Protein–RNA interactions for Protein: P61968

LMO4, LIM domain transcription factor LMO4, humanhuman

Predictions only

Length 165 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO4P61968 HOXA1-202ENST00000355633 2016 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
LMO4P61968 CD34-203ENST00000367036 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
LMO4P61968 PCK2-203ENST00000545054 2505 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
LMO4P61968 CORO7-201ENST00000251166 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
LMO4P61968 PTCD2-207ENST00000503868 1653 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
LMO4P61968 PIP5K1B-208ENST00000541509 2664 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
LMO4P61968 MTMR6-201ENST00000381801 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
LMO4P61968 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
LMO4P61968 GGT1-201ENST00000248923 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
LMO4P61968 PKM-220ENST00000568459 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
LMO4P61968 TMEM30B-202ENST00000555868 4471 ntAPPRIS P1 BASIC11.14□□□□□ -0.63
LMO4P61968 SLC50A1-203ENST00000368404 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
LMO4P61968 C11orf21-201ENST00000381153 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
LMO4P61968 C3-201ENST00000245907 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
LMO4P61968 MED6-201ENST00000256379 1995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
LMO4P61968 PITPNM3-201ENST00000262483 7086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
LMO4P61968 APEX1-201ENST00000216714 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
LMO4P61968 CREB3L4-202ENST00000368600 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
LMO4P61968 PSMC5-212ENST00000581882 1474 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
LMO4P61968 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
LMO4P61968 C19orf66-202ENST00000397881 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
LMO4P61968 UBR5-201ENST00000220959 9418 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
LMO4P61968 WNT3A-201ENST00000284523 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
LMO4P61968 ZNF135-205ENST00000511556 2253 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
LMO4P61968 LINC00667-206ENST00000582363 2935 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
LMO4P61968 HELLS-202ENST00000348459 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
LMO4P61968 SLC7A9-201ENST00000023064 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
LMO4P61968 CLEC16A-202ENST00000409552 3365 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
LMO4P61968 CNTNAP2-207ENST00000628930 1944 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
LMO4P61968 RRAGB-202ENST00000374941 2061 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
LMO4P61968 HSD3BP1-201ENST00000286193 1111 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
LMO4P61968 PIGF-202ENST00000306465 1061 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
LMO4P61968 HAX1-201ENST00000328703 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
LMO4P61968 TCEAL5-201ENST00000372680 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
LMO4P61968 KCNE1-202ENST00000399284 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
LMO4P61968 CFL1P6-201ENST00000400899 494 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
LMO4P61968 SNHG14-201ENST00000414175 610 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
LMO4P61968 SAPCD1-AS1-202ENST00000419679 461 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
LMO4P61968 PLA2G1B-202ENST00000423423 423 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
LMO4P61968 MKNK1-205ENST00000428112 1270 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
LMO4P61968 AL157832.2-206ENST00000428178 601 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
LMO4P61968 KRT8P30-201ENST00000432100 650 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
LMO4P61968 PILRA-205ENST00000453419 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
LMO4P61968 HNRNPA3P6-201ENST00000472163 1006 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
LMO4P61968 ARHGEF26-AS1-203ENST00000480639 582 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
LMO4P61968 AC015795.2-201ENST00000512720 575 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
LMO4P61968 MIR2278-201ENST00000516344 96 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
LMO4P61968 AC109479.3-201ENST00000520163 360 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
LMO4P61968 AC005845.1-201ENST00000539206 653 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
LMO4P61968 DUT-207ENST00000559416 635 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
LMO4P61968 AC120498.7-201ENST00000562876 330 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
LMO4P61968 NAA38-205ENST00000575771 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
LMO4P61968 RN7SL121P-201ENST00000584223 273 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
LMO4P61968 ZNF724-202ENST00000597037 780 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
LMO4P61968 GMFG-206ENST00000597595 758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
LMO4P61968 AP000553.2-201ENST00000609038 441 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
LMO4P61968 Metazoa_SRP.63-201ENST00000617144 298 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
LMO4P61968 AC129778.1-201ENST00000623957 920 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
LMO4P61968 PNPT1-207ENST00000625249 216 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
LMO4P61968 TMEM41B-204ENST00000528080 3968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
LMO4P61968 TUBB2A-201ENST00000333628 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
LMO4P61968 SERPINA1-209ENST00000449399 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
LMO4P61968 ZCCHC7-209ENST00000534928 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
LMO4P61968 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
LMO4P61968 TESPA1-201ENST00000316577 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
LMO4P61968 IL9R-202ENST00000369423 2032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
LMO4P61968 CEP131-208ENST00000575907 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
LMO4P61968 GOLGA8DP-202ENST00000341390 2184 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
LMO4P61968 NUTM2D-202ENST00000412718 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
LMO4P61968 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
LMO4P61968 AP3M2-202ENST00000396926 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
LMO4P61968 KIF17-201ENST00000247986 3969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
LMO4P61968 FMNL3-205ENST00000550488 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
LMO4P61968 THPO-203ENST00000445696 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
LMO4P61968 AC012184.2-203ENST00000443119 2110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
LMO4P61968 COQ7-209ENST00000569127 2575 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
LMO4P61968 NBEA-203ENST00000379939 10738 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
LMO4P61968 SFI1-209ENST00000443011 3579 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
LMO4P61968 SCAMP5-202ENST00000425597 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
LMO4P61968 FBXL4-201ENST00000229971 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
LMO4P61968 EFHB-202ENST00000344838 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
LMO4P61968 HAO1-201ENST00000378789 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
LMO4P61968 RMDN1-201ENST00000406452 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
LMO4P61968 PLCB1-218ENST00000629992 3095 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
LMO4P61968 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
LMO4P61968 ELOA-204ENST00000613537 4924 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
LMO4P61968 GORASP2-201ENST00000234160 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
LMO4P61968 GOLGA8IP-201ENST00000340249 1899 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
LMO4P61968 ZNF821-214ENST00000565601 1858 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
LMO4P61968 ADAMTS10-201ENST00000270328 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
LMO4P61968 PDE2A-203ENST00000418754 2855 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
LMO4P61968 LINC01658-201ENST00000320372 1578 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
LMO4P61968 DSN1-204ENST00000426836 2441 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
LMO4P61968 TSPAN14-210ENST00000616406 2436 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
LMO4P61968 FGFR3-201ENST00000260795 4132 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
LMO4P61968 AC104452.1-203ENST00000636166 2266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
LMO4P61968 FAM198B-201ENST00000296530 4985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
LMO4P61968 HIST1H1D-201ENST00000244534 666 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
LMO4P61968 AIG1-203ENST00000367596 559 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
LMO4P61968 MIR632-201ENST00000385193 94 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 90.8 ms