Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQH7

XPNPEP3, Probable Xaa-Pro aminopeptidase 3, humanhuman

Predictions only

Length 507 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XPNPEP3Q9NQH7 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
XPNPEP3Q9NQH7 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
XPNPEP3Q9NQH7 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
XPNPEP3Q9NQH7 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
XPNPEP3Q9NQH7 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
XPNPEP3Q9NQH7 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
XPNPEP3Q9NQH7 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
XPNPEP3Q9NQH7 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
XPNPEP3Q9NQH7 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
XPNPEP3Q9NQH7 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
XPNPEP3Q9NQH7 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
XPNPEP3Q9NQH7 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
XPNPEP3Q9NQH7 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
XPNPEP3Q9NQH7 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
XPNPEP3Q9NQH7 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
XPNPEP3Q9NQH7 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
XPNPEP3Q9NQH7 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
XPNPEP3Q9NQH7 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
XPNPEP3Q9NQH7 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
XPNPEP3Q9NQH7 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
XPNPEP3Q9NQH7 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
XPNPEP3Q9NQH7 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
XPNPEP3Q9NQH7 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
XPNPEP3Q9NQH7 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
XPNPEP3Q9NQH7 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
XPNPEP3Q9NQH7 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
XPNPEP3Q9NQH7 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC25.11■■□□□ 1.61
XPNPEP3Q9NQH7 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
XPNPEP3Q9NQH7 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
XPNPEP3Q9NQH7 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
XPNPEP3Q9NQH7 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
XPNPEP3Q9NQH7 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
XPNPEP3Q9NQH7 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
XPNPEP3Q9NQH7 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
XPNPEP3Q9NQH7 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
XPNPEP3Q9NQH7 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
XPNPEP3Q9NQH7 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
XPNPEP3Q9NQH7 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
XPNPEP3Q9NQH7 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
XPNPEP3Q9NQH7 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
XPNPEP3Q9NQH7 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
XPNPEP3Q9NQH7 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
XPNPEP3Q9NQH7 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
XPNPEP3Q9NQH7 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
XPNPEP3Q9NQH7 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
XPNPEP3Q9NQH7 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
XPNPEP3Q9NQH7 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
XPNPEP3Q9NQH7 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
XPNPEP3Q9NQH7 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
XPNPEP3Q9NQH7 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
XPNPEP3Q9NQH7 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
XPNPEP3Q9NQH7 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
XPNPEP3Q9NQH7 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
XPNPEP3Q9NQH7 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
XPNPEP3Q9NQH7 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
XPNPEP3Q9NQH7 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
XPNPEP3Q9NQH7 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
XPNPEP3Q9NQH7 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
XPNPEP3Q9NQH7 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
XPNPEP3Q9NQH7 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
XPNPEP3Q9NQH7 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
XPNPEP3Q9NQH7 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
XPNPEP3Q9NQH7 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
XPNPEP3Q9NQH7 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
XPNPEP3Q9NQH7 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC25.06■■□□□ 1.6
XPNPEP3Q9NQH7 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
XPNPEP3Q9NQH7 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
XPNPEP3Q9NQH7 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
XPNPEP3Q9NQH7 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
XPNPEP3Q9NQH7 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
XPNPEP3Q9NQH7 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
XPNPEP3Q9NQH7 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
XPNPEP3Q9NQH7 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
XPNPEP3Q9NQH7 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
XPNPEP3Q9NQH7 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
XPNPEP3Q9NQH7 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
XPNPEP3Q9NQH7 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
XPNPEP3Q9NQH7 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
XPNPEP3Q9NQH7 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
XPNPEP3Q9NQH7 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
XPNPEP3Q9NQH7 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
XPNPEP3Q9NQH7 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
XPNPEP3Q9NQH7 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
XPNPEP3Q9NQH7 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
XPNPEP3Q9NQH7 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
XPNPEP3Q9NQH7 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
XPNPEP3Q9NQH7 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
XPNPEP3Q9NQH7 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
XPNPEP3Q9NQH7 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
XPNPEP3Q9NQH7 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
XPNPEP3Q9NQH7 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
XPNPEP3Q9NQH7 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC25.04■■□□□ 1.6
XPNPEP3Q9NQH7 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
XPNPEP3Q9NQH7 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
XPNPEP3Q9NQH7 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
XPNPEP3Q9NQH7 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
XPNPEP3Q9NQH7 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
XPNPEP3Q9NQH7 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
XPNPEP3Q9NQH7 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
XPNPEP3Q9NQH7 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms