Protein–RNA interactions for Protein: P51532

SMARCA4, Transcription activator BRG1, humanhuman

Predictions only

Length 1,647 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCA4P51532 AL354704.1-201ENST00000629369 1966 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SMARCA4P51532 XPNPEP1-201ENST00000322238 2467 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SMARCA4P51532 ZNF30-202ENST00000439785 2651 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SMARCA4P51532 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SMARCA4P51532 L3MBTL1-202ENST00000373134 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SMARCA4P51532 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SMARCA4P51532 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SMARCA4P51532 CNPY1-203ENST00000636372 2259 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SMARCA4P51532 C16orf52-202ENST00000542527 4360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SMARCA4P51532 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SMARCA4P51532 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SMARCA4P51532 PSEN2-202ENST00000366783 2306 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SMARCA4P51532 FOLR1-201ENST00000312293 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SMARCA4P51532 RIPPLY2-201ENST00000369687 521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SMARCA4P51532 HBD-202ENST00000380299 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SMARCA4P51532 AC004771.2-201ENST00000430920 439 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SMARCA4P51532 AC253536.1-201ENST00000437021 315 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
SMARCA4P51532 MAP1LC3BP1-202ENST00000438342 516 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SMARCA4P51532 AC092944.1-204ENST00000475102 384 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SMARCA4P51532 AP3M2-205ENST00000517922 1094 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SMARCA4P51532 AC025682.1-203ENST00000584391 442 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SMARCA4P51532 PMP22-203ENST00000395938 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SMARCA4P51532 MPZ-204ENST00000491222 1824 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SMARCA4P51532 MED15-204ENST00000406969 3210 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SMARCA4P51532 AL359075.1-201ENST00000476232 2921 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SMARCA4P51532 WASH2P-202ENST00000538033 2800 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SMARCA4P51532 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SMARCA4P51532 SMN1-202ENST00000380707 1536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SMARCA4P51532 SMN2-203ENST00000380743 1536 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SMARCA4P51532 NLRX1-204ENST00000409991 3716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SMARCA4P51532 ZNF84-215ENST00000543758 3501 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SMARCA4P51532 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SMARCA4P51532 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SMARCA4P51532 STK3-218ENST00000617590 2485 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SMARCA4P51532 FAM90A12P-201ENST00000519497 2375 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
SMARCA4P51532 FAM90A24P-201ENST00000520792 2369 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
SMARCA4P51532 SETDB1-202ENST00000368962 1478 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SMARCA4P51532 ADGRG3-201ENST00000333493 2728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SMARCA4P51532 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SMARCA4P51532 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SMARCA4P51532 RCSD1-202ENST00000367854 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SMARCA4P51532 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SMARCA4P51532 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SMARCA4P51532 RPL5-202ENST00000370321 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SMARCA4P51532 IGKV6-21-201ENST00000390256 406 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SMARCA4P51532 LINC00106-201ENST00000430235 370 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SMARCA4P51532 AC004870.4-202ENST00000433337 455 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SMARCA4P51532 LINC00618-201ENST00000435624 700 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SMARCA4P51532 TEPP-202ENST00000441824 998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SMARCA4P51532 OR10V2P-201ENST00000525296 764 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
SMARCA4P51532 EEF1DP8-201ENST00000534760 536 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
SMARCA4P51532 MPI-212ENST00000565576 1148 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SMARCA4P51532 AC092327.1-201ENST00000596612 744 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
SMARCA4P51532 AL109615.2-201ENST00000455005 1608 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SMARCA4P51532 INPP5E-201ENST00000371712 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SMARCA4P51532 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SMARCA4P51532 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SMARCA4P51532 SLC35B3-201ENST00000379660 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SMARCA4P51532 ZKSCAN4-201ENST00000377294 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SMARCA4P51532 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SMARCA4P51532 MLXIPL-201ENST00000313375 3278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SMARCA4P51532 MLXIPL-206ENST00000434326 3252 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SMARCA4P51532 TBX6-202ENST00000395224 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SMARCA4P51532 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SMARCA4P51532 TMEM182-202ENST00000409528 3112 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SMARCA4P51532 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SMARCA4P51532 VSTM1-202ENST00000366170 654 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SMARCA4P51532 AC023590.1-202ENST00000366457 781 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SMARCA4P51532 ARF1P2-201ENST00000392493 538 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
SMARCA4P51532 AC010240.1-201ENST00000429606 459 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
SMARCA4P51532 DNM1P17-201ENST00000512082 426 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
SMARCA4P51532 FGL1-206ENST00000518650 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SMARCA4P51532 HNRNPA1P7-201ENST00000521273 963 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
SMARCA4P51532 MUTYH-236ENST00000529984 1029 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SMARCA4P51532 AL139022.1-202ENST00000553633 796 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SMARCA4P51532 ZNF226-212ENST00000588795 641 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SMARCA4P51532 AC092471.1-202ENST00000637160 999 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
SMARCA4P51532 TMPRSS2-202ENST00000398585 3240 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SMARCA4P51532 NFKBIA-208ENST00000557140 1400 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SMARCA4P51532 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SMARCA4P51532 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SMARCA4P51532 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SMARCA4P51532 ARHGEF1-202ENST00000347545 3091 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SMARCA4P51532 STRAP-202ENST00000419869 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SMARCA4P51532 ATP2A3-202ENST00000352011 3274 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SMARCA4P51532 PPM1K-201ENST00000295908 1940 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SMARCA4P51532 HFE-202ENST00000317896 1922 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SMARCA4P51532 CICP9-201ENST00000444451 1913 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
SMARCA4P51532 AC240565.1-201ENST00000624936 1373 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SMARCA4P51532 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SMARCA4P51532 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SMARCA4P51532 ACVR1C-202ENST00000335450 1501 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SMARCA4P51532 POPDC2-201ENST00000264231 1679 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SMARCA4P51532 HACD3-207ENST00000566074 1658 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SMARCA4P51532 HSDL1-201ENST00000219439 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SMARCA4P51532 FATE1-201ENST00000370350 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SMARCA4P51532 MIR646HG-204ENST00000427820 805 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SMARCA4P51532 PFN1P3-201ENST00000443612 402 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
SMARCA4P51532 AC007255.1-202ENST00000447171 889 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SMARCA4P51532 PFN1P4-201ENST00000450970 402 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.2 ms