Protein–RNA interactions for Protein: Q9NW38

FANCL, E3 ubiquitin-protein ligase FANCL, humanhuman

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FANCLQ9NW38 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
FANCLQ9NW38 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
FANCLQ9NW38 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
FANCLQ9NW38 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
FANCLQ9NW38 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
FANCLQ9NW38 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
FANCLQ9NW38 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
FANCLQ9NW38 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
FANCLQ9NW38 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
FANCLQ9NW38 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
FANCLQ9NW38 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
FANCLQ9NW38 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
FANCLQ9NW38 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
FANCLQ9NW38 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
FANCLQ9NW38 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
FANCLQ9NW38 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
FANCLQ9NW38 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
FANCLQ9NW38 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
FANCLQ9NW38 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
FANCLQ9NW38 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
FANCLQ9NW38 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
FANCLQ9NW38 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
FANCLQ9NW38 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
FANCLQ9NW38 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
FANCLQ9NW38 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
FANCLQ9NW38 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
FANCLQ9NW38 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
FANCLQ9NW38 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
FANCLQ9NW38 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
FANCLQ9NW38 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
FANCLQ9NW38 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
FANCLQ9NW38 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
FANCLQ9NW38 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
FANCLQ9NW38 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
FANCLQ9NW38 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
FANCLQ9NW38 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
FANCLQ9NW38 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
FANCLQ9NW38 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
FANCLQ9NW38 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
FANCLQ9NW38 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
FANCLQ9NW38 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
FANCLQ9NW38 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
FANCLQ9NW38 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
FANCLQ9NW38 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
FANCLQ9NW38 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
FANCLQ9NW38 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
FANCLQ9NW38 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
FANCLQ9NW38 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
FANCLQ9NW38 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
FANCLQ9NW38 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
FANCLQ9NW38 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
FANCLQ9NW38 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
FANCLQ9NW38 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
FANCLQ9NW38 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
FANCLQ9NW38 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
FANCLQ9NW38 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
FANCLQ9NW38 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
FANCLQ9NW38 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
FANCLQ9NW38 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
FANCLQ9NW38 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
FANCLQ9NW38 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
FANCLQ9NW38 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
FANCLQ9NW38 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
FANCLQ9NW38 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
FANCLQ9NW38 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
FANCLQ9NW38 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
FANCLQ9NW38 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
FANCLQ9NW38 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
FANCLQ9NW38 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
FANCLQ9NW38 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
FANCLQ9NW38 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
FANCLQ9NW38 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
FANCLQ9NW38 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
FANCLQ9NW38 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
FANCLQ9NW38 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
FANCLQ9NW38 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
FANCLQ9NW38 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
FANCLQ9NW38 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
FANCLQ9NW38 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
FANCLQ9NW38 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
FANCLQ9NW38 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
FANCLQ9NW38 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
FANCLQ9NW38 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
FANCLQ9NW38 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
FANCLQ9NW38 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
FANCLQ9NW38 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
FANCLQ9NW38 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
FANCLQ9NW38 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
FANCLQ9NW38 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
FANCLQ9NW38 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
FANCLQ9NW38 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
FANCLQ9NW38 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
FANCLQ9NW38 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
FANCLQ9NW38 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
FANCLQ9NW38 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
FANCLQ9NW38 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
FANCLQ9NW38 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
FANCLQ9NW38 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
FANCLQ9NW38 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
FANCLQ9NW38 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms