Protein–RNA interactions for Protein: P46100

ATRX, Transcriptional regulator ATRX, humanhuman

Predictions only

Length 2,492 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRXP46100 PGAM1P10-201ENST00000402426 761 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
ATRXP46100 BX072579.1-201ENST00000449453 344 ntTSL 3 BASIC12.36□□□□□ -0.43
ATRXP46100 AC011995.2-201ENST00000452701 574 ntTSL 4 BASIC12.36□□□□□ -0.43
ATRXP46100 AL356479.1-202ENST00000456933 714 ntTSL 3 BASIC12.36□□□□□ -0.43
ATRXP46100 HAX1-211ENST00000532105 771 ntTSL 3 BASIC12.36□□□□□ -0.43
ATRXP46100 RN7SL162P-201ENST00000579233 292 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
ATRXP46100 AP005264.6-201ENST00000592801 414 ntTSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
ATRXP46100 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
ATRXP46100 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
ATRXP46100 ASH2L-201ENST00000343823 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
ATRXP46100 DCDC2B-201ENST00000409358 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
ATRXP46100 ST5-256ENST00000534127 4545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
ATRXP46100 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
ATRXP46100 SPATA22-203ENST00000397168 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
ATRXP46100 USP10-201ENST00000219473 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
ATRXP46100 PTAFR-201ENST00000305392 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
ATRXP46100 DDX39B-201ENST00000376177 1529 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
ATRXP46100 UROC1-201ENST00000290868 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
ATRXP46100 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
ATRXP46100 Z82195.2-202ENST00000458525 1646 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
ATRXP46100 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
ATRXP46100 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
ATRXP46100 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
ATRXP46100 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
ATRXP46100 POLR1C-202ENST00000372344 1119 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
ATRXP46100 TPT1-203ENST00000379056 1101 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
ATRXP46100 AP001476.2-201ENST00000435738 355 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
ATRXP46100 AL162724.1-201ENST00000437461 373 ntTSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
ATRXP46100 HNRNPA1P30-202ENST00000440699 997 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
ATRXP46100 RPL18AP2-201ENST00000450007 482 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
ATRXP46100 RAB34-211ENST00000450529 1184 ntTSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
ATRXP46100 AC103925.1-201ENST00000453155 771 ntTSL 3 BASIC12.36□□□□□ -0.43
ATRXP46100 SNORA47-201ENST00000458862 138 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
ATRXP46100 RN7SL553P-201ENST00000482215 298 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
ATRXP46100 AC093072.1-201ENST00000589196 602 ntTSL 4 BASIC12.36□□□□□ -0.43
ATRXP46100 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
ATRXP46100 MYCNOS-202ENST00000641263 1313 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
ATRXP46100 E2F6-201ENST00000307236 3317 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
ATRXP46100 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
ATRXP46100 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
ATRXP46100 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
ATRXP46100 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
ATRXP46100 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
ATRXP46100 PARP1-203ENST00000366794 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
ATRXP46100 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC12.36□□□□□ -0.43
ATRXP46100 NDRG2-201ENST00000298684 1784 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
ATRXP46100 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
ATRXP46100 SLC38A5-210ENST00000595796 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
ATRXP46100 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
ATRXP46100 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
ATRXP46100 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC12.36□□□□□ -0.43
ATRXP46100 BAIAP3-216ENST00000628027 4732 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
ATRXP46100 MARVELD3-201ENST00000268485 2912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
ATRXP46100 KCNMA1-210ENST00000404771 4014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
ATRXP46100 LPGAT1-201ENST00000366996 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
ATRXP46100 ARHGAP4-202ENST00000370016 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
ATRXP46100 PRMT7-203ENST00000449359 2091 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
ATRXP46100 FURIN-207ENST00000618099 4345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
ATRXP46100 AC124319.4-201ENST00000622931 2161 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
ATRXP46100 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
ATRXP46100 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
ATRXP46100 CD300A-201ENST00000310828 631 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
ATRXP46100 SNRPC-202ENST00000374017 1054 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
ATRXP46100 TXLNGY-202ENST00000407724 1000 ntTSL 3 BASIC12.35□□□□□ -0.43
ATRXP46100 LINC01128-201ENST00000415295 894 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
ATRXP46100 AL512288.2-201ENST00000426041 367 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
ATRXP46100 AP005273.1-201ENST00000444862 522 ntTSL 3 BASIC12.35□□□□□ -0.43
ATRXP46100 RRNAD1-211ENST00000524343 459 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
ATRXP46100 KIAA1191-211ENST00000533553 560 ntTSL 3 BASIC12.35□□□□□ -0.43
ATRXP46100 FAM167A-AS1-202ENST00000533578 1222 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
ATRXP46100 AP000763.1-201ENST00000539481 325 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
ATRXP46100 SEPT4-AS1-203ENST00000580769 1000 ntTSL 3 BASIC12.35□□□□□ -0.43
ATRXP46100 AC239859.4-201ENST00000582255 675 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
ATRXP46100 PROX1-AS1-205ENST00000598091 720 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
ATRXP46100 AP006621.5-202ENST00000623692 636 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
ATRXP46100 BIN3-212ENST00000640731 450 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
ATRXP46100 OR2V1-205ENST00000642036 2609 ntAPPRIS P1 BASIC12.35□□□□□ -0.43
ATRXP46100 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
ATRXP46100 MYO9A-202ENST00000424560 4008 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
ATRXP46100 PSMB8-201ENST00000374881 1351 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
ATRXP46100 SLC39A11-202ENST00000542342 2752 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
ATRXP46100 BCL10-201ENST00000370580 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
ATRXP46100 KRT8P25-201ENST00000473150 1456 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
ATRXP46100 CA6-205ENST00000480186 1493 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
ATRXP46100 METTL7B-201ENST00000394252 1506 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
ATRXP46100 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
ATRXP46100 USP28-214ENST00000545540 3431 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
ATRXP46100 CEP131-201ENST00000269392 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
ATRXP46100 SOCS2-205ENST00000548537 3733 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
ATRXP46100 PRUNE1-205ENST00000368937 1850 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
ATRXP46100 EPN2-210ENST00000571254 1883 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
ATRXP46100 TOMM34-201ENST00000372813 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
ATRXP46100 WNT9B-202ENST00000393461 2654 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
ATRXP46100 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
ATRXP46100 DESI2-202ENST00000302550 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
ATRXP46100 SIGLEC9-201ENST00000250360 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
ATRXP46100 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
ATRXP46100 ASS1-201ENST00000352480 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
ATRXP46100 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
ATRXP46100 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
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