Protein–RNA interactions for Protein: Q2M3C7

SPHKAP, A-kinase anchor protein SPHKAP, humanhuman

Predictions only

Length 1,700 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPHKAPQ2M3C7 MIR1226-201ENST00000408658 75 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
SPHKAPQ2M3C7 IDI2-AS1-204ENST00000437374 896 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SPHKAPQ2M3C7 SVILP1-203ENST00000450581 486 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SPHKAPQ2M3C7 P2RX6P-202ENST00000450626 357 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
SPHKAPQ2M3C7 TBX5-AS1-202ENST00000531024 766 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SPHKAPQ2M3C7 AC069503.1-201ENST00000538710 816 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SPHKAPQ2M3C7 GLT8D2-204ENST00000547583 862 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SPHKAPQ2M3C7 AC011603.2-201ENST00000548149 675 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SPHKAPQ2M3C7 SNHG21-205ENST00000561107 790 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SPHKAPQ2M3C7 MARVELD3-205ENST00000567501 582 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SPHKAPQ2M3C7 AC136475.9-201ENST00000605240 497 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
SPHKAPQ2M3C7 AC097634.2-201ENST00000615819 604 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SPHKAPQ2M3C7 YAP1P1-201ENST00000401504 1393 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
SPHKAPQ2M3C7 GAPDHS-201ENST00000222286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SPHKAPQ2M3C7 SH3GLB2-206ENST00000417224 1468 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SPHKAPQ2M3C7 DNPEP-205ENST00000373972 1578 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SPHKAPQ2M3C7 CPPED1-203ENST00000433677 1993 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SPHKAPQ2M3C7 LINC00940-201ENST00000418006 2350 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SPHKAPQ2M3C7 MAN1B1-202ENST00000371589 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SPHKAPQ2M3C7 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SPHKAPQ2M3C7 CFAP65-204ENST00000410037 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SPHKAPQ2M3C7 PIGG-205ENST00000503111 2629 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SPHKAPQ2M3C7 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SPHKAPQ2M3C7 AIFM1P1-201ENST00000413342 1841 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
SPHKAPQ2M3C7 FHL2-208ENST00000409807 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SPHKAPQ2M3C7 SEC22C-205ENST00000417572 1513 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SPHKAPQ2M3C7 FOLR1-203ENST00000393679 1331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SPHKAPQ2M3C7 PDE3B-202ENST00000455098 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SPHKAPQ2M3C7 ZFP37-203ENST00000555206 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SPHKAPQ2M3C7 IDH3A-207ENST00000558554 1595 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SPHKAPQ2M3C7 USP8-219ENST00000625664 1568 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SPHKAPQ2M3C7 FBLN1-208ENST00000442170 2531 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SPHKAPQ2M3C7 AC106872.9-201ENST00000512437 1393 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
SPHKAPQ2M3C7 GYG2-201ENST00000353656 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SPHKAPQ2M3C7 MT-ND6-201ENST00000361681 525 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SPHKAPQ2M3C7 CRYBB2-201ENST00000398215 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SPHKAPQ2M3C7 AL606970.2-201ENST00000434596 470 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SPHKAPQ2M3C7 AL355500.1-201ENST00000439421 297 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SPHKAPQ2M3C7 RAI1-AS1-201ENST00000443696 724 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SPHKAPQ2M3C7 PGAP2-207ENST00000463452 931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SPHKAPQ2M3C7 CDK2AP2P2-201ENST00000478512 367 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
SPHKAPQ2M3C7 LINC01606-208ENST00000521653 557 ntTSL 4 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SPHKAPQ2M3C7 AP001922.5-201ENST00000527803 651 ntTSL 4 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SPHKAPQ2M3C7 THEG-204ENST00000530711 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SPHKAPQ2M3C7 ROM1-205ENST00000534093 862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SPHKAPQ2M3C7 AC034102.3-201ENST00000551846 300 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SPHKAPQ2M3C7 RAB42P1-201ENST00000555078 316 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
SPHKAPQ2M3C7 RN7SL300P-201ENST00000582522 318 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
SPHKAPQ2M3C7 AL109983.1-201ENST00000603234 646 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
SPHKAPQ2M3C7 FXYD3-212ENST00000605550 590 ntTSL 4 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SPHKAPQ2M3C7 MRPS31P4-202ENST00000613769 583 ntTSL 4 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SPHKAPQ2M3C7 NF1P11-201ENST00000621292 1282 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
SPHKAPQ2M3C7 AC021072.1-201ENST00000635789 835 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SPHKAPQ2M3C7 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SPHKAPQ2M3C7 NOP14-203ENST00000416614 3538 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SPHKAPQ2M3C7 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SPHKAPQ2M3C7 ZNF683-205ENST00000436292 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SPHKAPQ2M3C7 LIN9-201ENST00000328205 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SPHKAPQ2M3C7 FAM163A-201ENST00000341785 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SPHKAPQ2M3C7 DDC-206ENST00000431062 1620 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SPHKAPQ2M3C7 SLC4A9-203ENST00000506545 2838 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SPHKAPQ2M3C7 URGCP-207ENST00000453200 4042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SPHKAPQ2M3C7 CEP70-201ENST00000264982 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SPHKAPQ2M3C7 CAVIN1-201ENST00000357037 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SPHKAPQ2M3C7 RSPH9-201ENST00000372163 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SPHKAPQ2M3C7 AC012485.1-201ENST00000456601 2509 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SPHKAPQ2M3C7 AC073548.1-201ENST00000624088 1882 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
SPHKAPQ2M3C7 LINC00337-201ENST00000429480 1302 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SPHKAPQ2M3C7 CDCA3-202ENST00000422785 2760 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SPHKAPQ2M3C7 FZD6-206ENST00000523739 2774 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SPHKAPQ2M3C7 KDM2B-205ENST00000536437 2762 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SPHKAPQ2M3C7 SNX14-203ENST00000369627 3111 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SPHKAPQ2M3C7 HTR3D-202ENST00000382489 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SPHKAPQ2M3C7 SOX30-203ENST00000519442 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SPHKAPQ2M3C7 SEPT8-206ENST00000378706 4168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SPHKAPQ2M3C7 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SPHKAPQ2M3C7 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SPHKAPQ2M3C7 A1BG-AS1-203ENST00000594950 1718 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SPHKAPQ2M3C7 MED12L-203ENST00000422248 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SPHKAPQ2M3C7 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SPHKAPQ2M3C7 AC116347.1-201ENST00000442824 720 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
SPHKAPQ2M3C7 VAMP2-203ENST00000481878 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SPHKAPQ2M3C7 CMC2-202ENST00000486645 766 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SPHKAPQ2M3C7 RN7SKP195-201ENST00000516587 303 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
SPHKAPQ2M3C7 IFI27L1-203ENST00000553664 647 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SPHKAPQ2M3C7 NRSN2-205ENST00000608467 504 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SPHKAPQ2M3C7 Metazoa_SRP.152-201ENST00000614413 286 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
SPHKAPQ2M3C7 AC005906.2-208ENST00000638655 1286 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SPHKAPQ2M3C7 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SPHKAPQ2M3C7 ZNF606-204ENST00000547828 2680 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SPHKAPQ2M3C7 FUT6-205ENST00000527106 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SPHKAPQ2M3C7 NUP85-201ENST00000245544 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SPHKAPQ2M3C7 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SPHKAPQ2M3C7 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SPHKAPQ2M3C7 CCDC149-208ENST00000635206 2362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SPHKAPQ2M3C7 AC073862.5-201ENST00000624129 2027 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
SPHKAPQ2M3C7 RBP1-203ENST00000483943 1935 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SPHKAPQ2M3C7 OXGR1-204ENST00000543457 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SPHKAPQ2M3C7 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SPHKAPQ2M3C7 GFPT2-201ENST00000253778 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
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