Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRD9

DUOX1, Dual oxidase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUOX1Q9NRD9 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
DUOX1Q9NRD9 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
DUOX1Q9NRD9 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
DUOX1Q9NRD9 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
DUOX1Q9NRD9 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
DUOX1Q9NRD9 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
DUOX1Q9NRD9 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
DUOX1Q9NRD9 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
DUOX1Q9NRD9 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
DUOX1Q9NRD9 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
DUOX1Q9NRD9 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
DUOX1Q9NRD9 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
DUOX1Q9NRD9 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
DUOX1Q9NRD9 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
DUOX1Q9NRD9 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
DUOX1Q9NRD9 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
DUOX1Q9NRD9 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
DUOX1Q9NRD9 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
DUOX1Q9NRD9 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
DUOX1Q9NRD9 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
DUOX1Q9NRD9 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
DUOX1Q9NRD9 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
DUOX1Q9NRD9 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
DUOX1Q9NRD9 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC27.49■■□□□ 1.99
DUOX1Q9NRD9 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
DUOX1Q9NRD9 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
DUOX1Q9NRD9 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
DUOX1Q9NRD9 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
DUOX1Q9NRD9 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
DUOX1Q9NRD9 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
DUOX1Q9NRD9 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
DUOX1Q9NRD9 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC27.48■■□□□ 1.99
DUOX1Q9NRD9 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
DUOX1Q9NRD9 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
DUOX1Q9NRD9 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
DUOX1Q9NRD9 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
DUOX1Q9NRD9 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
DUOX1Q9NRD9 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
DUOX1Q9NRD9 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
DUOX1Q9NRD9 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
DUOX1Q9NRD9 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
DUOX1Q9NRD9 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
DUOX1Q9NRD9 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
DUOX1Q9NRD9 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
DUOX1Q9NRD9 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
DUOX1Q9NRD9 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
DUOX1Q9NRD9 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
DUOX1Q9NRD9 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
DUOX1Q9NRD9 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC27.45■■□□□ 1.99
DUOX1Q9NRD9 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
DUOX1Q9NRD9 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
DUOX1Q9NRD9 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
DUOX1Q9NRD9 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC27.45■■□□□ 1.99
DUOX1Q9NRD9 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC27.45■■□□□ 1.99
DUOX1Q9NRD9 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
DUOX1Q9NRD9 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC27.45■■□□□ 1.98
DUOX1Q9NRD9 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.98
DUOX1Q9NRD9 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
DUOX1Q9NRD9 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
DUOX1Q9NRD9 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
DUOX1Q9NRD9 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
DUOX1Q9NRD9 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
DUOX1Q9NRD9 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
DUOX1Q9NRD9 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC27.44■■□□□ 1.98
DUOX1Q9NRD9 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
DUOX1Q9NRD9 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
DUOX1Q9NRD9 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
DUOX1Q9NRD9 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
DUOX1Q9NRD9 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
DUOX1Q9NRD9 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
DUOX1Q9NRD9 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
DUOX1Q9NRD9 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
DUOX1Q9NRD9 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
DUOX1Q9NRD9 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
DUOX1Q9NRD9 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
DUOX1Q9NRD9 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
DUOX1Q9NRD9 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
DUOX1Q9NRD9 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
DUOX1Q9NRD9 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
DUOX1Q9NRD9 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
DUOX1Q9NRD9 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
DUOX1Q9NRD9 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
DUOX1Q9NRD9 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
DUOX1Q9NRD9 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
DUOX1Q9NRD9 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
DUOX1Q9NRD9 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
DUOX1Q9NRD9 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
DUOX1Q9NRD9 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
DUOX1Q9NRD9 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
DUOX1Q9NRD9 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
DUOX1Q9NRD9 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
DUOX1Q9NRD9 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
DUOX1Q9NRD9 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
DUOX1Q9NRD9 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
DUOX1Q9NRD9 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
DUOX1Q9NRD9 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
DUOX1Q9NRD9 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
DUOX1Q9NRD9 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
DUOX1Q9NRD9 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
DUOX1Q9NRD9 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.3 ms