Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCM2

PLXNA4, Plexin-A4, humanhuman

Predictions only

Length 1,894 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLXNA4Q9HCM2 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PLXNA4Q9HCM2 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PLXNA4Q9HCM2 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
PLXNA4Q9HCM2 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
PLXNA4Q9HCM2 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PLXNA4Q9HCM2 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PLXNA4Q9HCM2 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PLXNA4Q9HCM2 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PLXNA4Q9HCM2 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PLXNA4Q9HCM2 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PLXNA4Q9HCM2 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PLXNA4Q9HCM2 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PLXNA4Q9HCM2 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PLXNA4Q9HCM2 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PLXNA4Q9HCM2 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PLXNA4Q9HCM2 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
PLXNA4Q9HCM2 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PLXNA4Q9HCM2 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PLXNA4Q9HCM2 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PLXNA4Q9HCM2 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
PLXNA4Q9HCM2 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
PLXNA4Q9HCM2 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PLXNA4Q9HCM2 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PLXNA4Q9HCM2 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PLXNA4Q9HCM2 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PLXNA4Q9HCM2 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PLXNA4Q9HCM2 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PLXNA4Q9HCM2 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PLXNA4Q9HCM2 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PLXNA4Q9HCM2 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PLXNA4Q9HCM2 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PLXNA4Q9HCM2 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PLXNA4Q9HCM2 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PLXNA4Q9HCM2 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PLXNA4Q9HCM2 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PLXNA4Q9HCM2 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PLXNA4Q9HCM2 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PLXNA4Q9HCM2 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PLXNA4Q9HCM2 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PLXNA4Q9HCM2 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PLXNA4Q9HCM2 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PLXNA4Q9HCM2 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PLXNA4Q9HCM2 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PLXNA4Q9HCM2 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PLXNA4Q9HCM2 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PLXNA4Q9HCM2 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PLXNA4Q9HCM2 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PLXNA4Q9HCM2 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PLXNA4Q9HCM2 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PLXNA4Q9HCM2 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PLXNA4Q9HCM2 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PLXNA4Q9HCM2 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PLXNA4Q9HCM2 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PLXNA4Q9HCM2 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PLXNA4Q9HCM2 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PLXNA4Q9HCM2 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PLXNA4Q9HCM2 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PLXNA4Q9HCM2 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PLXNA4Q9HCM2 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PLXNA4Q9HCM2 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PLXNA4Q9HCM2 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PLXNA4Q9HCM2 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PLXNA4Q9HCM2 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PLXNA4Q9HCM2 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PLXNA4Q9HCM2 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PLXNA4Q9HCM2 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PLXNA4Q9HCM2 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PLXNA4Q9HCM2 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PLXNA4Q9HCM2 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
PLXNA4Q9HCM2 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC23.83■■□□□ 1.4
PLXNA4Q9HCM2 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
PLXNA4Q9HCM2 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
PLXNA4Q9HCM2 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PLXNA4Q9HCM2 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PLXNA4Q9HCM2 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PLXNA4Q9HCM2 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PLXNA4Q9HCM2 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PLXNA4Q9HCM2 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PLXNA4Q9HCM2 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PLXNA4Q9HCM2 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PLXNA4Q9HCM2 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PLXNA4Q9HCM2 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
PLXNA4Q9HCM2 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PLXNA4Q9HCM2 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PLXNA4Q9HCM2 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PLXNA4Q9HCM2 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PLXNA4Q9HCM2 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PLXNA4Q9HCM2 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PLXNA4Q9HCM2 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PLXNA4Q9HCM2 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PLXNA4Q9HCM2 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PLXNA4Q9HCM2 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PLXNA4Q9HCM2 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PLXNA4Q9HCM2 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
PLXNA4Q9HCM2 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PLXNA4Q9HCM2 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PLXNA4Q9HCM2 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PLXNA4Q9HCM2 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PLXNA4Q9HCM2 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PLXNA4Q9HCM2 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms