Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSA3

CTNNBIP1, Beta-catenin-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 81 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNBIP1Q9NSA3 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CTNNBIP1Q9NSA3 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CTNNBIP1Q9NSA3 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CTNNBIP1Q9NSA3 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CTNNBIP1Q9NSA3 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CTNNBIP1Q9NSA3 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CTNNBIP1Q9NSA3 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CTNNBIP1Q9NSA3 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CTNNBIP1Q9NSA3 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CTNNBIP1Q9NSA3 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CTNNBIP1Q9NSA3 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CTNNBIP1Q9NSA3 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CTNNBIP1Q9NSA3 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CTNNBIP1Q9NSA3 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CTNNBIP1Q9NSA3 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CTNNBIP1Q9NSA3 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CTNNBIP1Q9NSA3 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CTNNBIP1Q9NSA3 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CTNNBIP1Q9NSA3 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CTNNBIP1Q9NSA3 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CTNNBIP1Q9NSA3 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CTNNBIP1Q9NSA3 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CTNNBIP1Q9NSA3 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CTNNBIP1Q9NSA3 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CTNNBIP1Q9NSA3 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CTNNBIP1Q9NSA3 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CTNNBIP1Q9NSA3 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CTNNBIP1Q9NSA3 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CTNNBIP1Q9NSA3 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CTNNBIP1Q9NSA3 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CTNNBIP1Q9NSA3 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
CTNNBIP1Q9NSA3 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CTNNBIP1Q9NSA3 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CTNNBIP1Q9NSA3 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CTNNBIP1Q9NSA3 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CTNNBIP1Q9NSA3 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CTNNBIP1Q9NSA3 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CTNNBIP1Q9NSA3 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CTNNBIP1Q9NSA3 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
CTNNBIP1Q9NSA3 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CTNNBIP1Q9NSA3 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
CTNNBIP1Q9NSA3 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CTNNBIP1Q9NSA3 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CTNNBIP1Q9NSA3 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CTNNBIP1Q9NSA3 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CTNNBIP1Q9NSA3 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CTNNBIP1Q9NSA3 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CTNNBIP1Q9NSA3 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CTNNBIP1Q9NSA3 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CTNNBIP1Q9NSA3 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CTNNBIP1Q9NSA3 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CTNNBIP1Q9NSA3 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CTNNBIP1Q9NSA3 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CTNNBIP1Q9NSA3 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CTNNBIP1Q9NSA3 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CTNNBIP1Q9NSA3 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CTNNBIP1Q9NSA3 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CTNNBIP1Q9NSA3 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CTNNBIP1Q9NSA3 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CTNNBIP1Q9NSA3 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CTNNBIP1Q9NSA3 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CTNNBIP1Q9NSA3 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CTNNBIP1Q9NSA3 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CTNNBIP1Q9NSA3 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CTNNBIP1Q9NSA3 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CTNNBIP1Q9NSA3 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CTNNBIP1Q9NSA3 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
CTNNBIP1Q9NSA3 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CTNNBIP1Q9NSA3 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CTNNBIP1Q9NSA3 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CTNNBIP1Q9NSA3 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CTNNBIP1Q9NSA3 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CTNNBIP1Q9NSA3 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CTNNBIP1Q9NSA3 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CTNNBIP1Q9NSA3 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CTNNBIP1Q9NSA3 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CTNNBIP1Q9NSA3 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CTNNBIP1Q9NSA3 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CTNNBIP1Q9NSA3 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CTNNBIP1Q9NSA3 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CTNNBIP1Q9NSA3 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CTNNBIP1Q9NSA3 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CTNNBIP1Q9NSA3 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CTNNBIP1Q9NSA3 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CTNNBIP1Q9NSA3 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CTNNBIP1Q9NSA3 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CTNNBIP1Q9NSA3 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CTNNBIP1Q9NSA3 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CTNNBIP1Q9NSA3 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CTNNBIP1Q9NSA3 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CTNNBIP1Q9NSA3 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CTNNBIP1Q9NSA3 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CTNNBIP1Q9NSA3 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CTNNBIP1Q9NSA3 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CTNNBIP1Q9NSA3 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
CTNNBIP1Q9NSA3 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CTNNBIP1Q9NSA3 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CTNNBIP1Q9NSA3 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CTNNBIP1Q9NSA3 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CTNNBIP1Q9NSA3 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms