Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZZ3

CHMP5, Charged multivesicular body protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHMP5Q9NZZ3 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CHMP5Q9NZZ3 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CHMP5Q9NZZ3 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CHMP5Q9NZZ3 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CHMP5Q9NZZ3 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
CHMP5Q9NZZ3 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
CHMP5Q9NZZ3 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CHMP5Q9NZZ3 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
CHMP5Q9NZZ3 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
CHMP5Q9NZZ3 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CHMP5Q9NZZ3 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
CHMP5Q9NZZ3 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
CHMP5Q9NZZ3 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CHMP5Q9NZZ3 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CHMP5Q9NZZ3 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
CHMP5Q9NZZ3 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CHMP5Q9NZZ3 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CHMP5Q9NZZ3 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
CHMP5Q9NZZ3 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CHMP5Q9NZZ3 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
CHMP5Q9NZZ3 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
CHMP5Q9NZZ3 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CHMP5Q9NZZ3 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CHMP5Q9NZZ3 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CHMP5Q9NZZ3 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CHMP5Q9NZZ3 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CHMP5Q9NZZ3 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CHMP5Q9NZZ3 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
CHMP5Q9NZZ3 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC26.3■■□□□ 1.8
CHMP5Q9NZZ3 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
CHMP5Q9NZZ3 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CHMP5Q9NZZ3 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CHMP5Q9NZZ3 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
CHMP5Q9NZZ3 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
CHMP5Q9NZZ3 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CHMP5Q9NZZ3 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CHMP5Q9NZZ3 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CHMP5Q9NZZ3 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
CHMP5Q9NZZ3 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
CHMP5Q9NZZ3 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CHMP5Q9NZZ3 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CHMP5Q9NZZ3 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CHMP5Q9NZZ3 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CHMP5Q9NZZ3 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
CHMP5Q9NZZ3 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CHMP5Q9NZZ3 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CHMP5Q9NZZ3 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
CHMP5Q9NZZ3 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CHMP5Q9NZZ3 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CHMP5Q9NZZ3 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CHMP5Q9NZZ3 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
CHMP5Q9NZZ3 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
CHMP5Q9NZZ3 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
CHMP5Q9NZZ3 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CHMP5Q9NZZ3 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
CHMP5Q9NZZ3 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
CHMP5Q9NZZ3 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CHMP5Q9NZZ3 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
CHMP5Q9NZZ3 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
CHMP5Q9NZZ3 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CHMP5Q9NZZ3 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CHMP5Q9NZZ3 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CHMP5Q9NZZ3 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CHMP5Q9NZZ3 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
CHMP5Q9NZZ3 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CHMP5Q9NZZ3 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CHMP5Q9NZZ3 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CHMP5Q9NZZ3 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
CHMP5Q9NZZ3 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CHMP5Q9NZZ3 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CHMP5Q9NZZ3 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
CHMP5Q9NZZ3 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
CHMP5Q9NZZ3 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
CHMP5Q9NZZ3 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CHMP5Q9NZZ3 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CHMP5Q9NZZ3 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CHMP5Q9NZZ3 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CHMP5Q9NZZ3 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CHMP5Q9NZZ3 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CHMP5Q9NZZ3 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CHMP5Q9NZZ3 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CHMP5Q9NZZ3 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CHMP5Q9NZZ3 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CHMP5Q9NZZ3 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CHMP5Q9NZZ3 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CHMP5Q9NZZ3 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CHMP5Q9NZZ3 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CHMP5Q9NZZ3 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CHMP5Q9NZZ3 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CHMP5Q9NZZ3 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CHMP5Q9NZZ3 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CHMP5Q9NZZ3 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CHMP5Q9NZZ3 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CHMP5Q9NZZ3 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CHMP5Q9NZZ3 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CHMP5Q9NZZ3 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CHMP5Q9NZZ3 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
CHMP5Q9NZZ3 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CHMP5Q9NZZ3 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CHMP5Q9NZZ3 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.4 ms