Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIW2

PLXNA1, Plexin-A1, humanhuman

Predictions only

Length 1,896 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLXNA1Q9UIW2 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PLXNA1Q9UIW2 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PLXNA1Q9UIW2 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PLXNA1Q9UIW2 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PLXNA1Q9UIW2 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PLXNA1Q9UIW2 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PLXNA1Q9UIW2 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PLXNA1Q9UIW2 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PLXNA1Q9UIW2 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
PLXNA1Q9UIW2 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PLXNA1Q9UIW2 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PLXNA1Q9UIW2 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PLXNA1Q9UIW2 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PLXNA1Q9UIW2 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PLXNA1Q9UIW2 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PLXNA1Q9UIW2 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PLXNA1Q9UIW2 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PLXNA1Q9UIW2 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PLXNA1Q9UIW2 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PLXNA1Q9UIW2 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PLXNA1Q9UIW2 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
PLXNA1Q9UIW2 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PLXNA1Q9UIW2 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PLXNA1Q9UIW2 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PLXNA1Q9UIW2 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PLXNA1Q9UIW2 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PLXNA1Q9UIW2 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PLXNA1Q9UIW2 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PLXNA1Q9UIW2 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PLXNA1Q9UIW2 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PLXNA1Q9UIW2 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PLXNA1Q9UIW2 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PLXNA1Q9UIW2 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PLXNA1Q9UIW2 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PLXNA1Q9UIW2 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PLXNA1Q9UIW2 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PLXNA1Q9UIW2 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PLXNA1Q9UIW2 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PLXNA1Q9UIW2 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PLXNA1Q9UIW2 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PLXNA1Q9UIW2 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PLXNA1Q9UIW2 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PLXNA1Q9UIW2 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PLXNA1Q9UIW2 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
PLXNA1Q9UIW2 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PLXNA1Q9UIW2 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PLXNA1Q9UIW2 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PLXNA1Q9UIW2 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PLXNA1Q9UIW2 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PLXNA1Q9UIW2 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PLXNA1Q9UIW2 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PLXNA1Q9UIW2 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PLXNA1Q9UIW2 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PLXNA1Q9UIW2 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PLXNA1Q9UIW2 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PLXNA1Q9UIW2 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PLXNA1Q9UIW2 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
PLXNA1Q9UIW2 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PLXNA1Q9UIW2 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PLXNA1Q9UIW2 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PLXNA1Q9UIW2 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PLXNA1Q9UIW2 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PLXNA1Q9UIW2 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PLXNA1Q9UIW2 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PLXNA1Q9UIW2 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PLXNA1Q9UIW2 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PLXNA1Q9UIW2 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PLXNA1Q9UIW2 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PLXNA1Q9UIW2 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PLXNA1Q9UIW2 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PLXNA1Q9UIW2 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PLXNA1Q9UIW2 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PLXNA1Q9UIW2 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PLXNA1Q9UIW2 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PLXNA1Q9UIW2 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PLXNA1Q9UIW2 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PLXNA1Q9UIW2 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PLXNA1Q9UIW2 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PLXNA1Q9UIW2 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
PLXNA1Q9UIW2 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PLXNA1Q9UIW2 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PLXNA1Q9UIW2 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
PLXNA1Q9UIW2 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PLXNA1Q9UIW2 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PLXNA1Q9UIW2 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PLXNA1Q9UIW2 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PLXNA1Q9UIW2 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PLXNA1Q9UIW2 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
PLXNA1Q9UIW2 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PLXNA1Q9UIW2 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.64
PLXNA1Q9UIW2 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
PLXNA1Q9UIW2 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PLXNA1Q9UIW2 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PLXNA1Q9UIW2 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PLXNA1Q9UIW2 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PLXNA1Q9UIW2 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PLXNA1Q9UIW2 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PLXNA1Q9UIW2 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PLXNA1Q9UIW2 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PLXNA1Q9UIW2 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms