Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBD3

XCL2, Cytokine SCM-1 beta, humanhuman

Predictions only

Length 114 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XCL2Q9UBD3 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
XCL2Q9UBD3 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
XCL2Q9UBD3 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
XCL2Q9UBD3 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
XCL2Q9UBD3 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
XCL2Q9UBD3 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
XCL2Q9UBD3 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
XCL2Q9UBD3 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
XCL2Q9UBD3 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
XCL2Q9UBD3 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
XCL2Q9UBD3 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
XCL2Q9UBD3 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
XCL2Q9UBD3 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
XCL2Q9UBD3 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
XCL2Q9UBD3 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
XCL2Q9UBD3 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
XCL2Q9UBD3 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
XCL2Q9UBD3 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
XCL2Q9UBD3 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
XCL2Q9UBD3 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
XCL2Q9UBD3 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
XCL2Q9UBD3 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
XCL2Q9UBD3 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
XCL2Q9UBD3 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
XCL2Q9UBD3 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
XCL2Q9UBD3 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
XCL2Q9UBD3 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
XCL2Q9UBD3 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
XCL2Q9UBD3 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
XCL2Q9UBD3 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
XCL2Q9UBD3 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
XCL2Q9UBD3 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
XCL2Q9UBD3 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
XCL2Q9UBD3 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
XCL2Q9UBD3 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
XCL2Q9UBD3 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
XCL2Q9UBD3 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
XCL2Q9UBD3 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
XCL2Q9UBD3 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
XCL2Q9UBD3 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
XCL2Q9UBD3 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
XCL2Q9UBD3 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
XCL2Q9UBD3 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
XCL2Q9UBD3 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
XCL2Q9UBD3 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
XCL2Q9UBD3 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
XCL2Q9UBD3 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
XCL2Q9UBD3 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
XCL2Q9UBD3 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
XCL2Q9UBD3 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
XCL2Q9UBD3 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
XCL2Q9UBD3 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
XCL2Q9UBD3 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
XCL2Q9UBD3 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
XCL2Q9UBD3 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
XCL2Q9UBD3 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
XCL2Q9UBD3 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
XCL2Q9UBD3 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
XCL2Q9UBD3 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
XCL2Q9UBD3 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
XCL2Q9UBD3 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
XCL2Q9UBD3 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
XCL2Q9UBD3 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
XCL2Q9UBD3 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
XCL2Q9UBD3 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
XCL2Q9UBD3 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
XCL2Q9UBD3 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
XCL2Q9UBD3 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
XCL2Q9UBD3 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
XCL2Q9UBD3 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
XCL2Q9UBD3 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
XCL2Q9UBD3 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
XCL2Q9UBD3 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
XCL2Q9UBD3 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
XCL2Q9UBD3 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
XCL2Q9UBD3 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
XCL2Q9UBD3 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
XCL2Q9UBD3 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
XCL2Q9UBD3 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
XCL2Q9UBD3 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
XCL2Q9UBD3 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
XCL2Q9UBD3 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
XCL2Q9UBD3 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
XCL2Q9UBD3 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
XCL2Q9UBD3 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
XCL2Q9UBD3 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
XCL2Q9UBD3 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
XCL2Q9UBD3 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
XCL2Q9UBD3 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
XCL2Q9UBD3 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
XCL2Q9UBD3 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
XCL2Q9UBD3 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
XCL2Q9UBD3 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
XCL2Q9UBD3 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
XCL2Q9UBD3 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
XCL2Q9UBD3 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
XCL2Q9UBD3 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
XCL2Q9UBD3 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
XCL2Q9UBD3 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
XCL2Q9UBD3 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms