Protein–RNA interactions for Protein: P48230

TM4SF4, Transmembrane 4 L6 family member 4, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM4SF4P48230 BHMT2-201ENST00000255192 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TM4SF4P48230 CD1A-201ENST00000289429 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TM4SF4P48230 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TM4SF4P48230 ZFAND1-201ENST00000220669 1798 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TM4SF4P48230 ZFAND1-221ENST00000523096 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TM4SF4P48230 MARVELD2-203ENST00000436532 1563 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TM4SF4P48230 DDX6P2-201ENST00000619520 1455 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
TM4SF4P48230 HFE-205ENST00000352392 653 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TM4SF4P48230 MLN-202ENST00000430124 566 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TM4SF4P48230 C2orf27AP2-201ENST00000438438 555 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
TM4SF4P48230 AP3M2-205ENST00000517922 1094 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TM4SF4P48230 AC022217.2-201ENST00000518941 472 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TM4SF4P48230 RN7SL678P-201ENST00000579533 299 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
TM4SF4P48230 AP002414.5-201ENST00000591853 258 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TM4SF4P48230 AC097634.2-201ENST00000615819 604 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TM4SF4P48230 AL669831.3-208ENST00000634337 891 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TM4SF4P48230 LINC01988-202ENST00000636975 921 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TM4SF4P48230 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TM4SF4P48230 AL139423.1-201ENST00000606802 7923 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TM4SF4P48230 HOXA1-202ENST00000355633 2016 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TM4SF4P48230 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TM4SF4P48230 AC090643.2-201ENST00000623442 2029 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
TM4SF4P48230 MRRF-201ENST00000297908 1841 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TM4SF4P48230 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TM4SF4P48230 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TM4SF4P48230 XRCC3-211ENST00000555055 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TM4SF4P48230 AC004471.2-201ENST00000609936 1514 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TM4SF4P48230 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TM4SF4P48230 ZNF354B-201ENST00000322434 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TM4SF4P48230 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TM4SF4P48230 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TM4SF4P48230 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TM4SF4P48230 CNOT4-204ENST00000414802 1687 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TM4SF4P48230 C1orf159-202ENST00000379320 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TM4SF4P48230 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TM4SF4P48230 LINC00877-207ENST00000488545 1561 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TM4SF4P48230 VRK3-217ENST00000599538 2126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TM4SF4P48230 BIRC2-214ENST00000621637 3331 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TM4SF4P48230 AC020914.1-201ENST00000396477 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TM4SF4P48230 LIPC-204ENST00000433326 1484 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
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TM4SF4P48230 AP001922.6-201ENST00000532553 546 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
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TM4SF4P48230 LINC00662-204ENST00000588027 562 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TM4SF4P48230 AL355338.1-201ENST00000612598 913 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TM4SF4P48230 Metazoa_SRP.68-201ENST00000612673 282 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
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TM4SF4P48230 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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TM4SF4P48230 CEP78-203ENST00000376598 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
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TM4SF4P48230 TPD52L3-203ENST00000381428 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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TM4SF4P48230 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
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TM4SF4P48230 UGT3A1-203ENST00000503189 1902 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TM4SF4P48230 DDX6-202ENST00000526070 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TM4SF4P48230 PPP1R26-204ENST00000604351 4640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TM4SF4P48230 TRNT1-202ENST00000280591 2180 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TM4SF4P48230 TMEM78-201ENST00000323223 2175 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TM4SF4P48230 IQCE-201ENST00000325979 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TM4SF4P48230 TBRG4-215ENST00000494076 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TM4SF4P48230 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TM4SF4P48230 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TM4SF4P48230 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TM4SF4P48230 FAM90A27P-201ENST00000593323 1370 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
TM4SF4P48230 FAM90A28P-202ENST00000597191 1374 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
TM4SF4P48230 PEX5L-211ENST00000472994 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TM4SF4P48230 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TM4SF4P48230 APTX-201ENST00000309615 1859 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TM4SF4P48230 TNNT2-201ENST00000236918 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TM4SF4P48230 ABCD3-201ENST00000315713 884 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TM4SF4P48230 OAZ3-201ENST00000321531 851 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TM4SF4P48230 RIPPLY2-201ENST00000369687 521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TM4SF4P48230 CD27-AS1-201ENST00000399492 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TM4SF4P48230 SYCE3-201ENST00000402753 342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TM4SF4P48230 ATP6AP2-202ENST00000423649 1093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TM4SF4P48230 MTND6P7-201ENST00000433237 524 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
TM4SF4P48230 AL669831.4-201ENST00000447500 872 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TM4SF4P48230 AC114781.1-201ENST00000450559 1028 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
TM4SF4P48230 AL583824.1-203ENST00000457948 761 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TM4SF4P48230 PRKRIP1-202ENST00000462601 884 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
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