Protein–RNA interactions for Protein: Q13698

CACNA1S, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1S, humanhuman

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Length 1,873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1SQ13698 KRT16P4-202ENST00000580052 362 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CACNA1SQ13698 RN7SL460P-201ENST00000582806 258 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
CACNA1SQ13698 ZNF677-207ENST00000598806 701 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CACNA1SQ13698 AC009779.7-201ENST00000609031 469 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
CACNA1SQ13698 AC016526.4-201ENST00000636059 517 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CACNA1SQ13698 RHPN1-AS1-201ENST00000518049 1918 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
CACNA1SQ13698 REPS1-221ENST00000626459 3665 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CACNA1SQ13698 ZNF397-209ENST00000591206 1516 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CACNA1SQ13698 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CACNA1SQ13698 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CACNA1SQ13698 TTC39A-204ENST00000371750 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CACNA1SQ13698 RNF145-202ENST00000424310 3613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CACNA1SQ13698 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CACNA1SQ13698 AFAP1-203ENST00000382543 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CACNA1SQ13698 B4GALT6-201ENST00000237019 2128 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CACNA1SQ13698 PPHLN1-206ENST00000395580 1693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CACNA1SQ13698 MED6-201ENST00000256379 1995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CACNA1SQ13698 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CACNA1SQ13698 SLC2A11-223ENST00000611880 3264 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
CACNA1SQ13698 KRBOX4-203ENST00000377919 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.21
CACNA1SQ13698 SOD1-202ENST00000389995 865 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.21
CACNA1SQ13698 PIGL-202ENST00000395844 1257 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
CACNA1SQ13698 Metazoa_SRP.8-201ENST00000398067 251 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
CACNA1SQ13698 OR2T32P-201ENST00000403423 963 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
CACNA1SQ13698 AL138885.2-201ENST00000420389 539 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.21
CACNA1SQ13698 CTLA4-203ENST00000427473 969 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
CACNA1SQ13698 HAX1-204ENST00000457918 914 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CACNA1SQ13698 AC126177.4-201ENST00000547452 731 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
CACNA1SQ13698 AC005096.1-201ENST00000560499 622 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.21
CACNA1SQ13698 NSRP1-213ENST00000584423 482 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
CACNA1SQ13698 AC127002.1-201ENST00000619123 455 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
CACNA1SQ13698 AC005906.2-208ENST00000638655 1286 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
CACNA1SQ13698 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
CACNA1SQ13698 ANKS1B-208ENST00000547010 2595 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CACNA1SQ13698 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CACNA1SQ13698 TP73-207ENST00000378290 1831 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
CACNA1SQ13698 GNG4-201ENST00000366597 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CACNA1SQ13698 FAM183BP-201ENST00000409072 1595 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
CACNA1SQ13698 DEGS1-202ENST00000391877 1345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
CACNA1SQ13698 LINC01114-202ENST00000424321 2112 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
CACNA1SQ13698 IL6R-201ENST00000344086 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CACNA1SQ13698 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CACNA1SQ13698 AL512488.1-201ENST00000433544 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CACNA1SQ13698 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CACNA1SQ13698 ZCCHC7-209ENST00000534928 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CACNA1SQ13698 VOPP1-217ENST00000625836 1400 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CACNA1SQ13698 GRK6P1-201ENST00000400595 1711 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
CACNA1SQ13698 NRG1-201ENST00000287842 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CACNA1SQ13698 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CACNA1SQ13698 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CACNA1SQ13698 OSGIN1-201ENST00000343939 2391 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CACNA1SQ13698 TBX6-202ENST00000395224 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CACNA1SQ13698 SIGLEC17P-204ENST00000618545 1517 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CACNA1SQ13698 EGLN3-205ENST00000547327 2849 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
CACNA1SQ13698 MIR766-201ENST00000390223 111 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
CACNA1SQ13698 CACYBPP3-201ENST00000406011 625 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
CACNA1SQ13698 AL391903.1-201ENST00000407513 365 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
CACNA1SQ13698 AC024028.1-201ENST00000437145 437 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CACNA1SQ13698 AC116347.1-201ENST00000442824 720 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
CACNA1SQ13698 AC234582.2-201ENST00000455788 568 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CACNA1SQ13698 RN7SL477P-201ENST00000488440 286 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
CACNA1SQ13698 PRDM2-213ENST00000503842 705 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CACNA1SQ13698 CTB-178M22.2-201ENST00000519795 503 ntTSL 4 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CACNA1SQ13698 SLC22A18AS-202ENST00000526203 664 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CACNA1SQ13698 TATDN3-208ENST00000526997 794 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CACNA1SQ13698 TATDN3-213ENST00000531963 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CACNA1SQ13698 MIR4539-201ENST00000579784 60 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
CACNA1SQ13698 HNRNPA1P11-201ENST00000580106 956 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
CACNA1SQ13698 AC136475.9-201ENST00000605240 497 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
CACNA1SQ13698 AC108102.1-201ENST00000606528 548 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CACNA1SQ13698 AC006273.1-201ENST00000606966 861 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
CACNA1SQ13698 Metazoa_SRP.152-201ENST00000614413 286 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
CACNA1SQ13698 AC099552.4-201ENST00000624248 949 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
CACNA1SQ13698 ALDOA-229ENST00000636698 420 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CACNA1SQ13698 DDC-201ENST00000357936 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CACNA1SQ13698 KIRREL2-203ENST00000360202 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CACNA1SQ13698 ALDH4A1-206ENST00000538839 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CACNA1SQ13698 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CACNA1SQ13698 VOPP1-204ENST00000418904 1317 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CACNA1SQ13698 SMAGP-203ENST00000603798 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CACNA1SQ13698 CETP-203ENST00000566128 1733 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CACNA1SQ13698 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CACNA1SQ13698 GJB4-201ENST00000339480 2840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CACNA1SQ13698 SRA1-201ENST00000336283 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CACNA1SQ13698 ZSCAN16-AS1-201ENST00000600652 2163 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CACNA1SQ13698 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CACNA1SQ13698 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CACNA1SQ13698 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CACNA1SQ13698 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CACNA1SQ13698 GPATCH2L-202ENST00000312858 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CACNA1SQ13698 LHX6-207ENST00000541397 2942 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CACNA1SQ13698 CAMKK2-204ENST00000392473 2967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CACNA1SQ13698 MKL1-204ENST00000402630 747 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CACNA1SQ13698 GSTM2P1-201ENST00000405166 654 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
CACNA1SQ13698 LIMS2-203ENST00000409254 867 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CACNA1SQ13698 AC131235.2-201ENST00000445553 1057 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
CACNA1SQ13698 AC092284.1-201ENST00000511386 1289 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
CACNA1SQ13698 NAT9-204ENST00000578822 839 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CACNA1SQ13698 AC073254.1-209ENST00000604677 631 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CACNA1SQ13698 ZNF268-219ENST00000611984 583 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
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