Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP64

ZCCHC17, Nucleolar protein of 40 kDa, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 241 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZCCHC17Q9NP64 NFATC4-219ENST00000555167 4364 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZCCHC17Q9NP64 CLCN7-203ENST00000448525 4151 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZCCHC17Q9NP64 ARHGEF9-230ENST00000637178 2145 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZCCHC17Q9NP64 IQCE-216ENST00000611775 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZCCHC17Q9NP64 ARHGEF28-202ENST00000296799 4424 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZCCHC17Q9NP64 GABPB1-202ENST00000359031 1633 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZCCHC17Q9NP64 AC006262.1-203ENST00000598170 1634 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZCCHC17Q9NP64 C12orf49-201ENST00000261318 8404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZCCHC17Q9NP64 RNASEH2B-202ENST00000422660 4830 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZCCHC17Q9NP64 CAMKK2-201ENST00000324774 5598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZCCHC17Q9NP64 INTS5-201ENST00000330574 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZCCHC17Q9NP64 RPL10L-201ENST00000298283 812 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZCCHC17Q9NP64 C18orf21-202ENST00000333234 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZCCHC17Q9NP64 AIFM1-203ENST00000346424 1200 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZCCHC17Q9NP64 CASP8-206ENST00000392258 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZCCHC17Q9NP64 C7orf65-201ENST00000408988 2911 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZCCHC17Q9NP64 Z95624.1-201ENST00000413528 628 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZCCHC17Q9NP64 AL158207.2-201ENST00000414926 266 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZCCHC17Q9NP64 SAPCD1-AS1-202ENST00000419679 461 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZCCHC17Q9NP64 RIC3-205ENST00000425599 867 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZCCHC17Q9NP64 AC011284.1-201ENST00000427920 856 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZCCHC17Q9NP64 CCND3P1-201ENST00000438347 580 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
ZCCHC17Q9NP64 BX322557.2-201ENST00000445242 379 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZCCHC17Q9NP64 AL137078.1-201ENST00000446280 404 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZCCHC17Q9NP64 AC010900.1-201ENST00000449849 1296 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
ZCCHC17Q9NP64 AC112250.1-201ENST00000504640 745 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
ZCCHC17Q9NP64 AF274856.1-202ENST00000509345 871 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZCCHC17Q9NP64 AC022447.6-201ENST00000515522 438 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
ZCCHC17Q9NP64 ZBED8-202ENST00000523213 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZCCHC17Q9NP64 C11orf45-202ENST00000524878 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZCCHC17Q9NP64 NAV2-AS2-201ENST00000533767 782 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZCCHC17Q9NP64 CDIPT-AS1-202ENST00000565014 729 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZCCHC17Q9NP64 LINC01029-202ENST00000578833 366 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZCCHC17Q9NP64 ZNF671-203ENST00000596939 977 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZCCHC17Q9NP64 PDCD6-213ENST00000618970 931 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZCCHC17Q9NP64 FP565260.2-201ENST00000623476 1599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZCCHC17Q9NP64 AC245369.7-201ENST00000631386 350 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
ZCCHC17Q9NP64 BX322534.1-201ENST00000635574 241 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
ZCCHC17Q9NP64 AC215524.1-201ENST00000635696 241 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
ZCCHC17Q9NP64 FBLIM1-203ENST00000375771 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZCCHC17Q9NP64 ANGPTL2-202ENST00000373425 3707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZCCHC17Q9NP64 MPZ-204ENST00000491222 1824 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZCCHC17Q9NP64 SPATS2-203ENST00000547865 1810 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZCCHC17Q9NP64 FER1L4-204ENST00000430275 3281 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZCCHC17Q9NP64 PPP1R32-201ENST00000338608 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZCCHC17Q9NP64 SELENBP1-208ENST00000447402 1530 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZCCHC17Q9NP64 LINC00205-201ENST00000433465 1391 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZCCHC17Q9NP64 SEPT6-201ENST00000343984 2693 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZCCHC17Q9NP64 NSD2-203ENST00000382888 2666 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZCCHC17Q9NP64 PELP1-201ENST00000301396 3673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZCCHC17Q9NP64 IRF2BP2-201ENST00000366609 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZCCHC17Q9NP64 ABCB9-203ENST00000346530 3399 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZCCHC17Q9NP64 AMZ1-201ENST00000312371 5516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZCCHC17Q9NP64 GUCY2EP-203ENST00000531117 1918 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
ZCCHC17Q9NP64 CPT1C-202ENST00000323446 2783 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZCCHC17Q9NP64 PYGM-202ENST00000377432 2611 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZCCHC17Q9NP64 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZCCHC17Q9NP64 MLX-202ENST00000346833 2334 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZCCHC17Q9NP64 BRSK2-202ENST00000382179 3576 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZCCHC17Q9NP64 CUL7-203ENST00000535468 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZCCHC17Q9NP64 GPR45-201ENST00000258456 1307 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZCCHC17Q9NP64 FAHD2B-201ENST00000272610 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZCCHC17Q9NP64 TNIP3-201ENST00000057513 2416 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZCCHC17Q9NP64 PFKP-203ENST00000381125 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZCCHC17Q9NP64 PPM1F-201ENST00000263212 5143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZCCHC17Q9NP64 AC004846.1-201ENST00000554614 3050 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZCCHC17Q9NP64 PTGR1-205ENST00000407693 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZCCHC17Q9NP64 DLGAP1-213ENST00000534970 2365 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZCCHC17Q9NP64 KIF3C-202ENST00000405914 3180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZCCHC17Q9NP64 NAA60-203ENST00000414063 2619 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZCCHC17Q9NP64 GZMB-201ENST00000216341 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZCCHC17Q9NP64 RNF212-201ENST00000333673 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZCCHC17Q9NP64 SLC35F2-201ENST00000375682 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZCCHC17Q9NP64 MED15P3-201ENST00000413613 326 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
ZCCHC17Q9NP64 AC098657.1-201ENST00000416270 1135 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
ZCCHC17Q9NP64 FAM197Y6-201ENST00000420524 766 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
ZCCHC17Q9NP64 AC041040.1-201ENST00000425197 460 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
ZCCHC17Q9NP64 MAGEA7P-201ENST00000436482 942 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
ZCCHC17Q9NP64 HNRNPA3P12-201ENST00000437410 1063 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
ZCCHC17Q9NP64 PEBP1P3-201ENST00000455475 548 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
ZCCHC17Q9NP64 RN7SL523P-201ENST00000484401 298 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
ZCCHC17Q9NP64 AC026412.1-206ENST00000502273 206 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
ZCCHC17Q9NP64 AC011431.1-201ENST00000512971 230 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
ZCCHC17Q9NP64 GPX3-202ENST00000517973 612 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZCCHC17Q9NP64 AP003031.2-205ENST00000531263 683 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZCCHC17Q9NP64 BCAT2-203ENST00000545387 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZCCHC17Q9NP64 AC090617.4-201ENST00000572404 422 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZCCHC17Q9NP64 AC007193.3-201ENST00000598616 188 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZCCHC17Q9NP64 GSTT2-202ENST00000621118 1112 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZCCHC17Q9NP64 AC233280.19-201ENST00000633223 136 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
ZCCHC17Q9NP64 MLXIPL-206ENST00000434326 3252 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZCCHC17Q9NP64 UNC5CL-201ENST00000244565 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZCCHC17Q9NP64 ABHD16A-202ENST00000440843 1906 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZCCHC17Q9NP64 FOXM1-203ENST00000361953 3370 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZCCHC17Q9NP64 SIGLEC6-204ENST00000391797 1391 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZCCHC17Q9NP64 AKNA-204ENST00000374075 5038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZCCHC17Q9NP64 FUT8-202ENST00000358307 2664 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZCCHC17Q9NP64 RET-202ENST00000355710 5659 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZCCHC17Q9NP64 HNRNPUL1-204ENST00000392006 3555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZCCHC17Q9NP64 ATG9A-204ENST00000409422 2512 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.8 ms