Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2E7

PCDH10, Protocadherin-10, humanhuman

Predictions only

Length 1,040 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDH10Q9P2E7 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
PCDH10Q9P2E7 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PCDH10Q9P2E7 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PCDH10Q9P2E7 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
PCDH10Q9P2E7 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PCDH10Q9P2E7 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PCDH10Q9P2E7 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PCDH10Q9P2E7 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PCDH10Q9P2E7 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PCDH10Q9P2E7 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PCDH10Q9P2E7 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PCDH10Q9P2E7 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PCDH10Q9P2E7 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PCDH10Q9P2E7 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
PCDH10Q9P2E7 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PCDH10Q9P2E7 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
PCDH10Q9P2E7 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PCDH10Q9P2E7 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PCDH10Q9P2E7 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PCDH10Q9P2E7 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PCDH10Q9P2E7 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
PCDH10Q9P2E7 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PCDH10Q9P2E7 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PCDH10Q9P2E7 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
PCDH10Q9P2E7 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
PCDH10Q9P2E7 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PCDH10Q9P2E7 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PCDH10Q9P2E7 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
PCDH10Q9P2E7 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
PCDH10Q9P2E7 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PCDH10Q9P2E7 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
PCDH10Q9P2E7 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
PCDH10Q9P2E7 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PCDH10Q9P2E7 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PCDH10Q9P2E7 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PCDH10Q9P2E7 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PCDH10Q9P2E7 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PCDH10Q9P2E7 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PCDH10Q9P2E7 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PCDH10Q9P2E7 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PCDH10Q9P2E7 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PCDH10Q9P2E7 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PCDH10Q9P2E7 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PCDH10Q9P2E7 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PCDH10Q9P2E7 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PCDH10Q9P2E7 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PCDH10Q9P2E7 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PCDH10Q9P2E7 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PCDH10Q9P2E7 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PCDH10Q9P2E7 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PCDH10Q9P2E7 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PCDH10Q9P2E7 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PCDH10Q9P2E7 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PCDH10Q9P2E7 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PCDH10Q9P2E7 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PCDH10Q9P2E7 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PCDH10Q9P2E7 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PCDH10Q9P2E7 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PCDH10Q9P2E7 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PCDH10Q9P2E7 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PCDH10Q9P2E7 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
PCDH10Q9P2E7 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PCDH10Q9P2E7 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PCDH10Q9P2E7 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PCDH10Q9P2E7 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PCDH10Q9P2E7 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PCDH10Q9P2E7 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PCDH10Q9P2E7 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PCDH10Q9P2E7 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
PCDH10Q9P2E7 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PCDH10Q9P2E7 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PCDH10Q9P2E7 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PCDH10Q9P2E7 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PCDH10Q9P2E7 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PCDH10Q9P2E7 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PCDH10Q9P2E7 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PCDH10Q9P2E7 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PCDH10Q9P2E7 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PCDH10Q9P2E7 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PCDH10Q9P2E7 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PCDH10Q9P2E7 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PCDH10Q9P2E7 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PCDH10Q9P2E7 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PCDH10Q9P2E7 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PCDH10Q9P2E7 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PCDH10Q9P2E7 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PCDH10Q9P2E7 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PCDH10Q9P2E7 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PCDH10Q9P2E7 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PCDH10Q9P2E7 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PCDH10Q9P2E7 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
PCDH10Q9P2E7 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PCDH10Q9P2E7 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PCDH10Q9P2E7 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
PCDH10Q9P2E7 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PCDH10Q9P2E7 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PCDH10Q9P2E7 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PCDH10Q9P2E7 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PCDH10Q9P2E7 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PCDH10Q9P2E7 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms