNF182Q8N6D2 ZFAND2B-203ENST00000409206 1159 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
RNF182Q8N6D2 CYP46A4P-201ENST00000414953 267 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
RNF182Q8N6D2 AL672291.1-201ENST00000417047 462 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
RNF182Q8N6D2 HLA-DQB2-232ENST00000437316 1214 ntAPPRIS P1 BASIC10.45□□□□□ -0.74
RNF182Q8N6D2 ELFN1-AS1-202ENST00000453348 637 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
RNF182Q8N6D2 HOXB-AS3-209ENST00000477144 743 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
RNF182Q8N6D2 LINC02435-201ENST00000508291 584 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
RNF182Q8N6D2 ATG10-207ENST00000513443 978 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
RNF182Q8N6D2 AC090857.1-201ENST00000527400 390 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
RNF182Q8N6D2 NOP2-220ENST00000545915 630 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
RNF182Q8N6D2 AL135838.1-202ENST00000556411 441 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
RNF182Q8N6D2 AL132711.1-201ENST00000557546 722 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
RNF182Q8N6D2 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC10.45□□□□□ -0.74
RNF182Q8N6D2 AC011921.1-201ENST00000559739 557 ntTSL 4 BASIC10.45□□□□□ -0.74
RNF182Q8N6D2 AC120498.3-201ENST00000568884 542 ntTSL 4 BASIC10.45□□□□□ -0.74
RNF182Q8N6D2 PYY-202ENST00000592796 580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.8 ms