Protein–RNA interactions for Protein: P0DP42

TMEM225B, Transmembrane protein 225B, humanhuman

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM225BP0DP42 MYRIP-201ENST00000302541 5077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
TMEM225BP0DP42 AMT-221ENST00000538581 2038 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
TMEM225BP0DP42 AC067931.2-201ENST00000623655 2003 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
TMEM225BP0DP42 LRRN2-201ENST00000367175 5036 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
TMEM225BP0DP42 PJA1-203ENST00000374583 2692 ntAPPRIS P4 BASIC11.89□□□□□ -0.51
TMEM225BP0DP42 USP40-201ENST00000251722 5692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
TMEM225BP0DP42 ARID4A-206ENST00000431317 5783 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
TMEM225BP0DP42 CDC14B-201ENST00000375240 2547 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
TMEM225BP0DP42 C10orf105-201ENST00000398786 4730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
TMEM225BP0DP42 SARS-202ENST00000369923 1882 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
TMEM225BP0DP42 LINC01679-201ENST00000442815 2798 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
TMEM225BP0DP42 SHMT2-203ENST00000449049 2121 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
TMEM225BP0DP42 UNK-205ENST00000589666 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
TMEM225BP0DP42 GOLGA6L4-202ENST00000422563 4155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
TMEM225BP0DP42 FIBCD1-202ENST00000372338 3253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
TMEM225BP0DP42 UBL4B-201ENST00000334179 1478 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
TMEM225BP0DP42 CADM1-204ENST00000536727 3520 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
TMEM225BP0DP42 RAB8B-201ENST00000321437 4943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
TMEM225BP0DP42 CACNA1F-203ENST00000376265 6070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
TMEM225BP0DP42 TRGV9-201ENST00000444775 1735 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
TMEM225BP0DP42 FGFRL1-202ENST00000398484 3639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
TMEM225BP0DP42 ARHGAP33-203ENST00000314737 3858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
TMEM225BP0DP42 SLC35G2-201ENST00000393079 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
TMEM225BP0DP42 BCCIP-202ENST00000299130 2337 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
TMEM225BP0DP42 CARHSP1-217ENST00000611932 2833 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
TMEM225BP0DP42 QSOX1-202ENST00000367602 9311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
TMEM225BP0DP42 PNMA5-205ENST00000535214 3198 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
TMEM225BP0DP42 GCKR-201ENST00000264717 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
TMEM225BP0DP42 XBP1-204ENST00000405219 1690 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
TMEM225BP0DP42 ACVR1B-202ENST00000415850 1665 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
TMEM225BP0DP42 GSTM3-201ENST00000256594 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
TMEM225BP0DP42 CTTN-201ENST00000301843 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
TMEM225BP0DP42 DNAJC14-202ENST00000317287 2774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
TMEM225BP0DP42 CDK2-201ENST00000266970 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
TMEM225BP0DP42 SH3TC1-201ENST00000245105 4226 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
TMEM225BP0DP42 Z98257.2-202ENST00000641138 1548 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
TMEM225BP0DP42 ABCB7-203ENST00000373394 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
TMEM225BP0DP42 KIFC3-211ENST00000562903 3221 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
TMEM225BP0DP42 LPO-201ENST00000262290 2979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
TMEM225BP0DP42 RPS3-201ENST00000278572 907 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
TMEM225BP0DP42 CSH2-201ENST00000336844 1173 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
TMEM225BP0DP42 CSH2-202ENST00000345366 598 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
TMEM225BP0DP42 IGLV2-23-201ENST00000390306 502 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
TMEM225BP0DP42 CSH2-203ENST00000392886 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
TMEM225BP0DP42 ZNF589-204ENST00000440261 917 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
TMEM225BP0DP42 TAC3-208ENST00000441881 731 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
TMEM225BP0DP42 AC135178.1-201ENST00000458568 537 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
TMEM225BP0DP42 SNHG9-201ENST00000531523 275 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
TMEM225BP0DP42 CSH2-206ENST00000560142 749 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
TMEM225BP0DP42 CENPX-208ENST00000584347 799 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
TMEM225BP0DP42 ZNF519-206ENST00000589498 2117 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
TMEM225BP0DP42 AP005264.3-201ENST00000592370 485 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
TMEM225BP0DP42 FAM236A-201ENST00000593662 453 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
TMEM225BP0DP42 FAM236B-201ENST00000596535 465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
TMEM225BP0DP42 AL021707.6-201ENST00000609212 491 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
TMEM225BP0DP42 PRKN-211ENST00000615065 261 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
TMEM225BP0DP42 TAC3-211ENST00000615887 1120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
TMEM225BP0DP42 CYB5D1-203ENST00000571846 1870 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
TMEM225BP0DP42 RBM44-201ENST00000316997 4282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
TMEM225BP0DP42 EWSAT1-201ENST00000415504 2214 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
TMEM225BP0DP42 RASA4CP-203ENST00000446874 3193 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
TMEM225BP0DP42 C7orf57-202ENST00000420324 1957 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
TMEM225BP0DP42 HERPUD1-204ENST00000439977 2946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
TMEM225BP0DP42 AAAS-202ENST00000394384 1703 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
TMEM225BP0DP42 BMP4-206ENST00000559087 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
TMEM225BP0DP42 EHMT2-203ENST00000375537 3965 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
TMEM225BP0DP42 SLC39A6-204ENST00000590986 3003 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
TMEM225BP0DP42 NIT1-202ENST00000368008 2081 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
TMEM225BP0DP42 CYP4B1-202ENST00000371919 1494 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
TMEM225BP0DP42 COX4I1-208ENST00000564903 1481 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
TMEM225BP0DP42 SLC6A9-205ENST00000372310 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
TMEM225BP0DP42 PIK3CD-202ENST00000377346 5203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
TMEM225BP0DP42 EPN2-205ENST00000395626 2863 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
TMEM225BP0DP42 TNFRSF21-201ENST00000296861 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
TMEM225BP0DP42 DYNC1I1-201ENST00000324972 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
TMEM225BP0DP42 RUBCNL-201ENST00000378781 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
TMEM225BP0DP42 VPS13A-204ENST00000376634 10269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
TMEM225BP0DP42 ZMIZ1-202ENST00000446377 6686 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
TMEM225BP0DP42 ACIN1-204ENST00000397341 2738 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
TMEM225BP0DP42 VWA8-203ENST00000379310 7147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
TMEM225BP0DP42 FAM86C1-201ENST00000346333 2010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
TMEM225BP0DP42 RNFT2-201ENST00000257575 3882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
TMEM225BP0DP42 FAM237B-201ENST00000637645 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
TMEM225BP0DP42 MGAT1-205ENST00000446023 3175 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
TMEM225BP0DP42 KCNAB2-212ENST00000458166 1336 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
TMEM225BP0DP42 APOL5-201ENST00000249044 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
TMEM225BP0DP42 TARBP2-202ENST00000394357 1402 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
TMEM225BP0DP42 TMEM176B-204ENST00000447204 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
TMEM225BP0DP42 SLC47A1-206ENST00000571335 1415 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
TMEM225BP0DP42 PLAG1-203ENST00000429357 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
TMEM225BP0DP42 FGF10-AS1-201ENST00000502457 1894 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
TMEM225BP0DP42 CNOT7-211ENST00000523917 1885 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
TMEM225BP0DP42 TNFRSF8-201ENST00000263932 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
TMEM225BP0DP42 INTS6-201ENST00000311234 3662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
TMEM225BP0DP42 ARF3-201ENST00000256682 4105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
TMEM225BP0DP42 SLC36A1-201ENST00000243389 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
TMEM225BP0DP42 LINC00513-201ENST00000447430 1616 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
TMEM225BP0DP42 AL845472.1-202ENST00000624675 4080 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
TMEM225BP0DP42 ARSG-201ENST00000448504 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
TMEM225BP0DP42 FAM71E2-201ENST00000424985 3191 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.2 ms