Protein–RNA interactions for Protein: Q8WUD4

CCDC12, Coiled-coil domain-containing protein 12, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC12Q8WUD4 MAGEH1-201ENST00000342972 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC12Q8WUD4 ESPNL-202ENST00000409169 4441 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC12Q8WUD4 CCDC51-206ENST00000447018 1461 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC12Q8WUD4 LY86-201ENST00000230568 559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC12Q8WUD4 PGAM2-201ENST00000297283 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC12Q8WUD4 Z69890.1-201ENST00000382990 339 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC12Q8WUD4 TSPO-203ENST00000396265 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC12Q8WUD4 AC073210.1-201ENST00000414799 232 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC12Q8WUD4 LTF-202ENST00000417439 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC12Q8WUD4 AC078991.1-201ENST00000437297 610 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC12Q8WUD4 KRT18P62-201ENST00000446618 1287 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC12Q8WUD4 STK24P1-201ENST00000455035 1291 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC12Q8WUD4 LAMTOR4-209ENST00000488241 613 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC12Q8WUD4 RMDN1-218ENST00000523911 950 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC12Q8WUD4 LINC01475-201ENST00000548010 766 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC12Q8WUD4 AL132994.1-201ENST00000554098 400 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC12Q8WUD4 RN7SL470P-201ENST00000583069 259 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC12Q8WUD4 AC003043.1-201ENST00000588260 337 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC12Q8WUD4 PARD6G-AS1-205ENST00000589574 647 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC12Q8WUD4 AC111170.1-201ENST00000591110 1132 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC12Q8WUD4 HIST1H3C-201ENST00000612966 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC12Q8WUD4 AC079325.2-201ENST00000641710 606 ntAPPRIS P5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC12Q8WUD4 MKL1-201ENST00000355630 4496 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC12Q8WUD4 IL12RB1-203ENST00000593993 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC12Q8WUD4 TICRR-201ENST00000268138 6775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC12Q8WUD4 TOX2-202ENST00000358131 2605 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC12Q8WUD4 UQCC2-204ENST00000607484 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC12Q8WUD4 LINC01002-209ENST00000631858 1761 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC12Q8WUD4 UBE2I-204ENST00000397515 3109 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC12Q8WUD4 PIK3R3-203ENST00000420542 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC12Q8WUD4 FAM156A-208ENST00000615092 2098 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC12Q8WUD4 ATXN2L-215ENST00000564304 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC12Q8WUD4 SLC6A5-202ENST00000525748 7084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC12Q8WUD4 AC117503.4-201ENST00000623229 1418 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC12Q8WUD4 HIPK1-205ENST00000369558 8157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC12Q8WUD4 KYAT1-201ENST00000302586 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC12Q8WUD4 ABCB9-203ENST00000346530 3399 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC12Q8WUD4 CSPG4P12-202ENST00000559989 7790 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC12Q8WUD4 IKZF1-203ENST00000346667 5376 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC12Q8WUD4 MAP7D2-204ENST00000452324 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC12Q8WUD4 NPFFR1-201ENST00000277942 8921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC12Q8WUD4 HPS1-215ENST00000613394 3714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC12Q8WUD4 DDX31-202ENST00000372153 3285 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC12Q8WUD4 CFAP65-203ENST00000409865 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC12Q8WUD4 LINC00638-201ENST00000555578 2518 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC12Q8WUD4 NRG1-201ENST00000287842 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC12Q8WUD4 EDN1-201ENST00000379375 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC12Q8WUD4 SH3BGRL3-202ENST00000319041 768 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC12Q8WUD4 CAMKMT-203ENST00000403853 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC12Q8WUD4 AC018814.1-201ENST00000418972 357 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC12Q8WUD4 BX072579.1-201ENST00000449453 344 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC12Q8WUD4 AC025186.1-201ENST00000478174 870 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC12Q8WUD4 AC034231.1-201ENST00000507251 537 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC12Q8WUD4 FOS-206ENST00000555347 1280 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC12Q8WUD4 AC087741.1-205ENST00000572730 750 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC12Q8WUD4 ZNF530-203ENST00000597864 634 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC12Q8WUD4 AL031665.1-201ENST00000619766 572 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC12Q8WUD4 NR2F2-AS1-215ENST00000620029 1223 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC12Q8WUD4 TFEB-205ENST00000394283 2595 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC12Q8WUD4 BIRC2-208ENST00000532672 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC12Q8WUD4 ZNF581-203ENST00000587252 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC12Q8WUD4 ADAM17-203ENST00000497134 1873 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC12Q8WUD4 GALNT7-201ENST00000265000 4307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC12Q8WUD4 MPRIP-202ENST00000341712 3846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC12Q8WUD4 ANKRD30B-202ENST00000358984 4359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC12Q8WUD4 CCDC178-201ENST00000300227 3087 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC12Q8WUD4 CRYM-202ENST00000543948 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC12Q8WUD4 MMP14-201ENST00000311852 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC12Q8WUD4 RIMBP2-201ENST00000261655 6321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC12Q8WUD4 GLIPR1L2-201ENST00000320460 1729 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC12Q8WUD4 PDE2A-203ENST00000418754 2855 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC12Q8WUD4 KARS-201ENST00000302445 2005 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC12Q8WUD4 MED14-201ENST00000324817 7984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC12Q8WUD4 APCDD1L-AS1-203ENST00000427140 2092 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC12Q8WUD4 WDR46-231ENST00000374617 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC12Q8WUD4 BEGAIN-212ENST00000637716 3259 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC12Q8WUD4 MAP7D2-201ENST00000379643 3918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC12Q8WUD4 TMEM123-201ENST00000361236 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC12Q8WUD4 TJAP1-208ENST00000438588 2716 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC12Q8WUD4 DDC-214ENST00000622873 1839 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC12Q8WUD4 SLC26A6-213ENST00000455886 2460 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC12Q8WUD4 LIG1-203ENST00000536218 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC12Q8WUD4 AC091046.1-201ENST00000331871 207 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC12Q8WUD4 MAL-204ENST00000354078 831 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC12Q8WUD4 ACTBP14-201ENST00000411655 1089 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC12Q8WUD4 HIST2H2BA-201ENST00000412169 381 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC12Q8WUD4 ZMIZ1-AS1-202ENST00000440151 814 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC12Q8WUD4 AC093151.3-202ENST00000445073 709 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC12Q8WUD4 RPL7P35-201ENST00000446943 740 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC12Q8WUD4 MACROD2-AS1-202ENST00000455291 663 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC12Q8WUD4 DPY19L2P5-201ENST00000456300 331 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC12Q8WUD4 RPL18AP3-201ENST00000462885 528 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC12Q8WUD4 RN7SL181P-201ENST00000462921 277 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC12Q8WUD4 SOX2-OT-208ENST00000477928 902 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC12Q8WUD4 RPS23-204ENST00000507980 836 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC12Q8WUD4 AC100858.1-201ENST00000514059 1228 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC12Q8WUD4 IGHV1-12-201ENST00000518307 205 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC12Q8WUD4 LOXL1-AS1-207ENST00000565689 735 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC12Q8WUD4 AC007952.4-201ENST00000573866 637 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC12Q8WUD4 MIR3180-2-201ENST00000581748 88 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.4 ms