Protein–RNA interactions for Protein: P42166

TMPO, Lamina-associated polypeptide 2, isoform alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 694 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMPOP42166 SEPT7-202ENST00000399034 4399 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TMPOP42166 RBM4-201ENST00000310092 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TMPOP42166 IGHG3-202ENST00000641136 2751 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TMPOP42166 SEC13-203ENST00000383801 1479 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TMPOP42166 ANKDD1A-207ENST00000496660 1477 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TMPOP42166 ZDHHC3-201ENST00000296127 3101 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TMPOP42166 SRL-202ENST00000537996 1814 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TMPOP42166 MMP7-201ENST00000260227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TMPOP42166 DYDC1-201ENST00000372202 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TMPOP42166 TSC22D3-202ENST00000372382 1216 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TMPOP42166 MRPS12-202ENST00000402029 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TMPOP42166 AL591242.1-201ENST00000422284 343 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TMPOP42166 MRPL43-211ENST00000477279 903 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TMPOP42166 UBR5-AS1-202ENST00000520820 800 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TMPOP42166 AP003031.2-205ENST00000531263 683 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TMPOP42166 CMTM1-219ENST00000533953 934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TMPOP42166 PIGT-208ENST00000545755 1158 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TMPOP42166 AL162632.1-201ENST00000546784 548 ntTSL 4 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TMPOP42166 AL137779.3-201ENST00000553295 729 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
TMPOP42166 APOC4-202ENST00000592954 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TMPOP42166 KXD1-211ENST00000599319 707 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TMPOP42166 RPL18A-203ENST00000599870 1084 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TMPOP42166 AP000553.2-201ENST00000609038 441 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
TMPOP42166 ALDOA-229ENST00000636698 420 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TMPOP42166 PPP6R2-204ENST00000395744 3293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TMPOP42166 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TMPOP42166 MIR600HG-201ENST00000449175 5984 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
TMPOP42166 SF1-202ENST00000334944 3094 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TMPOP42166 NSF-201ENST00000398238 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TMPOP42166 TAPBP-234ENST00000434618 3759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TMPOP42166 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TMPOP42166 ZNF570-202ENST00000586475 1985 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TMPOP42166 VWA5B2-202ENST00000426955 4120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TMPOP42166 ZNF596-201ENST00000308811 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TMPOP42166 OSBPL2-201ENST00000313733 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TMPOP42166 PPP1R8-203ENST00000373931 2651 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TMPOP42166 CNMD-203ENST00000448904 1444 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TMPOP42166 FUT6-205ENST00000527106 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TMPOP42166 CASC10-201ENST00000377113 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TMPOP42166 ALKBH1-201ENST00000216489 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TMPOP42166 TFEB-205ENST00000394283 2595 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TMPOP42166 PGAP2-204ENST00000396991 1798 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TMPOP42166 TMEM231-207ENST00000568377 2920 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TMPOP42166 KDM8-212ENST00000568965 1655 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
TMPOP42166 PPT1-213ENST00000641319 2388 ntBASIC17.71■□□□□ 0.42
TMPOP42166 VASH2-202ENST00000366964 2960 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TMPOP42166 PTN-202ENST00000393083 1599 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TMPOP42166 SNPH-202ENST00000381873 4995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TMPOP42166 ARHGAP45-201ENST00000313093 4273 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TMPOP42166 KCNH4-201ENST00000264661 3920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TMPOP42166 NUP98-204ENST00000397004 3923 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TMPOP42166 MXD1-206ENST00000540449 5580 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TMPOP42166 GOSR2-233ENST00000640068 3103 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TMPOP42166 UBE3B-202ENST00000342494 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TMPOP42166 TMEM25-201ENST00000313236 2409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TMPOP42166 RGMB-201ENST00000308234 4580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TMPOP42166 NFATC4-221ENST00000555453 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TMPOP42166 AL391097.1-201ENST00000432706 1620 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TMPOP42166 SNPH-203ENST00000614659 5354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TMPOP42166 GRM5-205ENST00000455756 7927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TMPOP42166 CRYBB3-201ENST00000215855 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TMPOP42166 IWS1-201ENST00000295321 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TMPOP42166 GDPGP1-201ENST00000329600 1193 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TMPOP42166 DPPA5-201ENST00000370370 679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TMPOP42166 RGR-203ENST00000372092 868 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TMPOP42166 LY86-202ENST00000379953 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TMPOP42166 IGHV5-51-201ENST00000390626 410 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TMPOP42166 HNRNPA1P33-201ENST00000421426 561 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
TMPOP42166 CORO1C-203ENST00000421578 1296 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TMPOP42166 RPL13AP19-201ENST00000434320 584 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
TMPOP42166 CLDN25-201ENST00000453129 754 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TMPOP42166 AL445471.1-201ENST00000456316 820 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TMPOP42166 VDAC1P11-201ENST00000458323 852 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
TMPOP42166 ALG1L7P-201ENST00000502317 768 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
TMPOP42166 ALG1L3P-201ENST00000503331 765 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
TMPOP42166 AL161668.2-201ENST00000531638 492 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TMPOP42166 EIF3K-202ENST00000538434 966 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TMPOP42166 SLC25A3-206ENST00000547534 556 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TMPOP42166 AC025154.2-203ENST00000550214 1031 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TMPOP42166 AC136944.4-201ENST00000568893 660 ntTSL 4 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TMPOP42166 CR589904.1-202ENST00000611154 660 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TMPOP42166 AL591926.3-201ENST00000611630 238 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
TMPOP42166 AC113385.2-201ENST00000614465 762 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
TMPOP42166 LINC00969-253ENST00000625338 804 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TMPOP42166 DNAJC17-212ENST00000627802 428 ntTSL 4 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TMPOP42166 AC104333.4-201ENST00000632866 554 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TMPOP42166 IP6K2-201ENST00000328631 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TMPOP42166 TRAPPC4-214ENST00000533632 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TMPOP42166 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TMPOP42166 SAP18-201ENST00000382533 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TMPOP42166 PRPSAP1-206ENST00000446526 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TMPOP42166 CLCN7-203ENST00000448525 4151 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TMPOP42166 MIR497HG-202ENST00000572453 3838 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
TMPOP42166 OPRL1-201ENST00000336866 3321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TMPOP42166 AC114271.1-201ENST00000612689 2813 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
TMPOP42166 NEK4-202ENST00000383721 2576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TMPOP42166 ZNF782-205ENST00000481138 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TMPOP42166 NDRG4-236ENST00000566192 3265 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TMPOP42166 KCTD9-201ENST00000221200 3401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TMPOP42166 MKRN1-201ENST00000255977 3151 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.3 ms