Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUS5

AP5S1, AP-5 complex subunit sigma-1, humanhuman

Predictions only

Length 200 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP5S1Q9NUS5 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
AP5S1Q9NUS5 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
AP5S1Q9NUS5 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
AP5S1Q9NUS5 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
AP5S1Q9NUS5 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
AP5S1Q9NUS5 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
AP5S1Q9NUS5 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
AP5S1Q9NUS5 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
AP5S1Q9NUS5 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
AP5S1Q9NUS5 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
AP5S1Q9NUS5 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
AP5S1Q9NUS5 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
AP5S1Q9NUS5 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
AP5S1Q9NUS5 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
AP5S1Q9NUS5 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
AP5S1Q9NUS5 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
AP5S1Q9NUS5 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
AP5S1Q9NUS5 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
AP5S1Q9NUS5 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
AP5S1Q9NUS5 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
AP5S1Q9NUS5 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
AP5S1Q9NUS5 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
AP5S1Q9NUS5 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
AP5S1Q9NUS5 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
AP5S1Q9NUS5 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
AP5S1Q9NUS5 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
AP5S1Q9NUS5 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
AP5S1Q9NUS5 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
AP5S1Q9NUS5 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
AP5S1Q9NUS5 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
AP5S1Q9NUS5 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
AP5S1Q9NUS5 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
AP5S1Q9NUS5 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
AP5S1Q9NUS5 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
AP5S1Q9NUS5 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
AP5S1Q9NUS5 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
AP5S1Q9NUS5 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
AP5S1Q9NUS5 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
AP5S1Q9NUS5 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
AP5S1Q9NUS5 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
AP5S1Q9NUS5 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
AP5S1Q9NUS5 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
AP5S1Q9NUS5 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
AP5S1Q9NUS5 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
AP5S1Q9NUS5 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
AP5S1Q9NUS5 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
AP5S1Q9NUS5 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
AP5S1Q9NUS5 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
AP5S1Q9NUS5 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
AP5S1Q9NUS5 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
AP5S1Q9NUS5 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
AP5S1Q9NUS5 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
AP5S1Q9NUS5 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
AP5S1Q9NUS5 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
AP5S1Q9NUS5 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
AP5S1Q9NUS5 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
AP5S1Q9NUS5 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
AP5S1Q9NUS5 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
AP5S1Q9NUS5 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
AP5S1Q9NUS5 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
AP5S1Q9NUS5 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
AP5S1Q9NUS5 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
AP5S1Q9NUS5 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
AP5S1Q9NUS5 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
AP5S1Q9NUS5 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
AP5S1Q9NUS5 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
AP5S1Q9NUS5 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
AP5S1Q9NUS5 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
AP5S1Q9NUS5 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
AP5S1Q9NUS5 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
AP5S1Q9NUS5 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
AP5S1Q9NUS5 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
AP5S1Q9NUS5 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
AP5S1Q9NUS5 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
AP5S1Q9NUS5 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
AP5S1Q9NUS5 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
AP5S1Q9NUS5 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
AP5S1Q9NUS5 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
AP5S1Q9NUS5 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
AP5S1Q9NUS5 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
AP5S1Q9NUS5 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
AP5S1Q9NUS5 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
AP5S1Q9NUS5 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
AP5S1Q9NUS5 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
AP5S1Q9NUS5 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
AP5S1Q9NUS5 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
AP5S1Q9NUS5 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
AP5S1Q9NUS5 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
AP5S1Q9NUS5 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
AP5S1Q9NUS5 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
AP5S1Q9NUS5 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
AP5S1Q9NUS5 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
AP5S1Q9NUS5 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
AP5S1Q9NUS5 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
AP5S1Q9NUS5 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
AP5S1Q9NUS5 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
AP5S1Q9NUS5 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
AP5S1Q9NUS5 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
AP5S1Q9NUS5 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
AP5S1Q9NUS5 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms