Protein–RNA interactions for Protein: P28827

PTPRM, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, humanhuman

Predictions only

Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRMP28827 PSMD7-205ENST00000568615 931 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PTPRMP28827 AC105105.4-201ENST00000610389 713 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
PTPRMP28827 AC012313.9-201ENST00000619318 633 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
PTPRMP28827 E2F6-201ENST00000307236 3317 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PTPRMP28827 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PTPRMP28827 LINC01744-201ENST00000457698 2042 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PTPRMP28827 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PTPRMP28827 SAFB-202ENST00000454510 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PTPRMP28827 GAD2-201ENST00000259271 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PTPRMP28827 GOLGA6L2-202ENST00000345070 1972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PTPRMP28827 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PTPRMP28827 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PTPRMP28827 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PTPRMP28827 MANBAL-201ENST00000373605 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PTPRMP28827 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PTPRMP28827 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PTPRMP28827 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PTPRMP28827 AGAP13P-201ENST00000417888 363 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
PTPRMP28827 RPSAP46-201ENST00000428316 882 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
PTPRMP28827 AC073465.1-201ENST00000456671 464 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
PTPRMP28827 NT5CP2-201ENST00000553305 561 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
PTPRMP28827 RN7SL678P-201ENST00000579533 299 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
PTPRMP28827 AC007728.3-201ENST00000602304 746 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
PTPRMP28827 BID-211ENST00000611040 419 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PTPRMP28827 LINC01726-201ENST00000624692 1253 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PTPRMP28827 ZNF256-201ENST00000282308 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PTPRMP28827 AL139260.2-201ENST00000622355 2171 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PTPRMP28827 SDR42E2-201ENST00000602312 2630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PTPRMP28827 CDH16-201ENST00000299752 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PTPRMP28827 SHTN1-204ENST00000392903 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PTPRMP28827 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PTPRMP28827 CNOT4-204ENST00000414802 1687 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PTPRMP28827 PPP4R4-201ENST00000304338 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PTPRMP28827 APTX-206ENST00000379825 2023 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PTPRMP28827 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PTPRMP28827 PRKAB1-201ENST00000229328 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PTPRMP28827 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PTPRMP28827 ERG-211ENST00000453032 1595 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PTPRMP28827 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PTPRMP28827 CEP78-203ENST00000376598 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PTPRMP28827 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PTPRMP28827 ZNF75A-205ENST00000574298 2347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PTPRMP28827 SV2A-201ENST00000369145 2903 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PTPRMP28827 KLK8-201ENST00000291726 853 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
PTPRMP28827 RPL5-202ENST00000370321 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
PTPRMP28827 TCEAL1-201ENST00000372624 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
PTPRMP28827 SEC14L2-201ENST00000402592 1229 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
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PTPRMP28827 AC118553.1-201ENST00000454219 655 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
PTPRMP28827 MYADML-202ENST00000490394 797 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.67
PTPRMP28827 AC106774.4-201ENST00000600799 409 ntBASIC19.27■□□□□ 0.67
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PTPRMP28827 CASC2-202ENST00000426021 3232 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
PTPRMP28827 ZNF397-209ENST00000591206 1516 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
PTPRMP28827 GOLGA8VP-201ENST00000559009 1798 ntBASIC19.27■□□□□ 0.67
PTPRMP28827 FAM107A-206ENST00000474531 2271 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
PTPRMP28827 TMBIM6-203ENST00000423828 3254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
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PTPRMP28827 EFNA1-201ENST00000368406 1444 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
PTPRMP28827 VOPP1-206ENST00000428097 1671 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.67
PTPRMP28827 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PTPRMP28827 ALDH1B1-201ENST00000377698 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PTPRMP28827 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PTPRMP28827 AHCYP7-201ENST00000560847 1308 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
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PTPRMP28827 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PTPRMP28827 SLC39A11-202ENST00000542342 2752 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PTPRMP28827 CDH16-204ENST00000565796 2694 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PTPRMP28827 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PTPRMP28827 UNQ6494-202ENST00000617436 2163 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
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PTPRMP28827 TCAM1P-207ENST00000485295 1537 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
PTPRMP28827 DDX11L1-202ENST00000456328 1657 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PTPRMP28827 DDX11L10-202ENST00000513886 1652 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PTPRMP28827 DDX11L9-203ENST00000562189 1652 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PTPRMP28827 MBD3L2-201ENST00000381393 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PTPRMP28827 SNAPC5-203ENST00000395589 749 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
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PTPRMP28827 AL662860.1-201ENST00000436804 877 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PTPRMP28827 UCMA-202ENST00000463405 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PTPRMP28827 SNAPC5-205ENST00000563480 920 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PTPRMP28827 NPLOC4-214ENST00000573876 560 ntTSL 4 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PTPRMP28827 MYL12A-206ENST00000578611 1004 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PTPRMP28827 MYO5BP1-201ENST00000610994 1239 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
PTPRMP28827 PSMB3-211ENST00000619426 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PTPRMP28827 AL358215.3-201ENST00000640695 1186 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PTPRMP28827 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PTPRMP28827 SLC52A3-202ENST00000381944 3060 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PTPRMP28827 Z98885.2-201ENST00000565177 1567 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PTPRMP28827 GSN-203ENST00000373808 2664 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PTPRMP28827 PLAU-202ENST00000446342 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PTPRMP28827 MEF2C-207ENST00000503554 1345 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PTPRMP28827 CDK7-202ENST00000502604 1455 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PTPRMP28827 PIK3IP1-201ENST00000215912 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PTPRMP28827 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PTPRMP28827 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PTPRMP28827 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PTPRMP28827 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PTPRMP28827 ASGR2-201ENST00000254850 1396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
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