Protein–RNA interactions for Protein: Q9NU39

FOXD4L1, Forkhead box protein D4-like 1, humanhuman

Predictions only

Length 408 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4L1Q9NU39 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
FOXD4L1Q9NU39 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
FOXD4L1Q9NU39 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
FOXD4L1Q9NU39 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
FOXD4L1Q9NU39 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
FOXD4L1Q9NU39 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
FOXD4L1Q9NU39 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
FOXD4L1Q9NU39 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
FOXD4L1Q9NU39 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
FOXD4L1Q9NU39 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
FOXD4L1Q9NU39 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
FOXD4L1Q9NU39 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
FOXD4L1Q9NU39 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
FOXD4L1Q9NU39 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
FOXD4L1Q9NU39 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
FOXD4L1Q9NU39 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
FOXD4L1Q9NU39 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
FOXD4L1Q9NU39 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
FOXD4L1Q9NU39 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
FOXD4L1Q9NU39 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
FOXD4L1Q9NU39 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
FOXD4L1Q9NU39 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
FOXD4L1Q9NU39 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
FOXD4L1Q9NU39 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
FOXD4L1Q9NU39 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
FOXD4L1Q9NU39 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
FOXD4L1Q9NU39 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
FOXD4L1Q9NU39 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
FOXD4L1Q9NU39 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
FOXD4L1Q9NU39 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
FOXD4L1Q9NU39 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
FOXD4L1Q9NU39 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
FOXD4L1Q9NU39 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC26.5■■□□□ 1.83
FOXD4L1Q9NU39 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
FOXD4L1Q9NU39 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
FOXD4L1Q9NU39 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
FOXD4L1Q9NU39 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC26.49■■□□□ 1.83
FOXD4L1Q9NU39 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
FOXD4L1Q9NU39 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
FOXD4L1Q9NU39 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
FOXD4L1Q9NU39 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
FOXD4L1Q9NU39 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
FOXD4L1Q9NU39 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
FOXD4L1Q9NU39 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
FOXD4L1Q9NU39 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
FOXD4L1Q9NU39 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
FOXD4L1Q9NU39 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
FOXD4L1Q9NU39 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
FOXD4L1Q9NU39 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
FOXD4L1Q9NU39 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
FOXD4L1Q9NU39 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
FOXD4L1Q9NU39 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
FOXD4L1Q9NU39 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
FOXD4L1Q9NU39 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
FOXD4L1Q9NU39 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
FOXD4L1Q9NU39 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
FOXD4L1Q9NU39 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
FOXD4L1Q9NU39 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
FOXD4L1Q9NU39 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
FOXD4L1Q9NU39 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
FOXD4L1Q9NU39 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
FOXD4L1Q9NU39 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
FOXD4L1Q9NU39 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
FOXD4L1Q9NU39 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
FOXD4L1Q9NU39 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
FOXD4L1Q9NU39 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
FOXD4L1Q9NU39 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
FOXD4L1Q9NU39 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
FOXD4L1Q9NU39 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
FOXD4L1Q9NU39 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
FOXD4L1Q9NU39 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
FOXD4L1Q9NU39 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
FOXD4L1Q9NU39 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
FOXD4L1Q9NU39 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
FOXD4L1Q9NU39 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
FOXD4L1Q9NU39 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
FOXD4L1Q9NU39 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
FOXD4L1Q9NU39 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
FOXD4L1Q9NU39 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
FOXD4L1Q9NU39 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC26.46■■□□□ 1.83
FOXD4L1Q9NU39 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
FOXD4L1Q9NU39 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
FOXD4L1Q9NU39 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
FOXD4L1Q9NU39 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
FOXD4L1Q9NU39 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
FOXD4L1Q9NU39 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
FOXD4L1Q9NU39 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
FOXD4L1Q9NU39 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
FOXD4L1Q9NU39 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
FOXD4L1Q9NU39 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
FOXD4L1Q9NU39 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
FOXD4L1Q9NU39 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
FOXD4L1Q9NU39 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
FOXD4L1Q9NU39 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
FOXD4L1Q9NU39 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
FOXD4L1Q9NU39 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
FOXD4L1Q9NU39 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
FOXD4L1Q9NU39 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
FOXD4L1Q9NU39 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
FOXD4L1Q9NU39 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.1 ms