Protein–RNA interactions for Protein: P0C0L5

C4B, Complement C4-B, humanhuman

Predictions only

Length 1,744 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4BP0C0L5 KIF3C-202ENST00000405914 3180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
C4BP0C0L5 ATXN3-201ENST00000340660 1205 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
C4BP0C0L5 SFTPA2-202ENST00000372327 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
C4BP0C0L5 LINC01494-201ENST00000419511 1011 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
C4BP0C0L5 AL161644.1-201ENST00000426901 1111 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
C4BP0C0L5 AC069257.3-201ENST00000431391 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
C4BP0C0L5 RBPMSLP-201ENST00000433427 502 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
C4BP0C0L5 AC131235.2-201ENST00000445553 1057 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
C4BP0C0L5 RRNAD1-204ENST00000476229 1096 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
C4BP0C0L5 LRRC75A-AS1-208ENST00000480811 968 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
C4BP0C0L5 AP001979.2-201ENST00000526254 975 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
C4BP0C0L5 AL391832.3-201ENST00000549744 846 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
C4BP0C0L5 AC108673.2-201ENST00000608909 565 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
C4BP0C0L5 IFI27-214ENST00000620396 599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
C4BP0C0L5 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
C4BP0C0L5 GNAI2-203ENST00000422163 2407 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
C4BP0C0L5 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
C4BP0C0L5 C1QTNF9-202ENST00000382071 1854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
C4BP0C0L5 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
C4BP0C0L5 KRT18P45-201ENST00000515347 1333 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
C4BP0C0L5 SERPINE3-204ENST00000524365 2293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
C4BP0C0L5 RBMS3-210ENST00000456853 1394 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
C4BP0C0L5 BCKDHA-202ENST00000457836 1745 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
C4BP0C0L5 NAMA-207ENST00000605707 1748 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
C4BP0C0L5 SGK1-205ENST00000413996 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
C4BP0C0L5 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
C4BP0C0L5 SYT17-201ENST00000355377 3081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
C4BP0C0L5 TMEM63B-202ENST00000323267 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
C4BP0C0L5 AC007336.3-201ENST00000623886 2160 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
C4BP0C0L5 STMN1-206ENST00000455785 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
C4BP0C0L5 ADAT1-201ENST00000307921 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
C4BP0C0L5 GNAO1-201ENST00000262493 3337 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
C4BP0C0L5 PEX5-207ENST00000455147 2689 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
C4BP0C0L5 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
C4BP0C0L5 HIST2H2BF-201ENST00000369167 1954 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
C4BP0C0L5 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
C4BP0C0L5 CD8B-202ENST00000349455 849 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
C4BP0C0L5 USMG5-205ENST00000369825 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
C4BP0C0L5 HNRNPA1P59-201ENST00000430583 918 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
C4BP0C0L5 AC016650.1-201ENST00000502834 708 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
C4BP0C0L5 BCRP5-201ENST00000514371 253 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
C4BP0C0L5 AC090825.2-201ENST00000557959 739 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
C4BP0C0L5 METTL23-211ENST00000589977 617 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
C4BP0C0L5 CALM3-206ENST00000594523 540 ntTSL 4 BASIC16.8■□□□□ 0.28
C4BP0C0L5 PAX6-238ENST00000638755 1161 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
C4BP0C0L5 SUOX-201ENST00000266971 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
C4BP0C0L5 SUOX-208ENST00000548274 2352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
C4BP0C0L5 AC099548.2-204ENST00000481651 2106 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
C4BP0C0L5 EFEMP1-201ENST00000355426 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
C4BP0C0L5 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
C4BP0C0L5 POLM-203ENST00000395831 2380 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
C4BP0C0L5 PRR30-201ENST00000335524 2008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
C4BP0C0L5 KIR2DL4-204ENST00000359085 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
C4BP0C0L5 APOD-201ENST00000343267 1130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
C4BP0C0L5 GSTK1-201ENST00000358406 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
C4BP0C0L5 CST11-202ENST00000377009 554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
C4BP0C0L5 SNAP25-AS1-202ENST00000426491 804 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
C4BP0C0L5 AC024028.1-201ENST00000437145 437 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
C4BP0C0L5 GOSR1-205ENST00000467337 1011 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
C4BP0C0L5 STAU2-212ENST00000521419 972 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
C4BP0C0L5 AC008982.1-201ENST00000594769 963 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
C4BP0C0L5 BIN3-212ENST00000640731 450 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
C4BP0C0L5 KRT75-201ENST00000252245 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
C4BP0C0L5 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
C4BP0C0L5 DENND1C-202ENST00000543576 2395 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
C4BP0C0L5 GDPD5-215ENST00000533805 2424 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
C4BP0C0L5 FERMT3-201ENST00000279227 2489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
C4BP0C0L5 DDC-201ENST00000357936 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
C4BP0C0L5 AC012485.1-201ENST00000456601 2509 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
C4BP0C0L5 KIR2DL3-201ENST00000342376 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
C4BP0C0L5 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
C4BP0C0L5 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
C4BP0C0L5 CPA5-203ENST00000461828 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
C4BP0C0L5 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
C4BP0C0L5 CXorf36-201ENST00000377934 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
C4BP0C0L5 MKL1-212ENST00000618417 1842 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
C4BP0C0L5 BLK-201ENST00000259089 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
C4BP0C0L5 ZNF30-202ENST00000439785 2651 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
C4BP0C0L5 RHPN1-AS1-201ENST00000518049 1918 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
C4BP0C0L5 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
C4BP0C0L5 PIGG-202ENST00000383028 2787 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
C4BP0C0L5 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
C4BP0C0L5 FAM86FP-201ENST00000338711 969 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
C4BP0C0L5 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
C4BP0C0L5 AL512422.2-201ENST00000426453 551 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
C4BP0C0L5 RPL21P135-201ENST00000442539 791 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
C4BP0C0L5 RPS23-205ENST00000510019 1019 ntTSL 4 BASIC16.79■□□□□ 0.28
C4BP0C0L5 AC003965.2-201ENST00000577140 265 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
C4BP0C0L5 AC103810.4-201ENST00000578601 257 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
C4BP0C0L5 RN7SL460P-201ENST00000582806 258 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
C4BP0C0L5 SMIM22-206ENST00000589327 629 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
C4BP0C0L5 DHRS12-202ENST00000280056 1324 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
C4BP0C0L5 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
C4BP0C0L5 TRAP1-201ENST00000246957 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
C4BP0C0L5 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
C4BP0C0L5 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
C4BP0C0L5 IGF2BP2-202ENST00000382199 3688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
C4BP0C0L5 MSH5-201ENST00000375703 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
C4BP0C0L5 CXorf40A-212ENST00000514208 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
C4BP0C0L5 AC027288.3-202ENST00000550268 1820 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
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