Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP85

NPHS2, Podocin, humanhuman

Predictions only

Length 383 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPHS2Q9NP85 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NPHS2Q9NP85 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NPHS2Q9NP85 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NPHS2Q9NP85 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NPHS2Q9NP85 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NPHS2Q9NP85 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NPHS2Q9NP85 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NPHS2Q9NP85 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NPHS2Q9NP85 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NPHS2Q9NP85 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NPHS2Q9NP85 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NPHS2Q9NP85 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NPHS2Q9NP85 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NPHS2Q9NP85 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NPHS2Q9NP85 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NPHS2Q9NP85 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NPHS2Q9NP85 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NPHS2Q9NP85 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NPHS2Q9NP85 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NPHS2Q9NP85 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
NPHS2Q9NP85 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NPHS2Q9NP85 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NPHS2Q9NP85 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NPHS2Q9NP85 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC22.02■■□□□ 1.11
NPHS2Q9NP85 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NPHS2Q9NP85 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NPHS2Q9NP85 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NPHS2Q9NP85 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
NPHS2Q9NP85 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NPHS2Q9NP85 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NPHS2Q9NP85 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NPHS2Q9NP85 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
NPHS2Q9NP85 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
NPHS2Q9NP85 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NPHS2Q9NP85 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
NPHS2Q9NP85 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NPHS2Q9NP85 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NPHS2Q9NP85 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
NPHS2Q9NP85 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC22■■□□□ 1.11
NPHS2Q9NP85 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NPHS2Q9NP85 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NPHS2Q9NP85 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC22■■□□□ 1.11
NPHS2Q9NP85 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NPHS2Q9NP85 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NPHS2Q9NP85 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NPHS2Q9NP85 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NPHS2Q9NP85 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NPHS2Q9NP85 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NPHS2Q9NP85 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NPHS2Q9NP85 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NPHS2Q9NP85 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NPHS2Q9NP85 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NPHS2Q9NP85 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NPHS2Q9NP85 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NPHS2Q9NP85 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NPHS2Q9NP85 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NPHS2Q9NP85 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NPHS2Q9NP85 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NPHS2Q9NP85 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NPHS2Q9NP85 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NPHS2Q9NP85 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NPHS2Q9NP85 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NPHS2Q9NP85 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NPHS2Q9NP85 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NPHS2Q9NP85 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NPHS2Q9NP85 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NPHS2Q9NP85 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NPHS2Q9NP85 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NPHS2Q9NP85 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NPHS2Q9NP85 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NPHS2Q9NP85 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NPHS2Q9NP85 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NPHS2Q9NP85 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NPHS2Q9NP85 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NPHS2Q9NP85 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NPHS2Q9NP85 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NPHS2Q9NP85 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NPHS2Q9NP85 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
NPHS2Q9NP85 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NPHS2Q9NP85 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NPHS2Q9NP85 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
NPHS2Q9NP85 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NPHS2Q9NP85 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NPHS2Q9NP85 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NPHS2Q9NP85 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
NPHS2Q9NP85 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
NPHS2Q9NP85 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NPHS2Q9NP85 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NPHS2Q9NP85 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
NPHS2Q9NP85 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
NPHS2Q9NP85 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NPHS2Q9NP85 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
NPHS2Q9NP85 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NPHS2Q9NP85 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
NPHS2Q9NP85 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NPHS2Q9NP85 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NPHS2Q9NP85 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NPHS2Q9NP85 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
NPHS2Q9NP85 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NPHS2Q9NP85 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms