Protein–RNA interactions for Protein: Q9HC58

SLC24A3, Sodium/potassium/calcium exchanger 3, humanhuman

Predictions only

Length 644 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC24A3Q9HC58 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
SLC24A3Q9HC58 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLC24A3Q9HC58 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLC24A3Q9HC58 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
SLC24A3Q9HC58 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLC24A3Q9HC58 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLC24A3Q9HC58 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
SLC24A3Q9HC58 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
SLC24A3Q9HC58 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLC24A3Q9HC58 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLC24A3Q9HC58 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLC24A3Q9HC58 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLC24A3Q9HC58 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLC24A3Q9HC58 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLC24A3Q9HC58 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLC24A3Q9HC58 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLC24A3Q9HC58 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLC24A3Q9HC58 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLC24A3Q9HC58 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLC24A3Q9HC58 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLC24A3Q9HC58 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
SLC24A3Q9HC58 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLC24A3Q9HC58 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLC24A3Q9HC58 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLC24A3Q9HC58 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLC24A3Q9HC58 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLC24A3Q9HC58 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLC24A3Q9HC58 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLC24A3Q9HC58 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLC24A3Q9HC58 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLC24A3Q9HC58 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
SLC24A3Q9HC58 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLC24A3Q9HC58 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
SLC24A3Q9HC58 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLC24A3Q9HC58 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLC24A3Q9HC58 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLC24A3Q9HC58 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLC24A3Q9HC58 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLC24A3Q9HC58 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLC24A3Q9HC58 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.03
SLC24A3Q9HC58 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
SLC24A3Q9HC58 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLC24A3Q9HC58 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLC24A3Q9HC58 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLC24A3Q9HC58 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLC24A3Q9HC58 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLC24A3Q9HC58 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLC24A3Q9HC58 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLC24A3Q9HC58 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLC24A3Q9HC58 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLC24A3Q9HC58 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLC24A3Q9HC58 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLC24A3Q9HC58 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLC24A3Q9HC58 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLC24A3Q9HC58 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC24A3Q9HC58 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC24A3Q9HC58 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC24A3Q9HC58 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC24A3Q9HC58 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC24A3Q9HC58 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC24A3Q9HC58 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC24A3Q9HC58 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC24A3Q9HC58 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC24A3Q9HC58 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC24A3Q9HC58 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC24A3Q9HC58 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC24A3Q9HC58 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC24A3Q9HC58 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC24A3Q9HC58 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC24A3Q9HC58 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC24A3Q9HC58 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC24A3Q9HC58 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC24A3Q9HC58 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC24A3Q9HC58 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC24A3Q9HC58 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC24A3Q9HC58 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC24A3Q9HC58 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC24A3Q9HC58 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC24A3Q9HC58 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC24A3Q9HC58 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC24A3Q9HC58 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC24A3Q9HC58 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC24A3Q9HC58 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC24A3Q9HC58 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC24A3Q9HC58 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC24A3Q9HC58 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC24A3Q9HC58 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC24A3Q9HC58 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC24A3Q9HC58 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC24A3Q9HC58 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC24A3Q9HC58 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC24A3Q9HC58 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC24A3Q9HC58 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC24A3Q9HC58 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC24A3Q9HC58 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC24A3Q9HC58 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC24A3Q9HC58 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC24A3Q9HC58 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC24A3Q9HC58 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC24A3Q9HC58 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.9 ms