Protein–RNA interactions for Protein: Q13449

LSAMP, Limbic system-associated membrane protein, humanhuman

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Length 338 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSAMPQ13449 PGGHG-203ENST00000409548 3687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
LSAMPQ13449 STK26-204ENST00000481105 1835 ntTSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
LSAMPQ13449 BEST1-208ENST00000534553 1829 ntTSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
LSAMPQ13449 WDR70-201ENST00000265107 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
LSAMPQ13449 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
LSAMPQ13449 AC093797.1-201ENST00000411847 1789 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
LSAMPQ13449 ITIH5-209ENST00000613909 2916 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
LSAMPQ13449 GLUL-204ENST00000417584 4065 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
LSAMPQ13449 BAHCC1-201ENST00000307745 10342 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
LSAMPQ13449 GJB1-201ENST00000361726 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
LSAMPQ13449 C12orf66-201ENST00000311915 2698 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
LSAMPQ13449 DDI1-201ENST00000302259 2609 ntAPPRIS P1 BASIC12.48□□□□□ -0.41
LSAMPQ13449 KIR2DL3-201ENST00000342376 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
LSAMPQ13449 COX4I1-208ENST00000564903 1481 ntTSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
LSAMPQ13449 NCOR2-201ENST00000356219 7226 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
LSAMPQ13449 IVD-203ENST00000479013 4251 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
LSAMPQ13449 PKM-202ENST00000335181 2318 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
LSAMPQ13449 KIAA1614-202ENST00000367588 9654 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
LSAMPQ13449 TCL1A-203ENST00000554012 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
LSAMPQ13449 HDAC7-202ENST00000354334 4065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
LSAMPQ13449 HDAC7-201ENST00000080059 4095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
LSAMPQ13449 TATDN2P2-201ENST00000403590 2226 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
LSAMPQ13449 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
LSAMPQ13449 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
LSAMPQ13449 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
LSAMPQ13449 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
LSAMPQ13449 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
LSAMPQ13449 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
LSAMPQ13449 EIF4G1-207ENST00000411531 4683 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
LSAMPQ13449 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC12.48□□□□□ -0.41
LSAMPQ13449 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
LSAMPQ13449 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC12.48□□□□□ -0.41
LSAMPQ13449 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
LSAMPQ13449 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC12.48□□□□□ -0.41
LSAMPQ13449 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
LSAMPQ13449 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
LSAMPQ13449 AC017007.3-201ENST00000479865 435 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
LSAMPQ13449 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
LSAMPQ13449 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
LSAMPQ13449 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC12.48□□□□□ -0.41
LSAMPQ13449 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
LSAMPQ13449 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC12.48□□□□□ -0.41
LSAMPQ13449 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
LSAMPQ13449 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
LSAMPQ13449 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.48□□□□□ -0.41
LSAMPQ13449 BX547991.1-201ENST00000582543 1206 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
LSAMPQ13449 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
LSAMPQ13449 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.48□□□□□ -0.41
LSAMPQ13449 POLR2E-204ENST00000586746 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.48□□□□□ -0.41
LSAMPQ13449 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
LSAMPQ13449 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC12.48□□□□□ -0.41
LSAMPQ13449 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
LSAMPQ13449 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
LSAMPQ13449 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC12.48□□□□□ -0.41
LSAMPQ13449 MTFR1L-201ENST00000374300 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
LSAMPQ13449 DIAPH2-203ENST00000373049 3730 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
LSAMPQ13449 GRM4-201ENST00000374177 3590 ntTSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
LSAMPQ13449 TTYH3-203ENST00000403167 4263 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
LSAMPQ13449 KIR3DL1-203ENST00000391728 1871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
LSAMPQ13449 HACD3-201ENST00000261875 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
LSAMPQ13449 ARL4A-203ENST00000396663 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
LSAMPQ13449 FXR1-220ENST00000491062 1768 ntTSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
LSAMPQ13449 EHD1-201ENST00000320631 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
LSAMPQ13449 AC005537.1-203ENST00000629291 1748 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
LSAMPQ13449 NR4A3-203ENST00000395097 3794 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
LSAMPQ13449 DCAF4-213ENST00000555042 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
LSAMPQ13449 IP6K2-221ENST00000449610 1673 ntTSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
LSAMPQ13449 ASPH-202ENST00000379449 1603 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
LSAMPQ13449 IRF5-208ENST00000473745 2282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
LSAMPQ13449 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
LSAMPQ13449 CST9-201ENST00000376971 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
LSAMPQ13449 SPRED2-201ENST00000356388 4097 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
LSAMPQ13449 TMEM78-201ENST00000323223 2175 ntAPPRIS P1 BASIC12.47□□□□□ -0.41
LSAMPQ13449 MAN2B2-201ENST00000285599 5143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
LSAMPQ13449 EXOC8-201ENST00000366645 5100 ntAPPRIS P1 BASIC12.47□□□□□ -0.41
LSAMPQ13449 ST3GAL1-211ENST00000522652 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
LSAMPQ13449 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
LSAMPQ13449 RAVER1-201ENST00000293677 3595 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
LSAMPQ13449 AC245140.2-201ENST00000624054 1939 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
LSAMPQ13449 LRRC8A-201ENST00000259324 4619 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
LSAMPQ13449 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
LSAMPQ13449 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
LSAMPQ13449 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
LSAMPQ13449 LMO1-201ENST00000335790 1279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
LSAMPQ13449 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
LSAMPQ13449 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.47□□□□□ -0.41
LSAMPQ13449 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
LSAMPQ13449 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC12.47□□□□□ -0.41
LSAMPQ13449 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
LSAMPQ13449 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
LSAMPQ13449 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
LSAMPQ13449 SPRY4-AS1-203ENST00000443800 566 ntTSL 3 BASIC12.47□□□□□ -0.41
LSAMPQ13449 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
LSAMPQ13449 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
LSAMPQ13449 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
LSAMPQ13449 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
LSAMPQ13449 LMO1-204ENST00000534484 770 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
LSAMPQ13449 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
LSAMPQ13449 TRMT112-205ENST00000539854 659 ntTSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
LSAMPQ13449 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.47□□□□□ -0.41
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