Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQK8

LPIN3, Phosphatidate phosphatase LPIN3, humanhuman

Predictions only

Length 851 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LPIN3Q9BQK8 LILRA1-201ENST00000251372 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
LPIN3Q9BQK8 ERAL1-201ENST00000254928 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
LPIN3Q9BQK8 AC093899.2-201ENST00000513963 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
LPIN3Q9BQK8 CR382287.2-201ENST00000623370 1942 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
LPIN3Q9BQK8 ALOX15B-201ENST00000380173 2605 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
LPIN3Q9BQK8 SPATS2L-209ENST00000409988 2698 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
LPIN3Q9BQK8 DAGLB-201ENST00000297056 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
LPIN3Q9BQK8 CCER1-201ENST00000358859 2962 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
LPIN3Q9BQK8 FAM13B-203ENST00000425075 3098 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
LPIN3Q9BQK8 USP48-213ENST00000529637 3228 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
LPIN3Q9BQK8 DDX21-202ENST00000620315 4829 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
LPIN3Q9BQK8 ASAP1-202ENST00000518721 5507 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
LPIN3Q9BQK8 PRICKLE1-201ENST00000345127 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
LPIN3Q9BQK8 LMX1B-201ENST00000355497 5809 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
LPIN3Q9BQK8 ANKRD30B-202ENST00000358984 4359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
LPIN3Q9BQK8 GMCL1-201ENST00000282570 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
LPIN3Q9BQK8 INF2-209ENST00000617571 2956 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
LPIN3Q9BQK8 PFKP-203ENST00000381125 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
LPIN3Q9BQK8 AGAP5-201ENST00000374094 2394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
LPIN3Q9BQK8 PRR26-202ENST00000441152 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
LPIN3Q9BQK8 TLL1-201ENST00000061240 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
LPIN3Q9BQK8 ELAVL4-207ENST00000448907 1951 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
LPIN3Q9BQK8 C1QTNF9-202ENST00000382071 1854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
LPIN3Q9BQK8 AC073548.1-201ENST00000624088 1882 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
LPIN3Q9BQK8 GAP43-201ENST00000305124 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
LPIN3Q9BQK8 OXSM-201ENST00000280701 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
LPIN3Q9BQK8 SVOPL-202ENST00000419765 1523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
LPIN3Q9BQK8 Z84468.1-201ENST00000626321 1408 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
LPIN3Q9BQK8 DNMT3L-204ENST00000628202 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
LPIN3Q9BQK8 NSF-201ENST00000398238 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
LPIN3Q9BQK8 PGLYRP3-201ENST00000290722 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
LPIN3Q9BQK8 OR2K2-201ENST00000302681 1078 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
LPIN3Q9BQK8 MAL-204ENST00000354078 831 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
LPIN3Q9BQK8 AP002856.2-201ENST00000416553 584 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
LPIN3Q9BQK8 AC041040.1-201ENST00000425197 460 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
LPIN3Q9BQK8 PSMD4P1-201ENST00000433951 1109 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
LPIN3Q9BQK8 KRT18P46-201ENST00000435568 1279 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
LPIN3Q9BQK8 AP001057.1-201ENST00000437557 799 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
LPIN3Q9BQK8 LINC00892-203ENST00000454385 686 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
LPIN3Q9BQK8 ANKRD2-204ENST00000455090 1072 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
LPIN3Q9BQK8 IGKV1D-43-201ENST00000468879 532 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
LPIN3Q9BQK8 AC090136.2-201ENST00000517809 420 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
LPIN3Q9BQK8 HIST2H2BF-204ENST00000545683 999 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
LPIN3Q9BQK8 AC010186.1-201ENST00000546259 532 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
LPIN3Q9BQK8 FO393412.1-201ENST00000619841 382 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
LPIN3Q9BQK8 HEPACAM-201ENST00000298251 3602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
LPIN3Q9BQK8 FES-201ENST00000328850 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
LPIN3Q9BQK8 CCDC50-201ENST00000392455 8429 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
LPIN3Q9BQK8 DDX50-201ENST00000373585 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
LPIN3Q9BQK8 MBD1-212ENST00000585672 2532 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
LPIN3Q9BQK8 UBTF-205ENST00000526094 2459 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
LPIN3Q9BQK8 KIZ-213ENST00000620891 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
LPIN3Q9BQK8 AL139193.2-201ENST00000553712 1954 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
LPIN3Q9BQK8 TMEM182-201ENST00000409173 3198 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
LPIN3Q9BQK8 HES2-201ENST00000377834 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
LPIN3Q9BQK8 DDC-214ENST00000622873 1839 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.08
LPIN3Q9BQK8 RAB43-202ENST00000393304 4230 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.52□□□□□ -0.08
LPIN3Q9BQK8 EGR2-201ENST00000242480 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
LPIN3Q9BQK8 GLRX3-202ENST00000368644 3827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
LPIN3Q9BQK8 SYNPR-209ENST00000478300 2709 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
LPIN3Q9BQK8 TRIM17-203ENST00000366697 2652 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
LPIN3Q9BQK8 FAM153C-201ENST00000398106 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
LPIN3Q9BQK8 AC138028.2-202ENST00000567968 4528 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
LPIN3Q9BQK8 MTA3-203ENST00000406652 5484 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
LPIN3Q9BQK8 DNAJB8-201ENST00000319153 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
LPIN3Q9BQK8 PAIP2-201ENST00000265192 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
LPIN3Q9BQK8 ALG11-203ENST00000523764 1404 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
LPIN3Q9BQK8 AP1B1-208ENST00000432560 4146 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
LPIN3Q9BQK8 LARP7-202ENST00000344442 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
LPIN3Q9BQK8 ING4-207ENST00000446105 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
LPIN3Q9BQK8 NHP2-202ENST00000314397 599 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
LPIN3Q9BQK8 PPM1N-205ENST00000401705 771 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
LPIN3Q9BQK8 ACTBP14-201ENST00000411655 1089 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
LPIN3Q9BQK8 ID2-AS1-201ENST00000412712 953 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
LPIN3Q9BQK8 CCL24-202ENST00000416943 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
LPIN3Q9BQK8 AC147651.3-201ENST00000429872 731 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
LPIN3Q9BQK8 AC006372.2-201ENST00000433660 292 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
LPIN3Q9BQK8 AC017007.3-201ENST00000479865 435 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
LPIN3Q9BQK8 TRPC7-AS1-201ENST00000514459 460 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
LPIN3Q9BQK8 IMMP1L-202ENST00000526776 469 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
LPIN3Q9BQK8 PIGCP1-201ENST00000527583 895 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
LPIN3Q9BQK8 SAA2-206ENST00000530400 323 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
LPIN3Q9BQK8 AC016266.1-201ENST00000557558 729 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
LPIN3Q9BQK8 C17orf62-216ENST00000578919 841 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
LPIN3Q9BQK8 OVOL3-201ENST00000585332 695 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
LPIN3Q9BQK8 APOC4-202ENST00000592954 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
LPIN3Q9BQK8 AC006483.2-201ENST00000609813 515 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
LPIN3Q9BQK8 AL135936.1-201ENST00000617956 998 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
LPIN3Q9BQK8 STAG3L1-204ENST00000619870 1192 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
LPIN3Q9BQK8 AC126755.5-201ENST00000622756 267 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
LPIN3Q9BQK8 LINC00969-257ENST00000625632 898 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
LPIN3Q9BQK8 GNAS-213ENST00000371099 3709 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
LPIN3Q9BQK8 MED12L-202ENST00000309237 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
LPIN3Q9BQK8 DCAF5-209ENST00000557386 2883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
LPIN3Q9BQK8 TRMT10B-202ENST00000377753 2027 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
LPIN3Q9BQK8 UBE2I-201ENST00000325437 2832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
LPIN3Q9BQK8 PIK3R5-219ENST00000616147 4377 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
LPIN3Q9BQK8 ZNF596-201ENST00000308811 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
LPIN3Q9BQK8 USH1C-201ENST00000005226 2700 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
LPIN3Q9BQK8 MAGED4B-201ENST00000335504 2578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.2 ms