Protein–RNA interactions for Protein: P43121

MCAM, Cell surface glycoprotein MUC18, humanhuman

Predictions only

Length 646 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCAMP43121 COX20P1-201ENST00000366529 357 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
MCAMP43121 AL359853.1-202ENST00000415218 544 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
MCAMP43121 AL590093.1-201ENST00000416119 623 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
MCAMP43121 LINC01523-201ENST00000425385 450 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
MCAMP43121 LINC00700-202ENST00000438372 777 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
MCAMP43121 LINC00399-201ENST00000439008 414 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
MCAMP43121 VENTXP4-201ENST00000449029 958 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
MCAMP43121 NDUFB2P1-201ENST00000506966 295 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
MCAMP43121 AC090001.1-201ENST00000553194 467 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
MCAMP43121 AP003071.1-201ENST00000567925 622 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
MCAMP43121 AL022344.2-201ENST00000568976 968 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
MCAMP43121 TMEM220-AS1-207ENST00000584714 541 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
MCAMP43121 MCEMP1-202ENST00000597445 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
MCAMP43121 AC016586.1-201ENST00000600056 684 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
MCAMP43121 Metazoa_SRP.153-201ENST00000620153 341 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
MCAMP43121 PLEKHO2-202ENST00000616065 3569 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MCAMP43121 PHTF1-203ENST00000369600 3075 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
MCAMP43121 MLX-202ENST00000346833 2334 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MCAMP43121 RTN3-210ENST00000540798 3124 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MCAMP43121 PCDHA5-201ENST00000529619 4157 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MCAMP43121 PROZ-201ENST00000342783 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MCAMP43121 AADACL4-201ENST00000376221 1575 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
MCAMP43121 C4A-259ENST00000498271 5269 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MCAMP43121 ATP2B2-210ENST00000638646 3465 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
MCAMP43121 HGNC:18790-201ENST00000397958 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
MCAMP43121 SPATS2L-209ENST00000409988 2698 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
MCAMP43121 KDELC2-201ENST00000323468 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MCAMP43121 POLN-210ENST00000511885 3253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
MCAMP43121 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MCAMP43121 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MCAMP43121 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MCAMP43121 ATP2C1-201ENST00000328560 3484 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MCAMP43121 NUP50-201ENST00000347635 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MCAMP43121 STXBP1-201ENST00000373299 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MCAMP43121 ANKMY1-204ENST00000391987 3221 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
MCAMP43121 TMEM123-201ENST00000361236 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MCAMP43121 OS9-203ENST00000389142 2457 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
MCAMP43121 COPS7B-223ENST00000611614 2468 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
MCAMP43121 NRP1-202ENST00000374816 2804 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MCAMP43121 PTN-202ENST00000393083 1599 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
MCAMP43121 RRP1B-201ENST00000340648 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MCAMP43121 PTGER4P2-201ENST00000328411 252 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
MCAMP43121 ASNA1-201ENST00000357332 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MCAMP43121 KCNK16-204ENST00000437525 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MCAMP43121 LINC00313-207ENST00000451543 413 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
MCAMP43121 AL353150.1-201ENST00000456944 583 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
MCAMP43121 PTGER4P3-201ENST00000458150 252 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
MCAMP43121 TCEAL4-206ENST00000468024 1135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MCAMP43121 AC025594.1-201ENST00000469533 543 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
MCAMP43121 SEPHS2P1-201ENST00000511618 1162 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
MCAMP43121 SRPK2P-201ENST00000523408 1100 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
MCAMP43121 AC017033.1-201ENST00000603720 708 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
MCAMP43121 PEBP1P2-201ENST00000603980 558 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
MCAMP43121 MYOZ3-209ENST00000615557 1031 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
MCAMP43121 LINC01669-201ENST00000623161 413 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
MCAMP43121 AC010531.8-201ENST00000623341 685 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
MCAMP43121 SMYD5-209ENST00000629411 246 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
MCAMP43121 GSTT2-203ENST00000634759 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MCAMP43121 ADH1B-207ENST00000639454 1210 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
MCAMP43121 CEP112-202ENST00000392769 3517 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
MCAMP43121 SPOCK3-210ENST00000506886 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
MCAMP43121 ELP2-221ENST00000542824 2288 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MCAMP43121 NRAS-201ENST00000369535 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MCAMP43121 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MCAMP43121 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MCAMP43121 FERMT3-201ENST00000279227 2489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MCAMP43121 ARHGEF9-230ENST00000637178 2145 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
MCAMP43121 AL031587.5-201ENST00000624344 1849 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
MCAMP43121 ZSCAN5DP-201ENST00000600684 1488 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
MCAMP43121 MAD1L1-204ENST00000406869 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MCAMP43121 LINC00967-203ENST00000518035 1502 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
MCAMP43121 CFAP52-202ENST00000396219 1912 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
MCAMP43121 SLC5A11-211ENST00000569071 1919 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
MCAMP43121 HNRNPUL1-205ENST00000593587 2725 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
MCAMP43121 DMC1-207ENST00000616615 1595 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MCAMP43121 MAGI3-202ENST00000369611 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MCAMP43121 PPP1R26P2-201ENST00000611403 3595 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
MCAMP43121 NOBOX-201ENST00000467773 2076 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
MCAMP43121 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MCAMP43121 DDX20-201ENST00000369702 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MCAMP43121 CYB5R2-201ENST00000299498 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MCAMP43121 SIRPB3P-201ENST00000340424 1216 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
MCAMP43121 TMEM14B-201ENST00000379530 787 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
MCAMP43121 CD37-203ENST00000426897 1204 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
MCAMP43121 AL020996.1-201ENST00000442055 435 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
MCAMP43121 AL138731.1-201ENST00000452624 739 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
MCAMP43121 MTHFD2P7-201ENST00000483867 983 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
MCAMP43121 DMKN-256ENST00000492341 738 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
MCAMP43121 AC010234.1-201ENST00000494599 870 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
MCAMP43121 NSD1-211ENST00000511258 809 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
MCAMP43121 FXYD6-FXYD2-201ENST00000532984 670 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
MCAMP43121 CYB561A3-208ENST00000536915 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
MCAMP43121 AC145422.1-201ENST00000541574 544 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
MCAMP43121 WNT5B-206ENST00000542408 508 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
MCAMP43121 AC068831.5-201ENST00000557387 328 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
MCAMP43121 ATP2A1-AS1-201ENST00000561547 558 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
MCAMP43121 AC003070.1-201ENST00000592389 457 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
MCAMP43121 AL451165.2-201ENST00000606971 718 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
MCAMP43121 Metazoa_SRP.127-201ENST00000614914 302 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
MCAMP43121 DDX17-202ENST00000396821 4791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
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