Protein–RNA interactions for Protein: P41238

APOBEC1, C->U-editing enzyme APOBEC-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC1P41238 NIPA1-207ENST00000561183 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
APOBEC1P41238 FEM1A-201ENST00000269856 9593 ntAPPRIS P1 BASIC12.36□□□□□ -0.43
APOBEC1P41238 SEC13-203ENST00000383801 1479 ntTSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
APOBEC1P41238 CHRFAM7A-201ENST00000299847 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
APOBEC1P41238 NTSR1-201ENST00000370501 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
APOBEC1P41238 Z82170.1-201ENST00000625081 3192 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
APOBEC1P41238 ZCCHC12-201ENST00000310164 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
APOBEC1P41238 CLPB-209ENST00000538039 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
APOBEC1P41238 LY86-201ENST00000230568 559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
APOBEC1P41238 GON7-201ENST00000306954 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
APOBEC1P41238 AC091046.1-201ENST00000331871 207 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
APOBEC1P41238 HCRTR1-201ENST00000373705 1170 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
APOBEC1P41238 BAK1-202ENST00000374467 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
APOBEC1P41238 OR7E115P-201ENST00000382617 1024 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
APOBEC1P41238 Z69890.1-201ENST00000382990 339 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
APOBEC1P41238 POLR2H-203ENST00000430783 1159 ntTSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
APOBEC1P41238 AL591242.1-203ENST00000434329 374 ntTSL 3 BASIC12.36□□□□□ -0.43
APOBEC1P41238 DLEU2-205ENST00000443587 705 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
APOBEC1P41238 DPY19L2P5-201ENST00000456300 331 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
APOBEC1P41238 EEF1GP8-201ENST00000506566 1154 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
APOBEC1P41238 TVP23C-205ENST00000518321 1080 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
APOBEC1P41238 LZTS1-AS1-201ENST00000523103 892 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
APOBEC1P41238 EIF1AD-211ENST00000533544 965 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.36□□□□□ -0.43
APOBEC1P41238 VENTXP3-201ENST00000546480 773 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
APOBEC1P41238 RN7SL357P-201ENST00000581065 298 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
APOBEC1P41238 MIR3180-2-201ENST00000581748 88 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
APOBEC1P41238 Metazoa_SRP.144-201ENST00000617007 311 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
APOBEC1P41238 ST5-261ENST00000626808 1071 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
APOBEC1P41238 AL805961.1-201ENST00000642026 753 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
APOBEC1P41238 GPR132-202ENST00000392585 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
APOBEC1P41238 ARHGEF33-202ENST00000409978 4484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
APOBEC1P41238 WDR24-201ENST00000248142 2763 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
APOBEC1P41238 ZHX1-202ENST00000395571 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
APOBEC1P41238 CEP112-202ENST00000392769 3517 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
APOBEC1P41238 SERPINI1-201ENST00000295777 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
APOBEC1P41238 ABCG8-201ENST00000272286 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
APOBEC1P41238 SLC38A5-210ENST00000595796 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
APOBEC1P41238 MEGF8-201ENST00000251268 9549 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
APOBEC1P41238 Z83844.1-201ENST00000455236 4904 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
APOBEC1P41238 TRAF6-202ENST00000526995 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
APOBEC1P41238 COPS7B-223ENST00000611614 2468 ntTSL 3 BASIC12.36□□□□□ -0.43
APOBEC1P41238 LINC01922-202ENST00000567168 1704 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
APOBEC1P41238 ZNF568-206ENST00000455427 2378 ntTSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
APOBEC1P41238 ATG4C-201ENST00000317868 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
APOBEC1P41238 NRP1-202ENST00000374816 2804 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
APOBEC1P41238 SLC4A11-207ENST00000539553 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
APOBEC1P41238 MRPS9-201ENST00000258455 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
APOBEC1P41238 SYNPR-209ENST00000478300 2709 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
APOBEC1P41238 ARHGAP10-201ENST00000336498 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
APOBEC1P41238 ALOX15B-201ENST00000380173 2605 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
APOBEC1P41238 CEP250-201ENST00000397524 1419 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
APOBEC1P41238 KIAA1217-209ENST00000430453 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
APOBEC1P41238 KIAA1217-211ENST00000458595 5977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
APOBEC1P41238 RPA2-203ENST00000373912 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
APOBEC1P41238 SLC7A8-205ENST00000453702 1752 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
APOBEC1P41238 ANKHD1-203ENST00000360839 8221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
APOBEC1P41238 EIF4G1-207ENST00000411531 4683 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
APOBEC1P41238 GABRR2-201ENST00000402938 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
APOBEC1P41238 TMEM130-201ENST00000339375 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
APOBEC1P41238 HOXA1-202ENST00000355633 2016 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
APOBEC1P41238 AHCY-205ENST00000538132 2366 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
APOBEC1P41238 LANCL1-205ENST00000443314 4781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
APOBEC1P41238 AC026271.4-201ENST00000578214 1833 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
APOBEC1P41238 RNF43-202ENST00000577625 2198 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
APOBEC1P41238 TMPRSS4-213ENST00000522824 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
APOBEC1P41238 CHD1-212ENST00000614616 8095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
APOBEC1P41238 TMEM25-201ENST00000313236 2409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
APOBEC1P41238 AC004241.5-201ENST00000623870 2448 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
APOBEC1P41238 HPGD-201ENST00000296521 1171 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
APOBEC1P41238 CES3-201ENST00000303334 3834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
APOBEC1P41238 CMTM5-203ENST00000359320 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
APOBEC1P41238 TNNT2-203ENST00000367315 1083 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
APOBEC1P41238 RPL13A-201ENST00000391857 1181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
APOBEC1P41238 CES3-202ENST00000394037 3817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
APOBEC1P41238 GAPDH-204ENST00000396859 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
APOBEC1P41238 AC112721.1-201ENST00000409162 588 ntTSL 3 BASIC12.35□□□□□ -0.43
APOBEC1P41238 CD8A-204ENST00000409781 597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
APOBEC1P41238 HIST2H2BA-201ENST00000412169 381 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
APOBEC1P41238 AL139246.4-201ENST00000442305 514 ntTSL 3 BASIC12.35□□□□□ -0.43
APOBEC1P41238 AC006529.1-201ENST00000459978 637 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
APOBEC1P41238 RPS23-204ENST00000507980 836 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
APOBEC1P41238 AL136295.3-201ENST00000558325 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
APOBEC1P41238 Metazoa_SRP.69-201ENST00000615730 281 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
APOBEC1P41238 NR2F2-AS1-215ENST00000620029 1223 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
APOBEC1P41238 PSMD5-208ENST00000625444 219 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
APOBEC1P41238 SLC12A5-219ENST00000628272 401 ntTSL 3 BASIC12.35□□□□□ -0.43
APOBEC1P41238 AC011491.1-203ENST00000637688 543 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
APOBEC1P41238 TCF23-201ENST00000296096 4882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
APOBEC1P41238 KRT17P5-203ENST00000445433 2333 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
APOBEC1P41238 CC2D1B-201ENST00000284376 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
APOBEC1P41238 CHFR-205ENST00000450056 3250 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
APOBEC1P41238 NCF2-201ENST00000367535 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
APOBEC1P41238 AL512306.2-201ENST00000444037 2219 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
APOBEC1P41238 WHRN-201ENST00000265134 2847 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
APOBEC1P41238 NFATC1-205ENST00000427363 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
APOBEC1P41238 TBC1D22A-201ENST00000337137 3787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
APOBEC1P41238 SRPRA-201ENST00000332118 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
APOBEC1P41238 SUGP2-203ENST00000452918 6176 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
APOBEC1P41238 IL9RP3-201ENST00000442856 1674 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
APOBEC1P41238 ETNPPL-206ENST00000510706 1692 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72 ms