Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ35

NRIP3, Nuclear receptor-interacting protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRIP3Q9NQ35 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
NRIP3Q9NQ35 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NRIP3Q9NQ35 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NRIP3Q9NQ35 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NRIP3Q9NQ35 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
NRIP3Q9NQ35 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
NRIP3Q9NQ35 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
NRIP3Q9NQ35 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
NRIP3Q9NQ35 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NRIP3Q9NQ35 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
NRIP3Q9NQ35 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NRIP3Q9NQ35 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
NRIP3Q9NQ35 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NRIP3Q9NQ35 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NRIP3Q9NQ35 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
NRIP3Q9NQ35 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
NRIP3Q9NQ35 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
NRIP3Q9NQ35 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
NRIP3Q9NQ35 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
NRIP3Q9NQ35 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
NRIP3Q9NQ35 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
NRIP3Q9NQ35 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
NRIP3Q9NQ35 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
NRIP3Q9NQ35 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
NRIP3Q9NQ35 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
NRIP3Q9NQ35 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
NRIP3Q9NQ35 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
NRIP3Q9NQ35 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
NRIP3Q9NQ35 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
NRIP3Q9NQ35 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
NRIP3Q9NQ35 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
NRIP3Q9NQ35 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
NRIP3Q9NQ35 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
NRIP3Q9NQ35 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
NRIP3Q9NQ35 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
NRIP3Q9NQ35 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
NRIP3Q9NQ35 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
NRIP3Q9NQ35 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
NRIP3Q9NQ35 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
NRIP3Q9NQ35 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
NRIP3Q9NQ35 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
NRIP3Q9NQ35 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC20.04■□□□□ 0.8
NRIP3Q9NQ35 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
NRIP3Q9NQ35 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
NRIP3Q9NQ35 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
NRIP3Q9NQ35 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
NRIP3Q9NQ35 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
NRIP3Q9NQ35 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
NRIP3Q9NQ35 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
NRIP3Q9NQ35 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
NRIP3Q9NQ35 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
NRIP3Q9NQ35 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
NRIP3Q9NQ35 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
NRIP3Q9NQ35 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
NRIP3Q9NQ35 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
NRIP3Q9NQ35 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
NRIP3Q9NQ35 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
NRIP3Q9NQ35 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
NRIP3Q9NQ35 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
NRIP3Q9NQ35 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
NRIP3Q9NQ35 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
NRIP3Q9NQ35 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
NRIP3Q9NQ35 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
NRIP3Q9NQ35 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
NRIP3Q9NQ35 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
NRIP3Q9NQ35 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
NRIP3Q9NQ35 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
NRIP3Q9NQ35 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
NRIP3Q9NQ35 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
NRIP3Q9NQ35 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
NRIP3Q9NQ35 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
NRIP3Q9NQ35 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
NRIP3Q9NQ35 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
NRIP3Q9NQ35 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
NRIP3Q9NQ35 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
NRIP3Q9NQ35 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
NRIP3Q9NQ35 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
NRIP3Q9NQ35 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
NRIP3Q9NQ35 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
NRIP3Q9NQ35 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
NRIP3Q9NQ35 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
NRIP3Q9NQ35 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
NRIP3Q9NQ35 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
NRIP3Q9NQ35 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
NRIP3Q9NQ35 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
NRIP3Q9NQ35 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
NRIP3Q9NQ35 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
NRIP3Q9NQ35 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
NRIP3Q9NQ35 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
NRIP3Q9NQ35 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
NRIP3Q9NQ35 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
NRIP3Q9NQ35 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
NRIP3Q9NQ35 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
NRIP3Q9NQ35 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
NRIP3Q9NQ35 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
NRIP3Q9NQ35 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
NRIP3Q9NQ35 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
NRIP3Q9NQ35 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
NRIP3Q9NQ35 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
NRIP3Q9NQ35 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms