Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPU3

SORCS3, VPS10 domain-containing receptor SorCS3, humanhuman

Predictions only

Length 1,222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SORCS3Q9UPU3 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SORCS3Q9UPU3 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SORCS3Q9UPU3 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SORCS3Q9UPU3 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SORCS3Q9UPU3 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SORCS3Q9UPU3 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SORCS3Q9UPU3 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SORCS3Q9UPU3 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SORCS3Q9UPU3 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SORCS3Q9UPU3 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SORCS3Q9UPU3 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SORCS3Q9UPU3 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SORCS3Q9UPU3 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SORCS3Q9UPU3 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SORCS3Q9UPU3 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SORCS3Q9UPU3 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
SORCS3Q9UPU3 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
SORCS3Q9UPU3 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SORCS3Q9UPU3 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SORCS3Q9UPU3 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SORCS3Q9UPU3 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SORCS3Q9UPU3 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SORCS3Q9UPU3 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SORCS3Q9UPU3 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SORCS3Q9UPU3 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SORCS3Q9UPU3 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SORCS3Q9UPU3 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SORCS3Q9UPU3 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SORCS3Q9UPU3 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SORCS3Q9UPU3 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SORCS3Q9UPU3 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SORCS3Q9UPU3 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SORCS3Q9UPU3 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SORCS3Q9UPU3 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SORCS3Q9UPU3 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
SORCS3Q9UPU3 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
SORCS3Q9UPU3 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
SORCS3Q9UPU3 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SORCS3Q9UPU3 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SORCS3Q9UPU3 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SORCS3Q9UPU3 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SORCS3Q9UPU3 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SORCS3Q9UPU3 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SORCS3Q9UPU3 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SORCS3Q9UPU3 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SORCS3Q9UPU3 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SORCS3Q9UPU3 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
SORCS3Q9UPU3 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SORCS3Q9UPU3 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SORCS3Q9UPU3 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SORCS3Q9UPU3 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SORCS3Q9UPU3 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SORCS3Q9UPU3 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SORCS3Q9UPU3 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SORCS3Q9UPU3 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SORCS3Q9UPU3 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SORCS3Q9UPU3 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SORCS3Q9UPU3 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SORCS3Q9UPU3 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
SORCS3Q9UPU3 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SORCS3Q9UPU3 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
SORCS3Q9UPU3 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
SORCS3Q9UPU3 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
SORCS3Q9UPU3 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
SORCS3Q9UPU3 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SORCS3Q9UPU3 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SORCS3Q9UPU3 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SORCS3Q9UPU3 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SORCS3Q9UPU3 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SORCS3Q9UPU3 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SORCS3Q9UPU3 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SORCS3Q9UPU3 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SORCS3Q9UPU3 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SORCS3Q9UPU3 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SORCS3Q9UPU3 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SORCS3Q9UPU3 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SORCS3Q9UPU3 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SORCS3Q9UPU3 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
SORCS3Q9UPU3 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
SORCS3Q9UPU3 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SORCS3Q9UPU3 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SORCS3Q9UPU3 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SORCS3Q9UPU3 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SORCS3Q9UPU3 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SORCS3Q9UPU3 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SORCS3Q9UPU3 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
SORCS3Q9UPU3 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SORCS3Q9UPU3 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SORCS3Q9UPU3 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SORCS3Q9UPU3 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SORCS3Q9UPU3 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SORCS3Q9UPU3 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SORCS3Q9UPU3 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SORCS3Q9UPU3 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SORCS3Q9UPU3 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SORCS3Q9UPU3 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SORCS3Q9UPU3 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SORCS3Q9UPU3 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
SORCS3Q9UPU3 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SORCS3Q9UPU3 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms