Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYJ7

DLL3, Delta-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 618 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DLL3Q9NYJ7 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
DLL3Q9NYJ7 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
DLL3Q9NYJ7 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
DLL3Q9NYJ7 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
DLL3Q9NYJ7 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
DLL3Q9NYJ7 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
DLL3Q9NYJ7 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
DLL3Q9NYJ7 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
DLL3Q9NYJ7 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
DLL3Q9NYJ7 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
DLL3Q9NYJ7 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
DLL3Q9NYJ7 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
DLL3Q9NYJ7 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
DLL3Q9NYJ7 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
DLL3Q9NYJ7 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
DLL3Q9NYJ7 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
DLL3Q9NYJ7 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
DLL3Q9NYJ7 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
DLL3Q9NYJ7 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
DLL3Q9NYJ7 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
DLL3Q9NYJ7 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
DLL3Q9NYJ7 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
DLL3Q9NYJ7 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
DLL3Q9NYJ7 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
DLL3Q9NYJ7 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
DLL3Q9NYJ7 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
DLL3Q9NYJ7 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
DLL3Q9NYJ7 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
DLL3Q9NYJ7 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
DLL3Q9NYJ7 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
DLL3Q9NYJ7 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
DLL3Q9NYJ7 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
DLL3Q9NYJ7 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
DLL3Q9NYJ7 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
DLL3Q9NYJ7 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
DLL3Q9NYJ7 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
DLL3Q9NYJ7 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
DLL3Q9NYJ7 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
DLL3Q9NYJ7 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
DLL3Q9NYJ7 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
DLL3Q9NYJ7 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
DLL3Q9NYJ7 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
DLL3Q9NYJ7 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
DLL3Q9NYJ7 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
DLL3Q9NYJ7 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
DLL3Q9NYJ7 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
DLL3Q9NYJ7 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
DLL3Q9NYJ7 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
DLL3Q9NYJ7 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
DLL3Q9NYJ7 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
DLL3Q9NYJ7 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
DLL3Q9NYJ7 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
DLL3Q9NYJ7 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
DLL3Q9NYJ7 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
DLL3Q9NYJ7 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
DLL3Q9NYJ7 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
DLL3Q9NYJ7 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
DLL3Q9NYJ7 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
DLL3Q9NYJ7 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
DLL3Q9NYJ7 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
DLL3Q9NYJ7 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
DLL3Q9NYJ7 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
DLL3Q9NYJ7 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
DLL3Q9NYJ7 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
DLL3Q9NYJ7 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
DLL3Q9NYJ7 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
DLL3Q9NYJ7 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
DLL3Q9NYJ7 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
DLL3Q9NYJ7 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
DLL3Q9NYJ7 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
DLL3Q9NYJ7 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
DLL3Q9NYJ7 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
DLL3Q9NYJ7 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
DLL3Q9NYJ7 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
DLL3Q9NYJ7 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
DLL3Q9NYJ7 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
DLL3Q9NYJ7 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
DLL3Q9NYJ7 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
DLL3Q9NYJ7 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
DLL3Q9NYJ7 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
DLL3Q9NYJ7 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
DLL3Q9NYJ7 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
DLL3Q9NYJ7 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
DLL3Q9NYJ7 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
DLL3Q9NYJ7 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
DLL3Q9NYJ7 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
DLL3Q9NYJ7 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
DLL3Q9NYJ7 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
DLL3Q9NYJ7 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
DLL3Q9NYJ7 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
DLL3Q9NYJ7 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
DLL3Q9NYJ7 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
DLL3Q9NYJ7 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
DLL3Q9NYJ7 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
DLL3Q9NYJ7 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
DLL3Q9NYJ7 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
DLL3Q9NYJ7 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
DLL3Q9NYJ7 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
DLL3Q9NYJ7 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
DLL3Q9NYJ7 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms