Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYL9

TMOD3, Tropomodulin-3, humanhuman

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMOD3Q9NYL9 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
TMOD3Q9NYL9 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
TMOD3Q9NYL9 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
TMOD3Q9NYL9 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
TMOD3Q9NYL9 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
TMOD3Q9NYL9 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
TMOD3Q9NYL9 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
TMOD3Q9NYL9 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
TMOD3Q9NYL9 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
TMOD3Q9NYL9 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
TMOD3Q9NYL9 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
TMOD3Q9NYL9 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
TMOD3Q9NYL9 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
TMOD3Q9NYL9 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
TMOD3Q9NYL9 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
TMOD3Q9NYL9 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
TMOD3Q9NYL9 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
TMOD3Q9NYL9 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
TMOD3Q9NYL9 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
TMOD3Q9NYL9 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
TMOD3Q9NYL9 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
TMOD3Q9NYL9 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
TMOD3Q9NYL9 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC29.06■■■□□ 2.24
TMOD3Q9NYL9 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
TMOD3Q9NYL9 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
TMOD3Q9NYL9 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
TMOD3Q9NYL9 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC29.06■■■□□ 2.24
TMOD3Q9NYL9 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
TMOD3Q9NYL9 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
TMOD3Q9NYL9 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
TMOD3Q9NYL9 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
TMOD3Q9NYL9 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
TMOD3Q9NYL9 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
TMOD3Q9NYL9 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
TMOD3Q9NYL9 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
TMOD3Q9NYL9 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
TMOD3Q9NYL9 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
TMOD3Q9NYL9 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
TMOD3Q9NYL9 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
TMOD3Q9NYL9 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.05■■■□□ 2.24
TMOD3Q9NYL9 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
TMOD3Q9NYL9 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
TMOD3Q9NYL9 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
TMOD3Q9NYL9 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
TMOD3Q9NYL9 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
TMOD3Q9NYL9 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
TMOD3Q9NYL9 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
TMOD3Q9NYL9 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC29.04■■■□□ 2.24
TMOD3Q9NYL9 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
TMOD3Q9NYL9 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
TMOD3Q9NYL9 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
TMOD3Q9NYL9 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
TMOD3Q9NYL9 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
TMOD3Q9NYL9 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
TMOD3Q9NYL9 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
TMOD3Q9NYL9 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
TMOD3Q9NYL9 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
TMOD3Q9NYL9 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.03■■■□□ 2.24
TMOD3Q9NYL9 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
TMOD3Q9NYL9 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
TMOD3Q9NYL9 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
TMOD3Q9NYL9 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
TMOD3Q9NYL9 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
TMOD3Q9NYL9 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
TMOD3Q9NYL9 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
TMOD3Q9NYL9 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC29.02■■■□□ 2.24
TMOD3Q9NYL9 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
TMOD3Q9NYL9 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
TMOD3Q9NYL9 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
TMOD3Q9NYL9 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC29.02■■■□□ 2.24
TMOD3Q9NYL9 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
TMOD3Q9NYL9 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
TMOD3Q9NYL9 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
TMOD3Q9NYL9 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
TMOD3Q9NYL9 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
TMOD3Q9NYL9 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
TMOD3Q9NYL9 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
TMOD3Q9NYL9 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
TMOD3Q9NYL9 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
TMOD3Q9NYL9 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
TMOD3Q9NYL9 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
TMOD3Q9NYL9 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
TMOD3Q9NYL9 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
TMOD3Q9NYL9 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
TMOD3Q9NYL9 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
TMOD3Q9NYL9 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
TMOD3Q9NYL9 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
TMOD3Q9NYL9 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
TMOD3Q9NYL9 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
TMOD3Q9NYL9 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
TMOD3Q9NYL9 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
TMOD3Q9NYL9 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
TMOD3Q9NYL9 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
TMOD3Q9NYL9 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
TMOD3Q9NYL9 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
TMOD3Q9NYL9 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
TMOD3Q9NYL9 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC28.99■■■□□ 2.23
TMOD3Q9NYL9 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
TMOD3Q9NYL9 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
TMOD3Q9NYL9 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms