Protein–RNA interactions for Protein: Q96EB6

SIRT1, NAD-dependent protein deacetylase sirtuin-1, humanhuman

Predictions only

Length 747 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIRT1Q96EB6 AL391647.1-201ENST00000395664 511 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
SIRT1Q96EB6 Metazoa_SRP.8-201ENST00000398067 251 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
SIRT1Q96EB6 AC246787.2-202ENST00000418566 370 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SIRT1Q96EB6 AC079325.1-201ENST00000430386 857 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
SIRT1Q96EB6 AL662860.1-201ENST00000436804 877 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SIRT1Q96EB6 AC024028.1-201ENST00000437145 437 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SIRT1Q96EB6 AL669831.4-201ENST00000447500 872 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SIRT1Q96EB6 RPS15P5-201ENST00000449885 432 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
SIRT1Q96EB6 RN7SL677P-201ENST00000466970 319 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
SIRT1Q96EB6 AC008808.2-201ENST00000510349 569 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SIRT1Q96EB6 AAMDC-210ENST00000532481 690 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SIRT1Q96EB6 IFI27L1-209ENST00000555523 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SIRT1Q96EB6 NT5DC4-201ENST00000327581 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SIRT1Q96EB6 DDX19B-208ENST00000563392 1760 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SIRT1Q96EB6 TMPRSS3-204ENST00000433957 2403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SIRT1Q96EB6 ANKRD50-202ENST00000515641 4212 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SIRT1Q96EB6 GRIK4-208ENST00000638419 3593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SIRT1Q96EB6 BLK-201ENST00000259089 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SIRT1Q96EB6 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SIRT1Q96EB6 SLC9B2-202ENST00000394785 3126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SIRT1Q96EB6 DNM1L-220ENST00000549701 2487 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SIRT1Q96EB6 FMR1-218ENST00000621447 1832 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SIRT1Q96EB6 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SIRT1Q96EB6 AC012531.1-201ENST00000562848 2680 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
SIRT1Q96EB6 PCK2-216ENST00000561286 2012 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SIRT1Q96EB6 OSGIN1-201ENST00000343939 2391 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SIRT1Q96EB6 GOLGA8A-201ENST00000359187 1877 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SIRT1Q96EB6 ABI2-213ENST00000424558 2240 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SIRT1Q96EB6 ALPL-206ENST00000539907 2241 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SIRT1Q96EB6 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SIRT1Q96EB6 LILRA5-201ENST00000432233 1363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SIRT1Q96EB6 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SIRT1Q96EB6 SLC2A14-205ENST00000535295 1732 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SIRT1Q96EB6 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SIRT1Q96EB6 IMPDH1-204ENST00000419067 2431 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SIRT1Q96EB6 GMPR2-224ENST00000559910 1562 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SIRT1Q96EB6 XPNPEP1-201ENST00000322238 2467 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SIRT1Q96EB6 MIR100HG-219ENST00000533109 1794 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SIRT1Q96EB6 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SIRT1Q96EB6 ZNF30-202ENST00000439785 2651 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SIRT1Q96EB6 TAF4B-203ENST00000578121 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SIRT1Q96EB6 RAB40A-201ENST00000304236 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SIRT1Q96EB6 MYL7-201ENST00000223364 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SIRT1Q96EB6 CRYZL1-205ENST00000399442 612 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SIRT1Q96EB6 ATP5J-204ENST00000400093 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SIRT1Q96EB6 GSTM2P1-201ENST00000405166 654 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
SIRT1Q96EB6 CLDN10-AS1-201ENST00000416909 895 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SIRT1Q96EB6 LINC01678-202ENST00000424921 475 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SIRT1Q96EB6 HMGA1P2-201ENST00000430198 324 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
SIRT1Q96EB6 AC108112.1-201ENST00000505567 659 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SIRT1Q96EB6 BBOX1-AS1-203ENST00000530430 879 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SIRT1Q96EB6 BBOX1-AS1-204ENST00000531363 745 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SIRT1Q96EB6 AC025219.1-201ENST00000559299 526 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SIRT1Q96EB6 SMIM28-201ENST00000573100 855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SIRT1Q96EB6 SNORD55-201ENST00000581525 80 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
SIRT1Q96EB6 AC091691.1-201ENST00000583587 1018 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
SIRT1Q96EB6 AC005332.2-201ENST00000590010 930 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
SIRT1Q96EB6 BIRC5-211ENST00000592734 386 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SIRT1Q96EB6 AC063977.2-201ENST00000601996 421 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
SIRT1Q96EB6 AL078624.1-201ENST00000604004 547 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
SIRT1Q96EB6 AC136475.9-201ENST00000605240 497 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
SIRT1Q96EB6 MRPS31P4-202ENST00000613769 583 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SIRT1Q96EB6 AC134878.2-201ENST00000620700 1265 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
SIRT1Q96EB6 AC245369.8-201ENST00000636589 306 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
SIRT1Q96EB6 IL9R-202ENST00000369423 2032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SIRT1Q96EB6 AC072061.1-201ENST00000569710 2234 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
SIRT1Q96EB6 NIT1-202ENST00000368008 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SIRT1Q96EB6 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SIRT1Q96EB6 IMPDH1P5-201ENST00000439688 1540 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
SIRT1Q96EB6 AKT1S1-205ENST00000391833 3640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SIRT1Q96EB6 CACTIN-203ENST00000429344 3612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SIRT1Q96EB6 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SIRT1Q96EB6 LINC01137-201ENST00000424989 1395 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SIRT1Q96EB6 ADPRH-202ENST00000465513 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SIRT1Q96EB6 NFATC4-212ENST00000554473 1382 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SIRT1Q96EB6 AC244154.1-201ENST00000620148 1555 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
SIRT1Q96EB6 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SIRT1Q96EB6 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SIRT1Q96EB6 AC015656.1-201ENST00000624209 3578 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
SIRT1Q96EB6 LINC01341-202ENST00000421003 2600 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SIRT1Q96EB6 FTO-214ENST00000636218 2227 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SIRT1Q96EB6 MAGED2-207ENST00000396224 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SIRT1Q96EB6 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SIRT1Q96EB6 NFE2L1-218ENST00000583378 2051 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SIRT1Q96EB6 AC090099.1-203ENST00000527059 2945 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SIRT1Q96EB6 CNOT4-204ENST00000414802 1687 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SIRT1Q96EB6 BCAR1-205ENST00000420641 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SIRT1Q96EB6 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SIRT1Q96EB6 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SIRT1Q96EB6 EXOSC7-201ENST00000265564 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SIRT1Q96EB6 UMODL1-AS1-201ENST00000329015 2141 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SIRT1Q96EB6 LYG2-201ENST00000333017 862 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SIRT1Q96EB6 KHDC1L-201ENST00000370388 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SIRT1Q96EB6 NAT8B-201ENST00000377712 765 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SIRT1Q96EB6 MYH9-202ENST00000401701 789 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SIRT1Q96EB6 POLR3H-204ENST00000407461 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SIRT1Q96EB6 AL590399.1-204ENST00000430302 781 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SIRT1Q96EB6 PLAC9P1-203ENST00000440031 223 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
SIRT1Q96EB6 OAZ3-203ENST00000453029 729 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SIRT1Q96EB6 AL450346.2-201ENST00000495602 1024 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.1 ms