Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZM1

MYOF, Myoferlin, humanhuman

Predictions only

Length 2,061 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYOFQ9NZM1 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
MYOFQ9NZM1 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
MYOFQ9NZM1 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
MYOFQ9NZM1 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
MYOFQ9NZM1 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
MYOFQ9NZM1 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MYOFQ9NZM1 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MYOFQ9NZM1 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MYOFQ9NZM1 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MYOFQ9NZM1 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
MYOFQ9NZM1 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MYOFQ9NZM1 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
MYOFQ9NZM1 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
MYOFQ9NZM1 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MYOFQ9NZM1 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MYOFQ9NZM1 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MYOFQ9NZM1 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
MYOFQ9NZM1 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
MYOFQ9NZM1 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
MYOFQ9NZM1 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
MYOFQ9NZM1 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
MYOFQ9NZM1 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
MYOFQ9NZM1 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
MYOFQ9NZM1 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
MYOFQ9NZM1 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MYOFQ9NZM1 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
MYOFQ9NZM1 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MYOFQ9NZM1 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
MYOFQ9NZM1 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
MYOFQ9NZM1 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MYOFQ9NZM1 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
MYOFQ9NZM1 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
MYOFQ9NZM1 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
MYOFQ9NZM1 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
MYOFQ9NZM1 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
MYOFQ9NZM1 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
MYOFQ9NZM1 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
MYOFQ9NZM1 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
MYOFQ9NZM1 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
MYOFQ9NZM1 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
MYOFQ9NZM1 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
MYOFQ9NZM1 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
MYOFQ9NZM1 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
MYOFQ9NZM1 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
MYOFQ9NZM1 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
MYOFQ9NZM1 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MYOFQ9NZM1 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MYOFQ9NZM1 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MYOFQ9NZM1 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MYOFQ9NZM1 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
MYOFQ9NZM1 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MYOFQ9NZM1 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
MYOFQ9NZM1 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
MYOFQ9NZM1 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
MYOFQ9NZM1 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
MYOFQ9NZM1 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
MYOFQ9NZM1 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
MYOFQ9NZM1 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
MYOFQ9NZM1 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
MYOFQ9NZM1 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
MYOFQ9NZM1 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
MYOFQ9NZM1 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
MYOFQ9NZM1 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
MYOFQ9NZM1 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
MYOFQ9NZM1 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
MYOFQ9NZM1 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
MYOFQ9NZM1 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
MYOFQ9NZM1 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC22.88■■□□□ 1.25
MYOFQ9NZM1 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
MYOFQ9NZM1 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
MYOFQ9NZM1 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
MYOFQ9NZM1 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
MYOFQ9NZM1 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
MYOFQ9NZM1 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
MYOFQ9NZM1 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MYOFQ9NZM1 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
MYOFQ9NZM1 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MYOFQ9NZM1 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
MYOFQ9NZM1 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
MYOFQ9NZM1 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
MYOFQ9NZM1 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
MYOFQ9NZM1 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
MYOFQ9NZM1 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
MYOFQ9NZM1 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
MYOFQ9NZM1 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
MYOFQ9NZM1 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
MYOFQ9NZM1 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
MYOFQ9NZM1 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MYOFQ9NZM1 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
MYOFQ9NZM1 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MYOFQ9NZM1 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MYOFQ9NZM1 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
MYOFQ9NZM1 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
MYOFQ9NZM1 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MYOFQ9NZM1 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
MYOFQ9NZM1 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
MYOFQ9NZM1 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MYOFQ9NZM1 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
MYOFQ9NZM1 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MYOFQ9NZM1 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms