Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFW9

MYRIP, Rab effector MyRIP, humanhuman

Predictions only

Length 859 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYRIPQ8NFW9 TSPO-202ENST00000337554 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
MYRIPQ8NFW9 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
MYRIPQ8NFW9 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
MYRIPQ8NFW9 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
MYRIPQ8NFW9 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
MYRIPQ8NFW9 AC093433.1-201ENST00000458048 571 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
MYRIPQ8NFW9 AC106047.1-202ENST00000467484 482 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
MYRIPQ8NFW9 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
MYRIPQ8NFW9 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
MYRIPQ8NFW9 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
MYRIPQ8NFW9 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC14.73□□□□□ -0.05
MYRIPQ8NFW9 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
MYRIPQ8NFW9 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
MYRIPQ8NFW9 MIR4687-201ENST00000583618 80 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
MYRIPQ8NFW9 AC008805.2-201ENST00000590069 435 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
MYRIPQ8NFW9 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
MYRIPQ8NFW9 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
MYRIPQ8NFW9 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
MYRIPQ8NFW9 SMIM11B-202ENST00000619874 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
MYRIPQ8NFW9 AL035252.4-201ENST00000624174 288 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
MYRIPQ8NFW9 LINC00893-215ENST00000618757 2347 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
MYRIPQ8NFW9 SV2A-202ENST00000369146 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
MYRIPQ8NFW9 GTF3C2-214ENST00000622534 1858 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
MYRIPQ8NFW9 RPL10-218ENST00000618723 2210 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
MYRIPQ8NFW9 AC005865.1-201ENST00000432994 3004 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
MYRIPQ8NFW9 PIGG-201ENST00000310340 3203 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
MYRIPQ8NFW9 PSMD12-201ENST00000356126 4406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
MYRIPQ8NFW9 OPRK1-201ENST00000265572 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
MYRIPQ8NFW9 STXBP1-221ENST00000637953 3925 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
MYRIPQ8NFW9 GPC6-201ENST00000377047 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
MYRIPQ8NFW9 ATP4A-201ENST00000262623 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
MYRIPQ8NFW9 METTL13-201ENST00000361735 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
MYRIPQ8NFW9 ANO1-207ENST00000530676 3289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
MYRIPQ8NFW9 NAP1L1-201ENST00000261182 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
MYRIPQ8NFW9 PASK-201ENST00000234040 4572 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
MYRIPQ8NFW9 TSEN2-204ENST00000415684 2279 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
MYRIPQ8NFW9 PRUNE1-205ENST00000368937 1850 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
MYRIPQ8NFW9 FP325330.2-201ENST00000624219 5630 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
MYRIPQ8NFW9 POC1B-GALNT4-202ENST00000548729 5436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
MYRIPQ8NFW9 CACNA1G-227ENST00000513964 6735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
MYRIPQ8NFW9 LINC00943-204ENST00000537374 1688 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
MYRIPQ8NFW9 RMND5B-212ENST00000542098 1681 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
MYRIPQ8NFW9 RBFOX1-208ENST00000547372 3524 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
MYRIPQ8NFW9 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
MYRIPQ8NFW9 GPR17-206ENST00000544369 2598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
MYRIPQ8NFW9 EMBP1-203ENST00000622787 4235 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
MYRIPQ8NFW9 IRAK2-201ENST00000256458 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
MYRIPQ8NFW9 ARHGAP25-201ENST00000409030 2936 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
MYRIPQ8NFW9 ARHGAP25-203ENST00000409220 2939 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
MYRIPQ8NFW9 AL021392.1-201ENST00000426112 2949 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
MYRIPQ8NFW9 AL031666.1-201ENST00000413818 1809 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
MYRIPQ8NFW9 TSPOAP1-201ENST00000268893 7483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
MYRIPQ8NFW9 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
MYRIPQ8NFW9 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
MYRIPQ8NFW9 ACTBP8-201ENST00000403258 1108 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
MYRIPQ8NFW9 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC14.72□□□□□ -0.05
MYRIPQ8NFW9 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC14.72□□□□□ -0.05
MYRIPQ8NFW9 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
MYRIPQ8NFW9 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
MYRIPQ8NFW9 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
MYRIPQ8NFW9 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
MYRIPQ8NFW9 TJP2-209ENST00000539225 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
MYRIPQ8NFW9 RBM7-207ENST00000544582 692 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
MYRIPQ8NFW9 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.72□□□□□ -0.05
MYRIPQ8NFW9 AC012645.3-203ENST00000567153 520 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
MYRIPQ8NFW9 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
MYRIPQ8NFW9 AC138466.3-201ENST00000619983 221 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
MYRIPQ8NFW9 ELN-205ENST00000358929 3967 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
MYRIPQ8NFW9 RNF43-201ENST00000407977 5516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
MYRIPQ8NFW9 PAK1-215ENST00000530617 3001 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
MYRIPQ8NFW9 MBP-207ENST00000397865 2127 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
MYRIPQ8NFW9 PGGHG-203ENST00000409548 3687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
MYRIPQ8NFW9 TGM1-202ENST00000544573 1581 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
MYRIPQ8NFW9 CYP4F3-206ENST00000591058 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
MYRIPQ8NFW9 UQCRB-201ENST00000287022 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
MYRIPQ8NFW9 FAM222B-209ENST00000581407 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
MYRIPQ8NFW9 NUP160-201ENST00000378460 5376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
MYRIPQ8NFW9 STXBP1-220ENST00000637521 2068 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
MYRIPQ8NFW9 AL805961.2-201ENST00000642139 4817 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
MYRIPQ8NFW9 ZNF143-203ENST00000396602 2947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
MYRIPQ8NFW9 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
MYRIPQ8NFW9 FAM167A-AS1-203ENST00000624614 1357 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
MYRIPQ8NFW9 PMEL-204ENST00000548493 2204 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
MYRIPQ8NFW9 ARL4A-203ENST00000396663 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
MYRIPQ8NFW9 KLKP1-203ENST00000600104 1532 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
MYRIPQ8NFW9 CMIP-202ENST00000537098 4357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
MYRIPQ8NFW9 PSMG2-201ENST00000317615 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
MYRIPQ8NFW9 AP000347.1-201ENST00000417194 5004 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
MYRIPQ8NFW9 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
MYRIPQ8NFW9 CEP83-201ENST00000339839 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
MYRIPQ8NFW9 FAM196A-201ENST00000424811 3149 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
MYRIPQ8NFW9 PUDP-201ENST00000381077 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
MYRIPQ8NFW9 OS9-220ENST00000552285 2135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
MYRIPQ8NFW9 AL132656.4-201ENST00000623504 2122 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
MYRIPQ8NFW9 TADA3-204ENST00000440161 1617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
MYRIPQ8NFW9 XKR9-203ENST00000520030 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
MYRIPQ8NFW9 SGK1-220ENST00000524929 2594 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
MYRIPQ8NFW9 ZNF542P-207ENST00000495307 3393 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
MYRIPQ8NFW9 CACNA2D2-202ENST00000360963 5272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
MYRIPQ8NFW9 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.8 ms