Protein–RNA interactions for Protein: B2RPK0

HMGB1P1, Putative high mobility group protein B1-like 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGB1P1B2RPK0 ARHGEF10L-202ENST00000361221 4488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
HMGB1P1B2RPK0 DGCR2-206ENST00000545799 4484 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
HMGB1P1B2RPK0 ARHGEF9-235ENST00000637723 2146 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
HMGB1P1B2RPK0 DLGAP1-201ENST00000315677 6683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
HMGB1P1B2RPK0 DNAJB12-201ENST00000338820 4360 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
HMGB1P1B2RPK0 AC139795.2-201ENST00000499900 1751 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
HMGB1P1B2RPK0 GABRB2-205ENST00000517901 1779 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
HMGB1P1B2RPK0 ATAT1-202ENST00000319027 2061 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
HMGB1P1B2RPK0 HIST1H2BH-201ENST00000619466 2060 ntAPPRIS P1 BASIC13.99□□□□□ -0.17
HMGB1P1B2RPK0 BSDC1-201ENST00000341071 4599 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
HMGB1P1B2RPK0 PIGC-202ENST00000367728 2630 ntAPPRIS P1 BASIC13.98□□□□□ -0.17
HMGB1P1B2RPK0 TGM3-201ENST00000381458 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
HMGB1P1B2RPK0 NCBP2L-202ENST00000639756 1953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
HMGB1P1B2RPK0 CNBP-207ENST00000502976 1626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
HMGB1P1B2RPK0 PLAT-211ENST00000524009 1613 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
HMGB1P1B2RPK0 PCBP2-215ENST00000549863 1619 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
HMGB1P1B2RPK0 PACSIN1-207ENST00000620693 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
HMGB1P1B2RPK0 AC134312.5-201ENST00000568031 1313 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
HMGB1P1B2RPK0 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
HMGB1P1B2RPK0 DDR1-262ENST00000508312 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
HMGB1P1B2RPK0 OGFR-202ENST00000370461 4506 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
HMGB1P1B2RPK0 ZNF41-202ENST00000377065 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
HMGB1P1B2RPK0 KIF13A-201ENST00000259711 5941 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
HMGB1P1B2RPK0 CFAP65-204ENST00000410037 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
HMGB1P1B2RPK0 ZNF25-201ENST00000302609 4139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
HMGB1P1B2RPK0 CHAT-202ENST00000339797 2124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
HMGB1P1B2RPK0 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
HMGB1P1B2RPK0 PRTFDC1-202ENST00000376376 741 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
HMGB1P1B2RPK0 AK6-201ENST00000380818 1183 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
HMGB1P1B2RPK0 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
HMGB1P1B2RPK0 CHAT-204ENST00000395559 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
HMGB1P1B2RPK0 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
HMGB1P1B2RPK0 BAATP1-201ENST00000412284 1225 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
HMGB1P1B2RPK0 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
HMGB1P1B2RPK0 AC092580.1-201ENST00000433998 658 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
HMGB1P1B2RPK0 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
HMGB1P1B2RPK0 SLC35G4-201ENST00000588001 1017 ntAPPRIS P1 BASIC13.98□□□□□ -0.17
HMGB1P1B2RPK0 AC073413.1-201ENST00000603927 732 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
HMGB1P1B2RPK0 LOXHD1-204ENST00000398705 1824 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
HMGB1P1B2RPK0 GLYR1-212ENST00000591451 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
HMGB1P1B2RPK0 ALDH8A1-203ENST00000367845 2383 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
HMGB1P1B2RPK0 CPT1C-203ENST00000392518 2910 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
HMGB1P1B2RPK0 POC1B-GALNT4-202ENST00000548729 5436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
HMGB1P1B2RPK0 MIR22HG-208ENST00000574306 2626 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
HMGB1P1B2RPK0 AP1M1-203ENST00000444449 2311 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
HMGB1P1B2RPK0 GPN1-211ENST00000610189 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
HMGB1P1B2RPK0 PRKCG-201ENST00000263431 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
HMGB1P1B2RPK0 TBC1D22A-203ENST00000380995 3934 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
HMGB1P1B2RPK0 TTN-AS1-209ENST00000456053 2033 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
HMGB1P1B2RPK0 P2RY8-201ENST00000381297 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
HMGB1P1B2RPK0 CACNA1G-232ENST00000515411 6960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
HMGB1P1B2RPK0 TMEM9B-202ENST00000525069 1433 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
HMGB1P1B2RPK0 PTOV1-214ENST00000600603 1443 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
HMGB1P1B2RPK0 TRO-225ENST00000622017 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
HMGB1P1B2RPK0 LINC01815-202ENST00000641468 1409 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
HMGB1P1B2RPK0 PKP4P1-201ENST00000426801 2158 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
HMGB1P1B2RPK0 PYGL-206ENST00000544180 2696 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
HMGB1P1B2RPK0 C5orf15-201ENST00000231512 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
HMGB1P1B2RPK0 GOLGA8A-201ENST00000359187 1877 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
HMGB1P1B2RPK0 DMTF1-201ENST00000331242 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
HMGB1P1B2RPK0 PARN-203ENST00000437198 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
HMGB1P1B2RPK0 CICP18-201ENST00000406017 2812 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
HMGB1P1B2RPK0 PCDHA10-202ENST00000506939 3788 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
HMGB1P1B2RPK0 GPD1-205ENST00000548814 1591 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
HMGB1P1B2RPK0 PAQR6-214ENST00000613336 1599 ntTSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
HMGB1P1B2RPK0 MTMR3-201ENST00000323630 5866 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
HMGB1P1B2RPK0 CDC42-202ENST00000344548 2256 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
HMGB1P1B2RPK0 CCT8-201ENST00000286788 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
HMGB1P1B2RPK0 DNAI2-201ENST00000311014 2236 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
HMGB1P1B2RPK0 RAB11FIP1-202ENST00000330843 7811 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
HMGB1P1B2RPK0 DDO-201ENST00000368923 1953 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
HMGB1P1B2RPK0 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
HMGB1P1B2RPK0 GUK1-206ENST00000366723 845 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
HMGB1P1B2RPK0 GRAP-202ENST00000395635 834 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
HMGB1P1B2RPK0 ZNF529-AS1-201ENST00000448373 1004 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
HMGB1P1B2RPK0 KRT17P7-201ENST00000451704 1104 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
HMGB1P1B2RPK0 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
HMGB1P1B2RPK0 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
HMGB1P1B2RPK0 ATP6V1D-206ENST00000554236 888 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
HMGB1P1B2RPK0 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
HMGB1P1B2RPK0 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC13.97□□□□□ -0.17
HMGB1P1B2RPK0 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
HMGB1P1B2RPK0 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
HMGB1P1B2RPK0 MAN2B2-201ENST00000285599 5143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
HMGB1P1B2RPK0 CCDC88A-214ENST00000621814 3089 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
HMGB1P1B2RPK0 TMX1-201ENST00000457354 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
HMGB1P1B2RPK0 PPM1K-201ENST00000295908 1940 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
HMGB1P1B2RPK0 ASAH2B-202ENST00000374007 3715 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
HMGB1P1B2RPK0 NBPF3-205ENST00000454000 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
HMGB1P1B2RPK0 ZNF529-209ENST00000591340 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
HMGB1P1B2RPK0 SLC3A1-205ENST00000409387 2334 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
HMGB1P1B2RPK0 VAMP1-201ENST00000361716 3449 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
HMGB1P1B2RPK0 NCBP1-202ENST00000375147 5178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
HMGB1P1B2RPK0 RNF34-203ENST00000392465 2051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
HMGB1P1B2RPK0 ADCY7-202ENST00000394697 6213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
HMGB1P1B2RPK0 SYNCRIP-201ENST00000355238 6449 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
HMGB1P1B2RPK0 RARS2-201ENST00000369536 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
HMGB1P1B2RPK0 STARD8-203ENST00000374599 4841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
HMGB1P1B2RPK0 AWAT1-201ENST00000374521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
HMGB1P1B2RPK0 TRPM2-203ENST00000397928 6221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.3 ms