Protein–RNA interactions for Protein: R4GMW8

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BIVM-ERCC5R4GMW8 CYP20A1-210ENST00000613925 1986 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
BIVM-ERCC5R4GMW8 HMGB1-202ENST00000339872 2319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
BIVM-ERCC5R4GMW8 RRAGB-202ENST00000374941 2061 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
BIVM-ERCC5R4GMW8 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
BIVM-ERCC5R4GMW8 TSEN2-202ENST00000402228 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
BIVM-ERCC5R4GMW8 CNN2-205ENST00000562958 2194 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
BIVM-ERCC5R4GMW8 AL450468.2-201ENST00000565955 1889 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
BIVM-ERCC5R4GMW8 ECM1-203ENST00000369049 1925 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
BIVM-ERCC5R4GMW8 CATSPER4-202ENST00000456354 1912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
BIVM-ERCC5R4GMW8 TRPV1-201ENST00000310522 2340 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
BIVM-ERCC5R4GMW8 DDC-206ENST00000431062 1620 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
BIVM-ERCC5R4GMW8 TFAM-201ENST00000373895 973 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
BIVM-ERCC5R4GMW8 LSM2-208ENST00000375661 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
BIVM-ERCC5R4GMW8 CITED1-206ENST00000431381 941 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
BIVM-ERCC5R4GMW8 CITED1-207ENST00000445983 820 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC099681.2-201ENST00000449899 543 ntTSL 4 BASIC21.84■■□□□ 1.09
BIVM-ERCC5R4GMW8 RN7SL363P-201ENST00000482412 273 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
BIVM-ERCC5R4GMW8 PSMD6-209ENST00000482510 1176 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
BIVM-ERCC5R4GMW8 WISP1-205ENST00000519433 545 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC090616.6-202ENST00000583601 1088 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
BIVM-ERCC5R4GMW8 INTS14-201ENST00000313182 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
BIVM-ERCC5R4GMW8 SOX30-203ENST00000519442 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
BIVM-ERCC5R4GMW8 ACOX2-201ENST00000302819 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
BIVM-ERCC5R4GMW8 KRT18P45-201ENST00000515347 1333 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC109326.1-201ENST00000624705 1321 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
BIVM-ERCC5R4GMW8 FAM114A2-211ENST00000520667 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
BIVM-ERCC5R4GMW8 LAT2-205ENST00000460943 2527 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
BIVM-ERCC5R4GMW8 TGM5-207ENST00000622115 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
BIVM-ERCC5R4GMW8 SERPINA1-220ENST00000636712 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
BIVM-ERCC5R4GMW8 SLC26A11-201ENST00000361193 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
BIVM-ERCC5R4GMW8 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
BIVM-ERCC5R4GMW8 LILRA2-204ENST00000391738 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
BIVM-ERCC5R4GMW8 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
BIVM-ERCC5R4GMW8 AL357054.1-201ENST00000407035 1227 ntBASIC21.83■■□□□ 1.08
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC083873.1-201ENST00000421179 1099 ntBASIC21.83■■□□□ 1.08
BIVM-ERCC5R4GMW8 UCMA-202ENST00000463405 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
BIVM-ERCC5R4GMW8 RN7SL483P-201ENST00000478417 285 ntBASIC21.83■■□□□ 1.08
BIVM-ERCC5R4GMW8 PTPN20-229ENST00000513756 640 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
BIVM-ERCC5R4GMW8 AKR1B1P3-201ENST00000525311 588 ntBASIC21.83■■□□□ 1.08
BIVM-ERCC5R4GMW8 IGHV1OR16-3-201ENST00000568138 205 ntBASIC21.83■■□□□ 1.08
BIVM-ERCC5R4GMW8 KRT16P4-202ENST00000580052 362 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.08
BIVM-ERCC5R4GMW8 MIR378I-201ENST00000582688 76 ntBASIC21.83■■□□□ 1.08
BIVM-ERCC5R4GMW8 DUSP22-206ENST00000603453 804 ntTSL 4 BASIC21.83■■□□□ 1.08
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC020763.2-201ENST00000623155 1255 ntBASIC21.83■■□□□ 1.08
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC006511.4-201ENST00000631571 561 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.08
BIVM-ERCC5R4GMW8 TOX3-201ENST00000219746 3233 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
BIVM-ERCC5R4GMW8 FAM9A-201ENST00000381003 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
BIVM-ERCC5R4GMW8 CLASRP-204ENST00000544944 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
BIVM-ERCC5R4GMW8 ZNF772-203ENST00000425074 1601 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
BIVM-ERCC5R4GMW8 TCAF2-201ENST00000357344 2958 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
BIVM-ERCC5R4GMW8 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
BIVM-ERCC5R4GMW8 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
BIVM-ERCC5R4GMW8 SP140L-203ENST00000415673 2665 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
BIVM-ERCC5R4GMW8 GJB1-202ENST00000374022 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
BIVM-ERCC5R4GMW8 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
BIVM-ERCC5R4GMW8 CAV2-202ENST00000343213 776 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
BIVM-ERCC5R4GMW8 CST11-202ENST00000377009 554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
BIVM-ERCC5R4GMW8 MIR193A-201ENST00000384882 88 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
BIVM-ERCC5R4GMW8 HYKK-201ENST00000388988 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC053503.4-201ENST00000431827 224 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
BIVM-ERCC5R4GMW8 MAF1-204ENST00000532522 1098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
BIVM-ERCC5R4GMW8 FP325317.1-201ENST00000539936 1042 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
BIVM-ERCC5R4GMW8 SELENOK-205ENST00000541726 814 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
BIVM-ERCC5R4GMW8 AL160287.1-203ENST00000637960 1061 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
BIVM-ERCC5R4GMW8 LIPC-202ENST00000356113 2161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
BIVM-ERCC5R4GMW8 TMCO3-202ENST00000434316 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
BIVM-ERCC5R4GMW8 RPS3-209ENST00000527446 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
BIVM-ERCC5R4GMW8 ELP2-221ENST00000542824 2288 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
BIVM-ERCC5R4GMW8 ZNF555-203ENST00000591539 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
BIVM-ERCC5R4GMW8 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
BIVM-ERCC5R4GMW8 DDX6P2-201ENST00000619520 1455 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
BIVM-ERCC5R4GMW8 FP671120.1-201ENST00000623664 2498 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
BIVM-ERCC5R4GMW8 FP236383.1-201ENST00000623860 2498 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
BIVM-ERCC5R4GMW8 NPL-205ENST00000367555 1536 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
BIVM-ERCC5R4GMW8 PKMP1-201ENST00000455804 1523 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
BIVM-ERCC5R4GMW8 FAM95B1-211ENST00000592053 1541 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
BIVM-ERCC5R4GMW8 AL669942.1-203ENST00000610972 1541 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
BIVM-ERCC5R4GMW8 ZNF606-204ENST00000547828 2680 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
BIVM-ERCC5R4GMW8 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
BIVM-ERCC5R4GMW8 TRIM60-201ENST00000341062 1867 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
BIVM-ERCC5R4GMW8 DNM1-203ENST00000393594 3245 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
BIVM-ERCC5R4GMW8 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
BIVM-ERCC5R4GMW8 AGAP12P-201ENST00000585227 2359 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
BIVM-ERCC5R4GMW8 IKBKE-201ENST00000578328 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
BIVM-ERCC5R4GMW8 COCH-202ENST00000396618 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
BIVM-ERCC5R4GMW8 FBRS-201ENST00000287468 2811 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
BIVM-ERCC5R4GMW8 SLC2A11-208ENST00000405847 730 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
BIVM-ERCC5R4GMW8 LINC01823-204ENST00000438722 794 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
BIVM-ERCC5R4GMW8 SATB2-AS1-202ENST00000441234 468 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
BIVM-ERCC5R4GMW8 LINC02352-201ENST00000557928 468 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
BIVM-ERCC5R4GMW8 Metazoa_SRP.198-201ENST00000610617 323 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
BIVM-ERCC5R4GMW8 PAX6-247ENST00000638965 979 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
BIVM-ERCC5R4GMW8 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
BIVM-ERCC5R4GMW8 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
BIVM-ERCC5R4GMW8 GAPDHS-201ENST00000222286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
BIVM-ERCC5R4GMW8 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
BIVM-ERCC5R4GMW8 SCHIP1-201ENST00000445224 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
BIVM-ERCC5R4GMW8 ZNF577-202ENST00000451628 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
BIVM-ERCC5R4GMW8 MLPH-202ENST00000338530 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
BIVM-ERCC5R4GMW8 FGR-204ENST00000399173 2483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
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