Protein–RNA interactions for Protein: P13378

HOXD8, Homeobox protein Hox-D8, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 290 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD8P13378 TRIML2-207ENST00000512729 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
HOXD8P13378 BCL2L11-219ENST00000619294 5132 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
HOXD8P13378 ADORA1-201ENST00000309502 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
HOXD8P13378 GLUL-203ENST00000339526 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
HOXD8P13378 HIF3A-202ENST00000244303 2250 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
HOXD8P13378 ERICH6-201ENST00000295910 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
HOXD8P13378 MYL3-201ENST00000292327 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
HOXD8P13378 SULT1A3-201ENST00000338971 1097 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
HOXD8P13378 ZMAT5-201ENST00000344318 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
HOXD8P13378 AIFM1-203ENST00000346424 1200 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
HOXD8P13378 OR2W3-201ENST00000360358 945 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
HOXD8P13378 DPY19L2P4-201ENST00000479881 442 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
HOXD8P13378 HINT1-204ENST00000506908 681 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
HOXD8P13378 AC011431.1-201ENST00000512971 230 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
HOXD8P13378 DTWD1-205ENST00000558653 1131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
HOXD8P13378 AC009120.2-205ENST00000561921 490 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
HOXD8P13378 AC018766.1-201ENST00000601211 484 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
HOXD8P13378 AC080013.5-201ENST00000607044 679 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
HOXD8P13378 AL591926.3-201ENST00000611630 238 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
HOXD8P13378 GNG14-201ENST00000640117 210 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
HOXD8P13378 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
HOXD8P13378 SMG9-211ENST00000601170 2387 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
HOXD8P13378 CDK20-201ENST00000325303 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
HOXD8P13378 TSC22D3-204ENST00000372384 2199 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
HOXD8P13378 HNRNPLP1-201ENST00000421896 1501 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
HOXD8P13378 APOBEC3D-202ENST00000427494 1961 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
HOXD8P13378 SPATA12-201ENST00000334325 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
HOXD8P13378 FGF21-202ENST00000593756 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
HOXD8P13378 PRMT2-216ENST00000621201 1301 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
HOXD8P13378 SEPT10-208ENST00000437928 1782 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
HOXD8P13378 MICAL1-201ENST00000358577 3142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
HOXD8P13378 FERMT3-201ENST00000279227 2489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
HOXD8P13378 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
HOXD8P13378 CNN2-202ENST00000348419 2033 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
HOXD8P13378 TRMT2B-201ENST00000372935 2921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
HOXD8P13378 AC009474.1-201ENST00000455096 1565 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
HOXD8P13378 OSBPL5-203ENST00000389989 3619 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
HOXD8P13378 TYK2-210ENST00000529370 3176 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
HOXD8P13378 DAB1-207ENST00000420954 1817 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
HOXD8P13378 HDAC11-201ENST00000295757 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
HOXD8P13378 ZFYVE28-201ENST00000290974 4131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
HOXD8P13378 LIPA-202ENST00000336233 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
HOXD8P13378 KRBA2-202ENST00000396267 2562 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
HOXD8P13378 ATP6V1B1-201ENST00000234396 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
HOXD8P13378 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
HOXD8P13378 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
HOXD8P13378 TCP1-215ENST00000544255 1403 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
HOXD8P13378 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
HOXD8P13378 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
HOXD8P13378 TTC6-206ENST00000553443 5833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
HOXD8P13378 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
HOXD8P13378 USF1-202ENST00000368020 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
HOXD8P13378 MAP7D2-204ENST00000452324 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
HOXD8P13378 EPB42-210ENST00000622454 2227 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
HOXD8P13378 COPS7B-223ENST00000611614 2468 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
HOXD8P13378 MSH5-201ENST00000375703 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
HOXD8P13378 TPO-205ENST00000382201 2956 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
HOXD8P13378 HPGD-202ENST00000296522 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
HOXD8P13378 WDR24-201ENST00000248142 2763 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
HOXD8P13378 ZFYVE27-202ENST00000357540 2765 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
HOXD8P13378 ZFYVE27-204ENST00000370610 2769 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
HOXD8P13378 TESPA1-202ENST00000449076 2010 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
HOXD8P13378 GLT6D1-201ENST00000371763 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
HOXD8P13378 GLT6D1-202ENST00000613244 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
HOXD8P13378 PMF1-201ENST00000368273 884 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
HOXD8P13378 IL1RN-205ENST00000409930 848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
HOXD8P13378 AC007391.1-201ENST00000433893 504 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
HOXD8P13378 ZBTB46-AS1-201ENST00000435912 533 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
HOXD8P13378 AC114781.1-201ENST00000450559 1028 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
HOXD8P13378 IP6K2-223ENST00000453202 571 ntTSL 4 BASIC14.84□□□□□ -0.03
HOXD8P13378 AC103923.1-201ENST00000453229 1228 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
HOXD8P13378 FHIT-205ENST00000476844 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
HOXD8P13378 MBP-230ENST00000528160 584 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
HOXD8P13378 AP001102.1-201ENST00000528959 409 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
HOXD8P13378 TRAPPC4-212ENST00000533058 1209 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
HOXD8P13378 AC073896.3-201ENST00000546789 437 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
HOXD8P13378 MXRA7-204ENST00000585519 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
HOXD8P13378 TLE2-205ENST00000586422 389 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
HOXD8P13378 SMIM22-206ENST00000589327 629 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
HOXD8P13378 AC025048.4-201ENST00000589740 699 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
HOXD8P13378 AL645608.7-201ENST00000607769 351 ntTSL 4 BASIC14.84□□□□□ -0.03
HOXD8P13378 BX322562.1-201ENST00000617004 561 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
HOXD8P13378 AL590094.1-206ENST00000635959 478 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
HOXD8P13378 AL590094.1-209ENST00000637260 499 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
HOXD8P13378 CDH24-202ENST00000397359 3552 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
HOXD8P13378 SLC4A11-207ENST00000539553 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
HOXD8P13378 GPAT3-201ENST00000264409 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
HOXD8P13378 KIAA0930-203ENST00000391627 2623 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
HOXD8P13378 GLIS2-201ENST00000262366 4469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
HOXD8P13378 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
HOXD8P13378 CYB561-203ENST00000392976 3151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
HOXD8P13378 ALG1-204ENST00000588623 2671 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
HOXD8P13378 CDK20-209ENST00000605159 1860 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
HOXD8P13378 PKN1-202ENST00000342216 2960 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
HOXD8P13378 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
HOXD8P13378 HNRNPA0-201ENST00000314940 8726 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
HOXD8P13378 DDC-201ENST00000357936 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
HOXD8P13378 LINC01230-201ENST00000625222 3017 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
HOXD8P13378 EGLN3-205ENST00000547327 2849 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
HOXD8P13378 AL139082.1-201ENST00000613982 3433 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
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