Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ16

SPOCK3, Testican-3, humanhuman

Predictions only

Length 436 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPOCK3Q9BQ16 TOB2-201ENST00000327492 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
SPOCK3Q9BQ16 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
SPOCK3Q9BQ16 LILRP2-202ENST00000413572 1383 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
SPOCK3Q9BQ16 C10orf88-204ENST00000481909 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
SPOCK3Q9BQ16 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
SPOCK3Q9BQ16 AC011899.2-202ENST00000438047 4302 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
SPOCK3Q9BQ16 P2RY1-201ENST00000305097 6747 ntAPPRIS P1 BASIC12.05□□□□□ -0.48
SPOCK3Q9BQ16 CFAP36-204ENST00000406691 1575 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
SPOCK3Q9BQ16 TUBB8-206ENST00000568584 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
SPOCK3Q9BQ16 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
SPOCK3Q9BQ16 CTCFL-218ENST00000608440 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
SPOCK3Q9BQ16 PHKG1-201ENST00000297373 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
SPOCK3Q9BQ16 ALDOA-204ENST00000412304 1603 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
SPOCK3Q9BQ16 FAM149A-203ENST00000389354 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
SPOCK3Q9BQ16 SLC26A4-201ENST00000265715 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
SPOCK3Q9BQ16 MID1IP1-204ENST00000614558 3781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
SPOCK3Q9BQ16 SMTN-223ENST00000619644 3227 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
SPOCK3Q9BQ16 AL139082.1-201ENST00000613982 3433 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
SPOCK3Q9BQ16 MRPL18-201ENST00000367034 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
SPOCK3Q9BQ16 PRAME-206ENST00000406503 740 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
SPOCK3Q9BQ16 AC133141.1-201ENST00000443015 339 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
SPOCK3Q9BQ16 CLDN25-201ENST00000453129 754 ntAPPRIS P1 BASIC12.05□□□□□ -0.48
SPOCK3Q9BQ16 AP000533.1-201ENST00000456143 1177 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
SPOCK3Q9BQ16 AC147876.1-201ENST00000504408 322 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
SPOCK3Q9BQ16 AC113347.2-201ENST00000512350 279 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
SPOCK3Q9BQ16 EXTL3-AS1-203ENST00000520023 780 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
SPOCK3Q9BQ16 AC027701.1-202ENST00000520988 459 ntTSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
SPOCK3Q9BQ16 AC104590.1-201ENST00000560813 648 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
SPOCK3Q9BQ16 MIR4746-201ENST00000579802 71 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
SPOCK3Q9BQ16 AC006116.2-201ENST00000589958 988 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
SPOCK3Q9BQ16 AC092953.2-201ENST00000608000 699 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
SPOCK3Q9BQ16 AL031673.1-201ENST00000611460 466 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
SPOCK3Q9BQ16 AC233280.19-201ENST00000633223 136 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
SPOCK3Q9BQ16 LINC02498-201ENST00000635390 1065 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
SPOCK3Q9BQ16 AC110057.1-201ENST00000636031 898 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
SPOCK3Q9BQ16 FAM226B-201ENST00000602508 1490 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
SPOCK3Q9BQ16 ABLIM2-209ENST00000505872 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
SPOCK3Q9BQ16 PDE9A-201ENST00000291539 2058 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
SPOCK3Q9BQ16 ECD-205ENST00000454759 2084 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
SPOCK3Q9BQ16 GSTCD-206ENST00000507281 2091 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
SPOCK3Q9BQ16 EID1-201ENST00000530028 2298 ntAPPRIS P1 BASIC12.05□□□□□ -0.48
SPOCK3Q9BQ16 ILDR1-201ENST00000273691 2659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
SPOCK3Q9BQ16 SPHK2-206ENST00000598088 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
SPOCK3Q9BQ16 GPD1-201ENST00000301149 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
SPOCK3Q9BQ16 TSC2-203ENST00000382538 5264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
SPOCK3Q9BQ16 ATP6V1C1-202ENST00000518738 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
SPOCK3Q9BQ16 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
SPOCK3Q9BQ16 DAO-208ENST00000551281 1345 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
SPOCK3Q9BQ16 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
SPOCK3Q9BQ16 GATA2-201ENST00000341105 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
SPOCK3Q9BQ16 C11orf21-201ENST00000381153 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
SPOCK3Q9BQ16 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
SPOCK3Q9BQ16 EIF5-202ENST00000392715 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
SPOCK3Q9BQ16 AC005562.1-201ENST00000583030 3219 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
SPOCK3Q9BQ16 HCFC2-201ENST00000229330 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
SPOCK3Q9BQ16 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
SPOCK3Q9BQ16 TMCO3-207ENST00000474393 2843 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
SPOCK3Q9BQ16 GULP1-207ENST00000409843 2643 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
SPOCK3Q9BQ16 EFHC1-212ENST00000635984 3293 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
SPOCK3Q9BQ16 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
SPOCK3Q9BQ16 AFDN-203ENST00000366806 5962 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
SPOCK3Q9BQ16 SLCO4C1-201ENST00000310954 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
SPOCK3Q9BQ16 ITPR3-202ENST00000605930 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
SPOCK3Q9BQ16 CASP2-207ENST00000619992 4006 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
SPOCK3Q9BQ16 KIAA0930-201ENST00000251993 2723 ntTSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
SPOCK3Q9BQ16 TECTB-201ENST00000369422 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
SPOCK3Q9BQ16 CEP295NL-201ENST00000322630 2090 ntTSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
SPOCK3Q9BQ16 TUNAR-201ENST00000503525 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
SPOCK3Q9BQ16 CNMD-203ENST00000448904 1444 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
SPOCK3Q9BQ16 USP19-206ENST00000417901 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
SPOCK3Q9BQ16 GNPDA1-210ENST00000508177 2980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
SPOCK3Q9BQ16 SYN2-205ENST00000620175 3871 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
SPOCK3Q9BQ16 SALL4P6-201ENST00000429385 1691 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
SPOCK3Q9BQ16 IFT22-210ENST00000517481 1657 ntTSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
SPOCK3Q9BQ16 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
SPOCK3Q9BQ16 METTL13-202ENST00000362019 3022 ntTSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
SPOCK3Q9BQ16 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
SPOCK3Q9BQ16 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
SPOCK3Q9BQ16 DCST2-202ENST00000368424 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
SPOCK3Q9BQ16 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
SPOCK3Q9BQ16 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
SPOCK3Q9BQ16 ATXN10-202ENST00000381061 3135 ntTSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
SPOCK3Q9BQ16 CAMP-201ENST00000296435 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
SPOCK3Q9BQ16 U3.5-201ENST00000363448 216 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
SPOCK3Q9BQ16 KRTAP2-3-201ENST00000391418 875 ntAPPRIS P1 BASIC12.04□□□□□ -0.48
SPOCK3Q9BQ16 HLA-DMA-202ENST00000395303 1007 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
SPOCK3Q9BQ16 HMGA1P1-201ENST00000415560 1062 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
SPOCK3Q9BQ16 AC010740.1-201ENST00000417035 684 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
SPOCK3Q9BQ16 AC136604.1-202ENST00000425471 771 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
SPOCK3Q9BQ16 AL773545.2-201ENST00000442149 472 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
SPOCK3Q9BQ16 AC137579.2-201ENST00000517714 551 ntTSL 4 BASIC12.04□□□□□ -0.48
SPOCK3Q9BQ16 DHDDS-217ENST00000526219 1072 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
SPOCK3Q9BQ16 AC091304.3-201ENST00000566500 716 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
SPOCK3Q9BQ16 AC023389.1-201ENST00000577846 576 ntTSL 4 BASIC12.04□□□□□ -0.48
SPOCK3Q9BQ16 AC130324.1-201ENST00000584157 831 ntTSL 3 BASIC12.04□□□□□ -0.48
SPOCK3Q9BQ16 AC009950.1-210ENST00000594622 553 ntTSL 3 BASIC12.04□□□□□ -0.48
SPOCK3Q9BQ16 AC026336.4-201ENST00000624565 1050 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
SPOCK3Q9BQ16 PNPT1-207ENST00000625249 216 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
SPOCK3Q9BQ16 OR10R2-202ENST00000641067 1132 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
SPOCK3Q9BQ16 MX1-218ENST00000619682 1980 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.6 ms