Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULZ9

MMP17, Matrix metalloproteinase-17, humanhuman

Predictions only

Length 603 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MMP17Q9ULZ9 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
MMP17Q9ULZ9 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
MMP17Q9ULZ9 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
MMP17Q9ULZ9 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MMP17Q9ULZ9 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
MMP17Q9ULZ9 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MMP17Q9ULZ9 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MMP17Q9ULZ9 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
MMP17Q9ULZ9 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MMP17Q9ULZ9 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MMP17Q9ULZ9 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
MMP17Q9ULZ9 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
MMP17Q9ULZ9 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
MMP17Q9ULZ9 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
MMP17Q9ULZ9 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
MMP17Q9ULZ9 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
MMP17Q9ULZ9 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
MMP17Q9ULZ9 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
MMP17Q9ULZ9 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
MMP17Q9ULZ9 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MMP17Q9ULZ9 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MMP17Q9ULZ9 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MMP17Q9ULZ9 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MMP17Q9ULZ9 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MMP17Q9ULZ9 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MMP17Q9ULZ9 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MMP17Q9ULZ9 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MMP17Q9ULZ9 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
MMP17Q9ULZ9 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MMP17Q9ULZ9 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MMP17Q9ULZ9 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MMP17Q9ULZ9 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
MMP17Q9ULZ9 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MMP17Q9ULZ9 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MMP17Q9ULZ9 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC22.54■■□□□ 1.2
MMP17Q9ULZ9 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
MMP17Q9ULZ9 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
MMP17Q9ULZ9 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MMP17Q9ULZ9 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MMP17Q9ULZ9 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
MMP17Q9ULZ9 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MMP17Q9ULZ9 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MMP17Q9ULZ9 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
MMP17Q9ULZ9 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MMP17Q9ULZ9 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
MMP17Q9ULZ9 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
MMP17Q9ULZ9 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MMP17Q9ULZ9 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
MMP17Q9ULZ9 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MMP17Q9ULZ9 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
MMP17Q9ULZ9 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
MMP17Q9ULZ9 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MMP17Q9ULZ9 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
MMP17Q9ULZ9 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MMP17Q9ULZ9 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
MMP17Q9ULZ9 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
MMP17Q9ULZ9 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
MMP17Q9ULZ9 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MMP17Q9ULZ9 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MMP17Q9ULZ9 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
MMP17Q9ULZ9 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MMP17Q9ULZ9 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
MMP17Q9ULZ9 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MMP17Q9ULZ9 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
MMP17Q9ULZ9 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
MMP17Q9ULZ9 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MMP17Q9ULZ9 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MMP17Q9ULZ9 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
MMP17Q9ULZ9 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MMP17Q9ULZ9 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MMP17Q9ULZ9 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
MMP17Q9ULZ9 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MMP17Q9ULZ9 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MMP17Q9ULZ9 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MMP17Q9ULZ9 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MMP17Q9ULZ9 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MMP17Q9ULZ9 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MMP17Q9ULZ9 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MMP17Q9ULZ9 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
MMP17Q9ULZ9 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MMP17Q9ULZ9 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MMP17Q9ULZ9 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MMP17Q9ULZ9 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MMP17Q9ULZ9 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MMP17Q9ULZ9 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MMP17Q9ULZ9 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
MMP17Q9ULZ9 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MMP17Q9ULZ9 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MMP17Q9ULZ9 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MMP17Q9ULZ9 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
MMP17Q9ULZ9 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
MMP17Q9ULZ9 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MMP17Q9ULZ9 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MMP17Q9ULZ9 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MMP17Q9ULZ9 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MMP17Q9ULZ9 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MMP17Q9ULZ9 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
MMP17Q9ULZ9 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MMP17Q9ULZ9 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MMP17Q9ULZ9 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms