Protein–RNA interactions for Protein: Q9UDY6

TRIM10, Tripartite motif-containing protein 10, humanhuman

Predictions only

Length 481 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM10Q9UDY6 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
TRIM10Q9UDY6 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TRIM10Q9UDY6 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TRIM10Q9UDY6 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
TRIM10Q9UDY6 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TRIM10Q9UDY6 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TRIM10Q9UDY6 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TRIM10Q9UDY6 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TRIM10Q9UDY6 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TRIM10Q9UDY6 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TRIM10Q9UDY6 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TRIM10Q9UDY6 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TRIM10Q9UDY6 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TRIM10Q9UDY6 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TRIM10Q9UDY6 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TRIM10Q9UDY6 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TRIM10Q9UDY6 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TRIM10Q9UDY6 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TRIM10Q9UDY6 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TRIM10Q9UDY6 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TRIM10Q9UDY6 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TRIM10Q9UDY6 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TRIM10Q9UDY6 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TRIM10Q9UDY6 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TRIM10Q9UDY6 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TRIM10Q9UDY6 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TRIM10Q9UDY6 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TRIM10Q9UDY6 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TRIM10Q9UDY6 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
TRIM10Q9UDY6 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
TRIM10Q9UDY6 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TRIM10Q9UDY6 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TRIM10Q9UDY6 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TRIM10Q9UDY6 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TRIM10Q9UDY6 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TRIM10Q9UDY6 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TRIM10Q9UDY6 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TRIM10Q9UDY6 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TRIM10Q9UDY6 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TRIM10Q9UDY6 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TRIM10Q9UDY6 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TRIM10Q9UDY6 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TRIM10Q9UDY6 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TRIM10Q9UDY6 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
TRIM10Q9UDY6 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TRIM10Q9UDY6 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TRIM10Q9UDY6 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TRIM10Q9UDY6 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TRIM10Q9UDY6 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TRIM10Q9UDY6 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TRIM10Q9UDY6 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TRIM10Q9UDY6 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TRIM10Q9UDY6 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TRIM10Q9UDY6 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TRIM10Q9UDY6 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TRIM10Q9UDY6 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TRIM10Q9UDY6 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TRIM10Q9UDY6 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TRIM10Q9UDY6 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TRIM10Q9UDY6 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TRIM10Q9UDY6 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
TRIM10Q9UDY6 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
TRIM10Q9UDY6 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
TRIM10Q9UDY6 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TRIM10Q9UDY6 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
TRIM10Q9UDY6 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
TRIM10Q9UDY6 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
TRIM10Q9UDY6 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TRIM10Q9UDY6 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TRIM10Q9UDY6 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TRIM10Q9UDY6 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
TRIM10Q9UDY6 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TRIM10Q9UDY6 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TRIM10Q9UDY6 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TRIM10Q9UDY6 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TRIM10Q9UDY6 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
TRIM10Q9UDY6 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
TRIM10Q9UDY6 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
TRIM10Q9UDY6 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
TRIM10Q9UDY6 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
TRIM10Q9UDY6 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
TRIM10Q9UDY6 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
TRIM10Q9UDY6 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
TRIM10Q9UDY6 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TRIM10Q9UDY6 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
TRIM10Q9UDY6 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC23.8■■□□□ 1.4
TRIM10Q9UDY6 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
TRIM10Q9UDY6 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
TRIM10Q9UDY6 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
TRIM10Q9UDY6 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
TRIM10Q9UDY6 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TRIM10Q9UDY6 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
TRIM10Q9UDY6 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
TRIM10Q9UDY6 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
TRIM10Q9UDY6 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TRIM10Q9UDY6 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TRIM10Q9UDY6 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
TRIM10Q9UDY6 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
TRIM10Q9UDY6 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
TRIM10Q9UDY6 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms