Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX76

CMTM6, CKLF-like MARVEL transmembrane domain-containing protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMTM6Q9NX76 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CMTM6Q9NX76 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CMTM6Q9NX76 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CMTM6Q9NX76 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CMTM6Q9NX76 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CMTM6Q9NX76 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CMTM6Q9NX76 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CMTM6Q9NX76 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CMTM6Q9NX76 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CMTM6Q9NX76 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CMTM6Q9NX76 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CMTM6Q9NX76 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CMTM6Q9NX76 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CMTM6Q9NX76 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CMTM6Q9NX76 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CMTM6Q9NX76 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CMTM6Q9NX76 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CMTM6Q9NX76 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CMTM6Q9NX76 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
CMTM6Q9NX76 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
CMTM6Q9NX76 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CMTM6Q9NX76 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CMTM6Q9NX76 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CMTM6Q9NX76 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CMTM6Q9NX76 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CMTM6Q9NX76 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CMTM6Q9NX76 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CMTM6Q9NX76 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CMTM6Q9NX76 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CMTM6Q9NX76 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CMTM6Q9NX76 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CMTM6Q9NX76 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CMTM6Q9NX76 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
CMTM6Q9NX76 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CMTM6Q9NX76 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CMTM6Q9NX76 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CMTM6Q9NX76 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CMTM6Q9NX76 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CMTM6Q9NX76 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
CMTM6Q9NX76 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CMTM6Q9NX76 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CMTM6Q9NX76 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CMTM6Q9NX76 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CMTM6Q9NX76 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CMTM6Q9NX76 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CMTM6Q9NX76 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CMTM6Q9NX76 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CMTM6Q9NX76 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CMTM6Q9NX76 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CMTM6Q9NX76 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CMTM6Q9NX76 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CMTM6Q9NX76 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CMTM6Q9NX76 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CMTM6Q9NX76 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CMTM6Q9NX76 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CMTM6Q9NX76 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CMTM6Q9NX76 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CMTM6Q9NX76 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CMTM6Q9NX76 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CMTM6Q9NX76 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CMTM6Q9NX76 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CMTM6Q9NX76 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CMTM6Q9NX76 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CMTM6Q9NX76 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CMTM6Q9NX76 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CMTM6Q9NX76 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CMTM6Q9NX76 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CMTM6Q9NX76 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CMTM6Q9NX76 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
CMTM6Q9NX76 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
CMTM6Q9NX76 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
CMTM6Q9NX76 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
CMTM6Q9NX76 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
CMTM6Q9NX76 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
CMTM6Q9NX76 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC21.14■□□□□ 0.98
CMTM6Q9NX76 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
CMTM6Q9NX76 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
CMTM6Q9NX76 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
CMTM6Q9NX76 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CMTM6Q9NX76 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CMTM6Q9NX76 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CMTM6Q9NX76 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CMTM6Q9NX76 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CMTM6Q9NX76 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CMTM6Q9NX76 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CMTM6Q9NX76 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CMTM6Q9NX76 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CMTM6Q9NX76 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CMTM6Q9NX76 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CMTM6Q9NX76 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CMTM6Q9NX76 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CMTM6Q9NX76 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CMTM6Q9NX76 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CMTM6Q9NX76 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CMTM6Q9NX76 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CMTM6Q9NX76 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CMTM6Q9NX76 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CMTM6Q9NX76 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CMTM6Q9NX76 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CMTM6Q9NX76 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms