Protein–RNA interactions for Protein: P51532

SMARCA4, Transcription activator BRG1, humanhuman

Predictions only

Length 1,647 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCA4P51532 BCO2-202ENST00000361053 1868 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SMARCA4P51532 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SMARCA4P51532 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SMARCA4P51532 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SMARCA4P51532 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SMARCA4P51532 YWHAQ-202ENST00000381844 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SMARCA4P51532 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SMARCA4P51532 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SMARCA4P51532 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SMARCA4P51532 TBC1D17-201ENST00000221543 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SMARCA4P51532 CTBP1-AS2-205ENST00000578730 2757 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SMARCA4P51532 CHMP4C-201ENST00000297265 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SMARCA4P51532 FAM204A-202ENST00000369172 872 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SMARCA4P51532 PAGE4-202ENST00000376141 487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SMARCA4P51532 PRDX4-201ENST00000379331 852 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SMARCA4P51532 RPL18P1-201ENST00000497218 552 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
SMARCA4P51532 AC010280.2-201ENST00000507733 410 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SMARCA4P51532 AC073655.1-201ENST00000550111 493 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SMARCA4P51532 DHRS4L1-201ENST00000558293 855 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SMARCA4P51532 MEG8_2.1-201ENST00000610604 122 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
SMARCA4P51532 AC241585.2-202ENST00000621798 1015 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SMARCA4P51532 RGPD5-202ENST00000272454 2907 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SMARCA4P51532 TRIQK-219ENST00000523580 1630 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SMARCA4P51532 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SMARCA4P51532 CCNG1-202ENST00000393929 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SMARCA4P51532 LPAR5-201ENST00000329858 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SMARCA4P51532 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SMARCA4P51532 ZFP64-203ENST00000361387 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SMARCA4P51532 AOX3P-202ENST00000469595 1471 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SMARCA4P51532 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SMARCA4P51532 PSD-209ENST00000611678 3382 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SMARCA4P51532 SAFB-201ENST00000292123 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SMARCA4P51532 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SMARCA4P51532 FOXD4L5-201ENST00000377420 3109 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SMARCA4P51532 ZNF777-201ENST00000247930 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SMARCA4P51532 OR10K2-201ENST00000314902 939 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SMARCA4P51532 IL32-204ENST00000396887 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SMARCA4P51532 GALM-202ENST00000410063 1023 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SMARCA4P51532 AL663070.1-201ENST00000438210 725 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
SMARCA4P51532 AC233724.7-201ENST00000511476 253 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
SMARCA4P51532 AC127537.3-201ENST00000566532 749 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
SMARCA4P51532 AC090236.1-201ENST00000590318 768 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SMARCA4P51532 AC092301.1-201ENST00000601618 764 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SMARCA4P51532 BIRC2-208ENST00000532672 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SMARCA4P51532 DYRK4-201ENST00000010132 1840 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SMARCA4P51532 AC010182.1-201ENST00000548943 2434 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
SMARCA4P51532 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SMARCA4P51532 PHKG1-210ENST00000537360 2139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SMARCA4P51532 TGM5-207ENST00000622115 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SMARCA4P51532 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SMARCA4P51532 KBTBD4-202ENST00000430070 2372 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SMARCA4P51532 PVR-203ENST00000403059 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SMARCA4P51532 CHMP2A-201ENST00000312547 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SMARCA4P51532 KRTAP12-4-201ENST00000391618 447 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SMARCA4P51532 AC007322.2-201ENST00000414540 605 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
SMARCA4P51532 MED15P7-201ENST00000435410 822 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
SMARCA4P51532 AC022483.2-201ENST00000461464 555 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
SMARCA4P51532 AC011472.2-201ENST00000586356 655 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SMARCA4P51532 CHMP2A-206ENST00000600118 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SMARCA4P51532 MECP2-226ENST00000640414 897 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SMARCA4P51532 AP000229.1-201ENST00000608591 1979 ntTSL 4 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SMARCA4P51532 GMPS-201ENST00000295920 2024 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SMARCA4P51532 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SMARCA4P51532 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SMARCA4P51532 GDAP2-201ENST00000369442 2436 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SMARCA4P51532 ZNF772-203ENST00000425074 1601 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SMARCA4P51532 SOX30-203ENST00000519442 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SMARCA4P51532 DAND5-201ENST00000317060 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SMARCA4P51532 PIGS-203ENST00000395346 2815 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SMARCA4P51532 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SMARCA4P51532 ZDHHC4-202ENST00000396706 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SMARCA4P51532 CAMKV-215ENST00000488336 2905 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SMARCA4P51532 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SMARCA4P51532 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SMARCA4P51532 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SMARCA4P51532 FAM96A-202ENST00000380290 826 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SMARCA4P51532 AL132656.1-201ENST00000452173 490 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
SMARCA4P51532 GIMD1-201ENST00000507153 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SMARCA4P51532 KRT127P-201ENST00000547183 433 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
SMARCA4P51532 LINC02395-202ENST00000547443 724 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SMARCA4P51532 SKAP1-AS1-201ENST00000582246 687 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SMARCA4P51532 AC090844.3-201ENST00000583462 784 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SMARCA4P51532 snoZ6.3-201ENST00000583496 76 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
SMARCA4P51532 LINC02348-201ENST00000618724 489 ntTSL 4 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SMARCA4P51532 CHRNB4-201ENST00000261751 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SMARCA4P51532 MUM1-201ENST00000415183 2837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SMARCA4P51532 OPCML-IT1-201ENST00000533859 2936 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SMARCA4P51532 C20orf96-203ENST00000400269 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SMARCA4P51532 FAM156A-203ENST00000611661 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SMARCA4P51532 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SMARCA4P51532 USP14-208ENST00000582707 1803 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SMARCA4P51532 FAM114A2-211ENST00000520667 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SMARCA4P51532 VAMP2-201ENST00000316509 2153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SMARCA4P51532 DUSP18-204ENST00000403268 2920 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SMARCA4P51532 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SMARCA4P51532 CDK20-201ENST00000325303 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SMARCA4P51532 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SMARCA4P51532 DNASE1L1-206ENST00000393638 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SMARCA4P51532 IGF2BP2-203ENST00000421047 1711 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SMARCA4P51532 TMX3-202ENST00000443099 913 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 121.7 ms