Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJY5

GGA1, ADP-ribosylation factor-binding protein GGA1, humanhuman

Predictions only

Length 639 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGA1Q9UJY5 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
GGA1Q9UJY5 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
GGA1Q9UJY5 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
GGA1Q9UJY5 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
GGA1Q9UJY5 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
GGA1Q9UJY5 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
GGA1Q9UJY5 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
GGA1Q9UJY5 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
GGA1Q9UJY5 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
GGA1Q9UJY5 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
GGA1Q9UJY5 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
GGA1Q9UJY5 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
GGA1Q9UJY5 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
GGA1Q9UJY5 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
GGA1Q9UJY5 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
GGA1Q9UJY5 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC27.41■■□□□ 1.98
GGA1Q9UJY5 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
GGA1Q9UJY5 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
GGA1Q9UJY5 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
GGA1Q9UJY5 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
GGA1Q9UJY5 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
GGA1Q9UJY5 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
GGA1Q9UJY5 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
GGA1Q9UJY5 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
GGA1Q9UJY5 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
GGA1Q9UJY5 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
GGA1Q9UJY5 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
GGA1Q9UJY5 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
GGA1Q9UJY5 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
GGA1Q9UJY5 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
GGA1Q9UJY5 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
GGA1Q9UJY5 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC27.39■■□□□ 1.98
GGA1Q9UJY5 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
GGA1Q9UJY5 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
GGA1Q9UJY5 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
GGA1Q9UJY5 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
GGA1Q9UJY5 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
GGA1Q9UJY5 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
GGA1Q9UJY5 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
GGA1Q9UJY5 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
GGA1Q9UJY5 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
GGA1Q9UJY5 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
GGA1Q9UJY5 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
GGA1Q9UJY5 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
GGA1Q9UJY5 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
GGA1Q9UJY5 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
GGA1Q9UJY5 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
GGA1Q9UJY5 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
GGA1Q9UJY5 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
GGA1Q9UJY5 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
GGA1Q9UJY5 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
GGA1Q9UJY5 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
GGA1Q9UJY5 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
GGA1Q9UJY5 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
GGA1Q9UJY5 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
GGA1Q9UJY5 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
GGA1Q9UJY5 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
GGA1Q9UJY5 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
GGA1Q9UJY5 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
GGA1Q9UJY5 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
GGA1Q9UJY5 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
GGA1Q9UJY5 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
GGA1Q9UJY5 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
GGA1Q9UJY5 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
GGA1Q9UJY5 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
GGA1Q9UJY5 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
GGA1Q9UJY5 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
GGA1Q9UJY5 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
GGA1Q9UJY5 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
GGA1Q9UJY5 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
GGA1Q9UJY5 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
GGA1Q9UJY5 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
GGA1Q9UJY5 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
GGA1Q9UJY5 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
GGA1Q9UJY5 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
GGA1Q9UJY5 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
GGA1Q9UJY5 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
GGA1Q9UJY5 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
GGA1Q9UJY5 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
GGA1Q9UJY5 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
GGA1Q9UJY5 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
GGA1Q9UJY5 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
GGA1Q9UJY5 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
GGA1Q9UJY5 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
GGA1Q9UJY5 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
GGA1Q9UJY5 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
GGA1Q9UJY5 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
GGA1Q9UJY5 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
GGA1Q9UJY5 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
GGA1Q9UJY5 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
GGA1Q9UJY5 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
GGA1Q9UJY5 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
GGA1Q9UJY5 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
GGA1Q9UJY5 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
GGA1Q9UJY5 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
GGA1Q9UJY5 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
GGA1Q9UJY5 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
GGA1Q9UJY5 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
GGA1Q9UJY5 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
GGA1Q9UJY5 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms