Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP99

TREM1, Triggering receptor expressed on myeloid cells 1, humanhuman

Predictions only

Length 234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TREM1Q9NP99 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TREM1Q9NP99 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TREM1Q9NP99 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TREM1Q9NP99 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TREM1Q9NP99 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TREM1Q9NP99 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TREM1Q9NP99 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TREM1Q9NP99 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TREM1Q9NP99 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TREM1Q9NP99 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TREM1Q9NP99 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TREM1Q9NP99 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
TREM1Q9NP99 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TREM1Q9NP99 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TREM1Q9NP99 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TREM1Q9NP99 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TREM1Q9NP99 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TREM1Q9NP99 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TREM1Q9NP99 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TREM1Q9NP99 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TREM1Q9NP99 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TREM1Q9NP99 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TREM1Q9NP99 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TREM1Q9NP99 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TREM1Q9NP99 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TREM1Q9NP99 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TREM1Q9NP99 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TREM1Q9NP99 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TREM1Q9NP99 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TREM1Q9NP99 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TREM1Q9NP99 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TREM1Q9NP99 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TREM1Q9NP99 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TREM1Q9NP99 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TREM1Q9NP99 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TREM1Q9NP99 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TREM1Q9NP99 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TREM1Q9NP99 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TREM1Q9NP99 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TREM1Q9NP99 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TREM1Q9NP99 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TREM1Q9NP99 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TREM1Q9NP99 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TREM1Q9NP99 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TREM1Q9NP99 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
TREM1Q9NP99 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TREM1Q9NP99 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TREM1Q9NP99 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TREM1Q9NP99 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TREM1Q9NP99 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TREM1Q9NP99 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TREM1Q9NP99 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TREM1Q9NP99 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TREM1Q9NP99 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TREM1Q9NP99 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TREM1Q9NP99 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TREM1Q9NP99 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TREM1Q9NP99 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TREM1Q9NP99 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TREM1Q9NP99 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TREM1Q9NP99 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TREM1Q9NP99 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TREM1Q9NP99 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TREM1Q9NP99 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TREM1Q9NP99 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
TREM1Q9NP99 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TREM1Q9NP99 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TREM1Q9NP99 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TREM1Q9NP99 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TREM1Q9NP99 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TREM1Q9NP99 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TREM1Q9NP99 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TREM1Q9NP99 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TREM1Q9NP99 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TREM1Q9NP99 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TREM1Q9NP99 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TREM1Q9NP99 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TREM1Q9NP99 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TREM1Q9NP99 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TREM1Q9NP99 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TREM1Q9NP99 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TREM1Q9NP99 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TREM1Q9NP99 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TREM1Q9NP99 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TREM1Q9NP99 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
TREM1Q9NP99 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TREM1Q9NP99 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TREM1Q9NP99 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TREM1Q9NP99 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TREM1Q9NP99 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TREM1Q9NP99 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TREM1Q9NP99 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TREM1Q9NP99 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TREM1Q9NP99 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TREM1Q9NP99 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TREM1Q9NP99 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TREM1Q9NP99 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TREM1Q9NP99 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TREM1Q9NP99 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TREM1Q9NP99 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.6 ms