Protein–RNA interactions for Protein: P0C0L5

C4B, Complement C4-B, humanhuman

Predictions only

Length 1,744 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4BP0C0L5 RBP1-206ENST00000617459 667 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
C4BP0C0L5 AC244154.1-201ENST00000620148 1555 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
C4BP0C0L5 LINC00923-208ENST00000621777 503 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
C4BP0C0L5 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
C4BP0C0L5 NFS1-203ENST00000374092 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
C4BP0C0L5 SPHK2-206ENST00000598088 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
C4BP0C0L5 SMYD5-202ENST00000389501 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
C4BP0C0L5 ZNF277-201ENST00000361822 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
C4BP0C0L5 TMUB2-211ENST00000589184 1837 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
C4BP0C0L5 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
C4BP0C0L5 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
C4BP0C0L5 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
C4BP0C0L5 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
C4BP0C0L5 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
C4BP0C0L5 KLHDC2-211ENST00000557247 1565 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
C4BP0C0L5 FGF12-207ENST00000454309 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
C4BP0C0L5 DDX43-201ENST00000370336 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
C4BP0C0L5 SERPINE3-203ENST00000521255 1439 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
C4BP0C0L5 HIST1H2BN-201ENST00000396980 432 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
C4BP0C0L5 AL356583.3-201ENST00000412354 417 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
C4BP0C0L5 AL157823.2-201ENST00000452048 669 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
C4BP0C0L5 AL355987.2-201ENST00000471502 561 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
C4BP0C0L5 AL136360.2-201ENST00000502636 581 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
C4BP0C0L5 LINC02507-201ENST00000509370 1028 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
C4BP0C0L5 C8orf37-AS1-203ENST00000521905 617 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
C4BP0C0L5 AC009132.1-201ENST00000565194 320 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
C4BP0C0L5 JPT2-214ENST00000569765 782 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
C4BP0C0L5 CIRBP-AS1-201ENST00000585832 994 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
C4BP0C0L5 LINC00869-208ENST00000621156 737 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
C4BP0C0L5 AC245369.3-201ENST00000624687 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
C4BP0C0L5 RRAGB-202ENST00000374941 2061 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
C4BP0C0L5 WDR27-201ENST00000423258 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
C4BP0C0L5 AL359915.2-202ENST00000440150 2469 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
C4BP0C0L5 FP671120.1-201ENST00000623664 2498 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
C4BP0C0L5 FP236383.1-201ENST00000623860 2498 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
C4BP0C0L5 ZNF493-208ENST00000599461 1769 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
C4BP0C0L5 SIRPG-205ENST00000381583 1383 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
C4BP0C0L5 CDK5RAP1-202ENST00000346416 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
C4BP0C0L5 NBEAP3-201ENST00000420638 1493 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
C4BP0C0L5 DPYSL4-201ENST00000338492 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
C4BP0C0L5 NLRX1-204ENST00000409991 3716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
C4BP0C0L5 FOLR1-203ENST00000393679 1331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
C4BP0C0L5 RGS6-202ENST00000355512 1564 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
C4BP0C0L5 ARSG-209ENST00000621439 2599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
C4BP0C0L5 LINC00943-204ENST00000537374 1688 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
C4BP0C0L5 SRRD-201ENST00000215917 4020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
C4BP0C0L5 SIGLEC16-202ENST00000602139 2510 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
C4BP0C0L5 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
C4BP0C0L5 NDUFB11-201ENST00000276062 948 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
C4BP0C0L5 AP000487.2-201ENST00000324630 394 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
C4BP0C0L5 S100A7A-202ENST00000368728 440 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
C4BP0C0L5 SEMA6A-AS1-206ENST00000514214 782 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
C4BP0C0L5 PSME3-213ENST00000592169 826 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
C4BP0C0L5 MIR6871-201ENST00000613433 56 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
C4BP0C0L5 AC007274.3-201ENST00000619838 385 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
C4BP0C0L5 TESPA1-201ENST00000316577 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
C4BP0C0L5 NOX5-203ENST00000448182 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
C4BP0C0L5 PEX11B-203ENST00000537888 1632 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
C4BP0C0L5 AC005549.1-201ENST00000579438 1629 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
C4BP0C0L5 AP000897.1-201ENST00000584036 1613 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
C4BP0C0L5 C12orf76-201ENST00000309050 1964 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
C4BP0C0L5 ENTPD3-204ENST00000456402 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
C4BP0C0L5 BHMT2-201ENST00000255192 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
C4BP0C0L5 AGAP10P-201ENST00000454844 2418 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
C4BP0C0L5 RNASE7-201ENST00000298690 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
C4BP0C0L5 WRB-202ENST00000380708 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
C4BP0C0L5 GOLGA2-212ENST00000609374 2973 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
C4BP0C0L5 SPRY2-201ENST00000377102 2708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
C4BP0C0L5 BCAR1-205ENST00000420641 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
C4BP0C0L5 SGCE-201ENST00000265735 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
C4BP0C0L5 BAK1-201ENST00000360661 2132 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
C4BP0C0L5 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
C4BP0C0L5 PATL2-208ENST00000560780 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
C4BP0C0L5 ZBTB7B-202ENST00000368426 3594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
C4BP0C0L5 IL17RD-203ENST00000463523 2348 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
C4BP0C0L5 AC009093.9-201ENST00000566038 1611 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
C4BP0C0L5 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
C4BP0C0L5 AC234771.1-201ENST00000416873 250 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
C4BP0C0L5 ATP6AP2-202ENST00000423649 1093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
C4BP0C0L5 OR2A15P-201ENST00000463814 900 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
C4BP0C0L5 AC253536.5-201ENST00000506097 347 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
C4BP0C0L5 IGHV7-56-201ENST00000518372 351 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
C4BP0C0L5 AC002519.2-201ENST00000563575 539 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
C4BP0C0L5 AC092296.1-201ENST00000587018 566 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
C4BP0C0L5 SNHG5-211ENST00000587692 1029 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
C4BP0C0L5 DMRTC1-201ENST00000595412 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
C4BP0C0L5 AC087521.1-201ENST00000501541 2045 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
C4BP0C0L5 PROP1-201ENST00000308304 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
C4BP0C0L5 RPS23-201ENST00000296674 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
C4BP0C0L5 BX005132.1-201ENST00000641403 1580 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
C4BP0C0L5 FTO-214ENST00000636218 2227 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
C4BP0C0L5 ICA1-207ENST00000406470 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
C4BP0C0L5 ALG6-202ENST00000371108 3371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
C4BP0C0L5 CRB2-201ENST00000359999 3659 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
C4BP0C0L5 ARMCX3-203ENST00000471229 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
C4BP0C0L5 LUC7L-203ENST00000397780 1335 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
C4BP0C0L5 AC069061.4-201ENST00000581294 1347 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
C4BP0C0L5 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
C4BP0C0L5 CR383656.2-201ENST00000548656 2254 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
C4BP0C0L5 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
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